The Xpert MTB / RIF-test integrerar prov sanering, handsfree, ombord prov bearbetning, och ultra-känslig hemi-kapslad PCR för samtidig detektion av<em> Mycobacterium tuberculosis</em> Och rifampicin motstånd, antingen i expektorerat sputum eller koncentrerade sediment sputum, i cirka två timmar. Testning är standardiserad och kräver endast måttlig laborationer infrastruktur och utbildning.
Tuberkulos (TB) på grund av Mycobacterium tuberculosis (MTB) är fortfarande en viktig folkhälsofråga: infektionen drabbar upp till en tredjedel av världens befolkning 1, och nästan två miljoner människor dödas av TB varje år 2 Allmän tillgång till hög kvalitet. är patient-centrerad behandling för alla tbc-patienter understryks av WHO: s Stop TB strategi. snabb detektion av MTB i luftvägarna prover och läkemedelsbehandling bygger på tillförlitliga tester läkemedelsresistens Resultat 3 är en förutsättning för ett framgångsrikt genomförande av denna strategi. I många delar av världen bygger TB diagnosen fortfarande på okänsliga, dåligt standardiserade metoder sputum mikroskopi. Ineffektiv TB upptäckt och uppkomsten och överföring av läkemedelsresistenta MTB stammar allt äventyrar globala verksamhet tbc kontroll. 2
Effektiv diagnos av pulmonell tuberkulos kräver tillgänglighet – på en global skala – av standardized, lätt att använda och robust diagnostiska verktyg som gör det möjligt att direkt detektion av både MTB komplexa och resistens mot viktiga antibiotika, t.ex. rifampicin (RIF). Det senare resultatet kan tjäna som markör för multiresistent MTB (MDR TB) och har rapporterats i> 95% av de MDR-TB-isolat. 4, 5 Den snabba tillgängligheten av tillförlitliga testresultat är sannolikt att direkt översätta till ljud behandling av patienten beslut som i slutändan kommer att bota den enskilda patienten och bryta den kedja av TB överföring i samhället. 2
Cepheid s (Sunnyvale, CA, USA) Xpert MTB / RIF analys 6, 7 uppfyller de krav som beskrivs ovan på ett anmärkningsvärt sätt. Det är en nukleinsyra-syror förstärkning test för 1) upptäckt av MTB komplex DNA i sputum eller koncentrerade sediment sputum, och 2) påvisande av RIF resistens-associerade mutationer i rpoB genen 8 Den är designad för användning med Cepheid s GeneXpert Dx. systemet: epå integrerar och automatiserar provbearbetning, nukleinsyraamplifiering, och detektion av målsekvenserna med realtids-PCR och omvänt transkriptas PCR. Systemet består av ett instrument, dator, streckkodsläsare och förinstallerad programvara för tester och visa resultat. 9 Det sysselsätter engångsförpackningar Xpert MTB / RIF patroner som håller PCR reagenser och värd för PCR-processen. Eftersom patronerna är sluten, är korskontaminering mellan proven elimineras. 6 Nuvarande Nukleinsyraamplifiering metoder som används för att detektera MTB är komplexa, arbetsintensiva, och tekniskt krävande. The Xpert MTB / RIF analys har potential att ge standardiserade, känslig och mycket specifika diagnostiska tester för både tuberkulos och resistens till allmän-access point-of-vårdmiljöer 3, förutsatt att de kommer att ha råd med det. För att underlätta tillgången, har Stiftelsen för innovativa nya diagnosmetoder (FIND) som förhandlades fram betydandedande prissänkningar. Aktuella FIND-förhandlade priser, tillsammans med listan över länder som är berättigade till de rabatter, finns tillgängliga på webben. 10
The Xpert MTB / RIF analys integrerar prov sanering, handsfree, ombord prov bearbetning, och ultra-känslig hemi-kapslad PCR för samtidig detektion av MTB-och RIF motstånd, antingen i expektorerat sputum eller koncentrerade sediment, i ett enda , lätt att använda systemet. Analysens analytiska detektionsgränsen befanns vara 131 CFU / ml upphostning. Den log-linjära relationen mellan Ct-värden och antalet MTB-celler presenterar stämmer från 10 februari – 10 juli CFU / ml upphostning 6. Som kliniskt relevanta MTB koncentrationer faller alla inom det linjära intervallet av analysen ger analysen semi-kvantitativa beräkningar av den bakteriella belastningen. 7 Analysen kräver endast måttlig laborationer infrastruktur och utbildning. Detektionsgränsen ligger minst två storleksordningar lägre än för konventionell mikroskopi. 6 Specificitet är utmärkt. Vidare, samtidigt påvisande av RIF-resistant MTB är en betydande fördel vid fastställandet av point-of-care test i en tid av läkemedelsresistenta TB. 3
Hittills endast begränsade publicerade data på analysen prestanda för att diagnostisera lung tbc i kliniska inställningar finns 12, 13. The Xpert MTB / RIF analys övergripande kliniska känslighet för att upptäcka MTB i sputum hos patienter med misstänkt pulmonell tbc var 97,6% jämfört med kulturen som referens. Det var resultatet av en prospektiv multicenterstudie som omfattade fem undersökningsområden (Lima, Peru, Baku, Azerbajdzjan, Cape Town & Durban, Sydafrika, Mumbai, Indien) och totalt 1462 patienter. Den totala pre-test sannolikheten för kultur bekräftade-TB i studiepopulationen var 50,7%. Känsligheten var 99,8% för smear-och kultur-positiva fall och 90,2% för smear-negativa, kultur-positiva fall. Bland HIV-positiva patienter med pulmonell tuberkulos, var känslighet MTB / RIF-test 93,9%, jämfört med 98,4% i. HIV-negativa patienter 12 I en miljö med låg TB prevalens, var övergripande avtal för att upptäcka MTB 89% jämfört med kultur, känslighet var 98% för smear-positiva och 72% för smear-negativa prover respektive och specificitet var utmärkt. 13 Det fanns ingen signifikant skillnad i känslighet mellan tester på obehandlat sputum och de på koncentrerade sediment. 12 I samma studie upptäckte MTB / RIF testet korrekt RIF motstånd i 209 av 211 patienter (99,1% känslighet) och i alla 506 patienter med RIF mottaglighet (100% specificitet), då sekvensering resultaten beaktats. 12 Författarna fann att prestanda för både fallet upptäckt, och diskriminering av RIF motstånd var liknande i olika områden, vilket tyder på att resultaten sannolikt kommer att vara allmänt tillämpliga. 12 Dessutom koncentrerade sediment i luftvägarna andra exemplar än sputum, såsom bronko-alveolära sköljning och bronkernal sekret, testades med jämförbar känslighet och specificitet. 13 Uppgifter om analysens prestanda när testar extra-pulmonell tuberkulos växer fram 15.
Global TB-kontroll i akut behov av effektiva verktyg som tillåter snabb diagnos av nya tbc fall och detektion av RIF-resistent MTB i Universal-access point-of-care inställningar. 3 Aktuella Nukleinsyraamplifiering metoder som används för att detektera MTB är komplexa, arbetsintensiva, och tekniskt krävande. The Xpert MTB / RIF analys har potential att ge standardiserade, känslig och mycket specifika diagnostiska tester för både tuberkulos och resistens till dessa inställningar, förutsatt att de kommer att ha råd med det. För att underlätta tillgången, har Stiftelsen för innovativa nya diagnosmetoder (hitta) som förhandlades fram betydande prissänkningar för Xpert MTB / RIF test. Aktuella FIND-förhandlade priser, tillsammans med listan över länder som är berättigade till de rabatter, finns tillgängliga på webben. 10 </sup>
The authors have nothing to disclose.
Författarna erkänner WJ Looney för noggrant granska manuskriptet.
Reagent/Equipment | Company | Catalogue number |
Xpert MTB/RIF test | Cepheid | GXMTB/RIF-10 |
Transfer pipettes | Sarstedt | 86.1172.001 |
Conical tubes, 15 ml, 120 x 17 mm, PS | Sarstedt | 62.553.542 |