Summary

Lensfree On-chip tomografiske Microscopy Under anvendelse af Multi-vinkel belysning og Pixel Super-resolution

Published: August 16, 2012
doi:

Summary

Lensfree optisk tomografi er en tredimensional mikroskopi teknik, som giver en rumlig opløsning på under 1 um x <1 um x <3 um x, y og z dimensioner henholdsvis over et stort billeddannelse-volumen fra 15 til 100 mm<sup> 3</sup>, Som kan være særligt nyttige til integration med lab-on-en-chip platforme.

Abstract

Tomografisk scanning har været et almindeligt anvendte værktøj i medicin som kan tilvejebringe tredimensionale (3D) strukturel information om genstande af forskellig størrelse skalaer. I mikrometer og millimeter skalaer, finde optisk mikroskopi modaliteter stigende brug på grund af ikke-ioniserende karakter af synligt lys, og tilgængeligheden af ​​en bred vifte af belysning kilder (såsom lasere og lysemitterende-dioder) og påvisning elementer (såsom stort format CCD og CMOS-detektor-arrays). Blandt de nyligt udviklede optiske tomografiske mikroskopi nærmere, kan man inkludere optisk kohærens tomografi, optisk diffraktion tomografi, optisk projektion tomografi og lys-ark mikroskopi. 1-6 Disse platforme giver i snit billeddannelse af celler, mikroorganismer og model dyr, såsom C. elegans, zebrafisk og musefostre.

Eksisterende 3D optiske kameraer har generelt forholdsvis klodsede og kompleks arkitektur, hvilket begrænser the tilgængeligheden af ​​disse udstyr til avancerede laboratorier, og hæmmer deres integration med lab-on-a-chip platforme og mikrofluid chips. At give et alternativ tomografisk mikroskop, vi for nylig udviklet lensfree optisk tomografi (LOT) som en high-throughput, kompakt og omkostningseffektiv optisk tomografi modalitet. 7 LOT udsmid brugen af linser og voluminøse optiske komponenter, og i stedet bygger på multi-vinkel belysning og digital beregning for at opnå dybde løst billeder af mikro-objekter over en stor billedbehandling volumen. Meget kan billedet biologisk prøve med en rumlig opløsning på under 1 um x <1 um x <3 um i x, y og z dimensioner, henholdsvis over et stort billeddannelse mængde fra 15 til 100 mm3, og kan være særligt nyttige til lab-on-a-chip platforme.

Protocol

1. Imaging Setup LOT kan samles i et kompakt og let field-bærbar arkitektur 8, og alternativt som en optofluidic mikroskop med sektionsopdelt billeddannelse evne. 9 i denne rapport, men vi vil beskrive den grundlæggende billedbehandling opsætning af en bench-top implementering mod tomografi af statisk prøver. Belysning Modul: i Lot, kan delvist sammenhængende lyskilder såsom lysemitterende-dioder (LED) anvendes. For eksperimentel fleksi…

Discussion

Det er vigtigt at understrege, at den unikke geometri lensfree on-chip holografisk mikroskopi er den kritiske enabler for at opnå pixel super-opløsning og tomografisk billeddannelse. Da de optagede billeder ikke antages at være projektion billeder som i usammenhængende kontakt billedbehandling nærmer sig 12, men projektion hologrammer og diffraktion af det transmitterede lys, indtil den rammer detektoren kan digitalt korrigeres ved holografisk genopbygning. Derfor kan variationer i prøve-til-se…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Materials

Name Compay Catalog # Comment
Linear X-Y stages Newport Corp. MFA-PP Miniature Linear Stage
Motorized rotation stage Thorlabs PRM1Z8 Motorized Precision Rotation Mount
Multimode optical fiber Thorlabs AFS105/125Y Multimode Fiber
Light source Newport Corp. 6255 Ozone-free Xenon Lamp
Monochromator Newport Corp. 74100 Cornerstone 260 1/4 m Monochromator
CMOS sensor array Aptina Inc. MT9P031STC 5 Megapixels CMOS Sensor
C. elegans sample Carolina Biosupply 173500 Wild-type C. elegans
Levamisole Sigma Aldrich L9756-5G Tetramisole hydrochloride

References

  1. Schmitt, J. M. Optical coherence tomography (OCT): a review, J. Sel. Top. Quant. Elect. 5, 1205-1215 (1999).
  2. Keller, P. J., Schmidt, A. D., Wittbrodt, J., Stelzer, E. H. K. Reconstruction of zebrafish early embryonic development by scanned light sheet microscopy. Science. 322, 1065-1069 (2008).
  3. Sharpe, J., Ahlgren, U., Perry, P., Hill, B., Ross, A., Hecksher-Sørensen, J., Baldock, R., Davidson, D. Optical Projection Tomography as a Tool for 3D Microscopy and Gene Expression Studies. Science. 296, 541-545 (2002).
  4. Sung, Y., Choi, W., Fang-Yen, C., Badizadegan, K., Dasari, R. R., Feld, M. S. Optical diffraction tomography for high resolution live cell imaging. Opt. Exp. 17, 266-277 (2009).
  5. Debailleul, M., Simon, B., Georges, V., Haeberle, O., Lauer, V. Holographic microscopy and diffractive microtomography of transparent samples. Meas. Sci. Technol. 19, 074009 (2008).
  6. Charrière, F., Pavillon, N., Colomb, T., Depeursinge, C., Heger, T. J., Mitchell, E. A. D., Marquet, P., Rappaz, B. Living specimen tomography by digital holographic microscopy: Morphometry of testate amoeba. Opt. Exp. 14, 7005-7013 (2006).
  7. Isikman, S. O., Bishara, W., Mavandadi, S., Yu, S. W., Feng, S., Lau, R., Ozcan, A. Lens-free optical tomographic microscope with a large imaging volume on a chip. Proc. Nat. Acad. Sci. 108, 7296-7301 (2011).
  8. Isikman, S. O., Bishara, W., Sikora, U., Yaglidere, O., Yeah, J., Ozcan, A. Field-portable Lensfree Tomographic Microscope. Lab Chip. 11, 2222-2230 (2011).
  9. Isikman, S. O., Bishara, W., Zhu, H., Ozcan, A. Optofluidic tomography on a chip. App. Phys. Lett. 98, 161109 (2011).
  10. Bishara, W., Su, T. W., Coskun, A., Ozcan, A. Lensfree on-chip microscopy over a wide field-of-view using pixel super-resolution. Opt. Exp. 18, 11181-11191 (2010).
  11. Messaoudi, C., Boudier, T., Sorzano, C. O. S., Marco, S. TomoJ: tomography software for three-dimensional reconstruction in transmission electron microscopy. BMC Bioinformatics. 8, 288 (2007).
  12. Heng, X., Erickson, D., Baugh, L. R., Yaqoob, Z., Sternberg, P. W., Psaltis, D., Yang, C. Optofluidic Microscopy: A Method for Implementing High Resolution Optical Microscope On A Chip. Lab on a Chip. 6, 1274-1276 (2006).

Play Video

Cite This Article
Isikman, S. O., Bishara, W., Ozcan, A. Lensfree On-chip Tomographic Microscopy Employing Multi-angle Illumination and Pixel Super-resolution. J. Vis. Exp. (66), e4161, doi:10.3791/4161 (2012).

View Video