November 2012: Den här månaden i JUPITER

Summary

I det här numret, Oestreicher<em> Et al.</em> Visa oss hur man isolera magnetotactic bakterier från sötvatten prover och koncentrera bakterierna i ena änden av ett glas kapillär. De magnetotactic bakterier kan sedan visualiseras genom ljus och transmissionselektronmikroskopi, och användas för olika andra analyser.

Abstract

I det här numret, Oestreicher et al. Visar oss hur att isolera magnetotactic bakterier från sötvatten prover och koncentrera bakterierna i ena änden av ett glas kapillär. De magnetotactic bakterier kan sedan visualiseras genom ljus och transmissionselektronmikroskopi, och användas för olika andra analyser.

Även i November 2012 frågan Boland et al. Visa hur man programmera fibroblaster i inducerade pluripotenta stamceller (iPSCs), och hur man isolerar IPSC linjer för injicering i tetraploida blastocyster, vilket framgår tidigare i JUPITER . Medan Munpipettering rekommenderas i allmänhet inte eftersom det kan få negativa effekter, kräver detta protokoll tekniken, utförs noggrant, för att manipulera embryon. Detta är en av de sällsynta tillfällen när det är faktiskt OK att mun pipett i labbet. Om de inducerade cellerna enre fullt pluripotenta kan de resultera i fullgångna möss härrör helt från iPSCs.

I JUPITER neurovetenskap, Heermann och Krieglstein visar en metod för att visualisera Schwann celler utveckling längs växande axoner. För att göra detta, våra författare kultur livmoderhalscancer ganglierna explantat PÅ kollagenmatriser och behandla explantaten med nervtillväxtfaktor eller andra ämnen. De kollagengeler kan sedan visualiseras med time-lapse avbildning med fluorescens eller ljusa fält mikroskopi, migrera längs axoner mot periferin.

Även i JUPITER neurovetenskap, Hoffmann et al. Sätta små hörlurar på sångfåglar att studera hur de använder auditiv återkoppling att anpassa sin sång. Författarna visar hur man konstruerar hörlurarna och fäst dem på fågelns huvud, sedan genom att justera den akustiska signalen kan de studera beräkningsmässiga och neurofysiologiska grunden för sång lärande i fåglar.

I JUPITER Klinisk& Translationell medicin, Iyengar et al. Använder en zebrafisk tumör modell för att studera gener som kan ändra patogenesen av melanom. Detta görs genom att först skapa transgena zebrafisk som uttrycker en gen av intresse. Olika analyser kan sedan utföras för att studera hur olika gener påverkar melanom, inklusive insättande, invasion och transplantability.

I JUPITER Bioengineering, Martin et al. Visar en glidande analys för att mäta böj styvheten av biopolymerer (t.ex. mikrotubuli). Genom att fästa motorproteiner till ett objektglas, och lägga fluorescensmärkta mikrotubuli, kan våra författare analysera dynamiken i cytoskelettala polymerer.

Denna förhandsvisning sammanfattar några anmärkningsvärda video-artiklar i November 2012 frågan av Jove. Stanna till hela november månad för att kolla in fullängds versioner av dessa artiklar och många fler.

Protocol

Generering av möss härledda från inducerade pluripotenta stamceller Michael J. Boland 1, Jennifer L. Hazen 1, Kristopher L. Nazor 1, Alberto R. Rodriguez 2, Greg Martin 2, Sergej Kuprijanov 2, Kristin K. Baldwin 1 1 Dorris Centrum för neurovetenskap och Institutionen för cellbiologi, The Scripps Research Institute, 2 mus Genetics Core Facility, The Scripps Research Institute Generera inducerade pluripotenta stamceller (IPSC) linjer producerar rader av olika utvecklingspotential även när de passerar standardtester för pluripotens. Här beskriver vi ett protokoll för att producera möss som helt och hållet från iPSCs, som definierar de IPSC linjer som besitter fullt pluripotens 1. Analysera MurinSchwann cell utveckling längs Växande Axoner Stephan Heermann 1, 2, Kerstin Krieglstein 1, 3 1 Institutionen för molekylär embryologi, Institutet för anatomi och cellbiologi vid universitetet i Freiburg, 2 Institutionen för Neuroanatomi, universitetet i Heidelberg, 3 Frias, universitetet i Freiburg Här beskriver vi en Schwann-cell (SC) migration analys i vilken kaster kan utveckla tillsammans sträcker axoner. En lätt, hörlurar system för att manipulera Auditiv feedback i Songbirds Lukas A. Hoffmann 1, 2, Conor W. Kelly 1, 3, David A. Nicholson 1, 2, Samuel J. Sober 1 1 Biologiska institutionen, Emory University, 2 neurovetenskap Graduate Program, Emory University, 3 ProgRAM neurovetenskap och Behavioral Biology, Emory University Vi beskriver konstruktion och montering av miniatyriserade hörlurar lämpade för att ersätta en sångfågel naturliga hörsel feedback med en manipulerad ljudsignal. Online ljudbearbetning hårdvara används för att manipulera låt utgång, införa realtid fel i auditiva återkoppling via hörlurarna, och kör sång motorisk inlärning. Screening för melanom Modifieringar med en Zebrafish Autoktont tumörmodell Sharanya Iyengar 1, Yariv Houvras 2, 3, Craig J. Ceol 1 1 Program i molekylär medicin och Institutionen för Cancer Biology, University of Massachusetts Medical School, 2 avdelningar för kirurgi och medicin, Weill Cornell Medical College, 3 avdelningar för kirurgi och medicin, New York Presbyterian Hospital <p class = "jove_content"> En snabb väg till skärmen för melanom modifierare med en zebrafisk autoktona tumörmodell presenteras. Det drar fördel av miniCoopR vektor som tillåter uttryck av gener kandidat melanom i melanocyterna. En metod för att få melanom överlevnad kurvor, en invasion assay, ett protokoll för antikroppar färgning av skala melanocyter och en melanom transplantation analys beskrivs. Böjstyvhet Mätningar av Biopolymerer Använda Gliding Analyser Douglas S. Martin, Lu Yu, Brian L. Van Hoozen Institutionen för fysik, Lawrence University En metod för att mäta längden persistens eller böjstyvhet av biopolymerer beskrivs. Metoden använder en kinesin driven mikrotubulus Gliding analys för experimentellt bestämma persistens längden av individuella mikrotubuli och är anpassningsbar till aktin-baserade glidande analyser. < / P> Insamling, isolering och anrikning av naturligt förekommande Magnetotactic bakterier från miljön Zachery Oestreicher 1, Steven K. Nedre 1, 2, Wei Lin 3, Brian H. Nedre 2 1 Institutionen för geovetenskaper, The Ohio State University, 2 School of Miljö & naturresurser, Ohio State University, 3 Institutionen för geologi och geofysik, kinesiska vetenskapsakademin Vi demonstrera en metod för att samla magnetotactic bakterier (MTB) som kan tillämpas på naturliga vatten. MTB kan isoleras och anrikas från sedimentprover med en relativt enkel installation som tar fördel av bakteriernas naturliga magnetism. Isolerad MTB kan sedan granskas i detalj med både ljus-och elektronmikroskopi. 8 "> Transnuclear möss med fördefinierade T specificiteter cellreceptorn Mot Toxoplasma gondii erhållits via SCNT Oktay Kirak 1, Eva-Maria Frickel 1, Gijsbert M. Grotenbreg 1, 2, Heikyung Suh 1, Rudolf Jaenisch 1, 3, Hidde L. Ploegh 1, 3 1, Whitehead Institute for Biomedical Research, 2 Institutioner för mikrobiologi och Biological Sciences, National University of Singapore, 3 Biologiska institutionen, Massachusetts Institute of Technology Vi visar här att epigenetisk omprogrammering via somatisk kärnöverföring (SCNT) kan användas som ett verktyg för att generera musmodeller med fördefinierade T-cell receptor (TCR) särdrag. Dessa transnuclear möss uttrycker motsvarande TCR från deras endogena lokus under kontroll av den endogena promotorn.