Summary

Dyrking og Vedlikehold<em> Clostridium difficile</em> I et anaerobt miljø

Published: September 14, 2013
doi:

Summary

Clostridium difficile er en sykdomsfremkallende bakterie som er en streng anaerob og forårsaker antibiotikaassosiert diaré (AAD). Her, fremgangsmåter for isolering, dyrking og opprettholdelse C. difficile vegetative celler og sporer, er beskrevet. Disse teknikkene nødvendig en anaerob kammer, som krever regelmessig vedlikehold for å sikre ryddige forhold for optimal C. difficile dyrking.

Abstract

Clostridium difficile er en Gram-positive, anaerob, sporogenic bakterie som er hovedansvarlig for antibiotikaassosiert diaré (AAD), og er en betydelig nosokomial patogen. C. difficile er notorisk vanskelig å isolere og dyrke og er ekstremt følsomme overfor til og med lave nivåer av oksygen i miljøet. Her, fremgangsmåter for å isolere C. difficile fra fecal prøver og senere dyrking C. difficile for utarbeidelse av glyserol aksjer for langtidslagring presenteres. Teknikker for å forberede og opplisting spore aksjer i laboratoriet for en rekke nedstrøms applikasjoner, inkludert mikroskopi og dyrestudier er også beskrevet. Disse teknikkene gjør det nødvendig et anaerobt kammer, som opprettholder en jevn anaerobt miljø for å sikre riktig forhold for optimal C. difficile vekst. Vi gir protokoller for overføring av materialer inn og ut av kammeret uten at cabruker betydelig oksygen forurensning sammen med forslag til regelmessig vedlikehold er nødvendig for å opprettholde riktig anaerobt miljø for effektiv og konsekvent C. difficile dyrking.

Introduction

Clostridium difficile er en Gram-positiv, sporedannende bakterie som er en obligat anaerob og en potensielt fatal gastrointestinal patogen for mennesker og dyr. I utgangspunktet beskrevet i 1935 som en commensal organisme som finnes i fekal prøver fra nyfødte 1, C. difficile ble senere vist seg å være den utløsende agent for pseudomembranøs kolitt assosiert med antibiotikabehandling to. C. difficile infeksjoner (CDI) er vanligvis innledes med antibiotika behandling som resulterer i avbrudd av den normale colonic flora, noe som skaper en nisje for C. difficile å trives to. C. difficile overføres som et sovende spore via fekal-oral rute og deretter spirer i mage-tarmkanalen, som produserer vegetative celler i stand til å generere en rekke giftstoffer og forårsaker alvorlig sykdom og kolitt 3.. CDI er ofte responderer på konvensjonelle behandlinger og disse iFections blir stadig gjentatt fire. Som et resultat, CDI er ansvarlig for opp til $ 4,8 milliarder kroner i helsekostnader i USA 5-7.

C. difficile er svært følsom for og med lave nivåer av oksygen i miljøet. For C. difficile å vedvare i miljøet og bli effektivt overføres fra vert til vert, er kritisk 8 dannelsen av en metabolsk inaktive spore. Fordi laboratoriet vedlikehold og manipulering av C. difficile krever en kontrollert, anaerobt miljø, er disse teknikker nødvendiggjøre bruk av et anaerobt kammer. Bruk av anaerobe kammer har resultert i økt utvinning og isolering av obligate anaerober 9-11, og har tillatt et antall molekylære teknikker som skal utføres i en anaerob atmosfære.

I tillegg til C. difficile, anaerob kammer bruk og vedlikehold som er beskrevet her er aktuelttil andre obligat anaerobe eksempel andre clostridietypene (f.eks C. perfringens), andre gastrointestinale arter (f.eks Bacteroides arter 12) og periodontale patogener (f.eks Peptostreptococcus arter 13).

Protocol

Merk: C. difficile er en human og animalsk patogen som kan forårsake gastrointestinal sykdom. Forsøk med C. difficile må utføres med egnede forholdsregler for biologisk sikkerhet (BSL-2). En. Anaerob Chamber Bruk og vedlikehold C. difficile er et strengt anaerobe og er ekstremt følsomme overfor selv lave konsentrasjoner av oksygen i atmosfæren. Derfor er en kontrollert, anaerobt miljø som er nødvendig for en vellykket manipulasjon…

Representative Results

Et eksempel på C. difficile dyrket på BHIS og Columbia anaerob saueblodagar materiale kan sees i figur 2. C. difficile danner uregelmessige kolonier som er flat og har en slipt glass utseende som er tydelig på begge medier. Her en erytromycin-sensitive klinisk isolat av C. difficile, 630E 30 er dyrket på BHIS agar, en beriket, ikke-selektivt medium, i 24 timer ved 37 ° C (figur 2 A). Kolonier på Columbia anaerob saueblodagar ser tilsvarende de…

Discussion

Metodene som beskrives her, gir mulighet for enkel og hurtig gjenvinning av C. difficile fra en rekke fekale prøver, inkludert mennesker, mus og hamstere, samt langtidslagring av C. difficile som glyserol eller spore aksjer. C. difficile kan være vanskelig å dyrke organismen, men nøye vedlikehold av et anaerobt miljø, og anvendelse av aseptiske teknikker, kan gi for sterk vekst og redusert forurensning.

Anaerob kamre: Hensyn og Vedlikehold

<p class="jove_cont…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Vi vil gjerne takke Coy Laboratories for vennlig å gi bilder av den anaerobe kammeret. Dette arbeidet ble støttet av National Institutes of Health stipend DK087763 (SMM) og en STEP / HHMI Curriculum Development Fellowship (ANE).

Materials

Name of Reagent/Material Company Catalog Number Comments
Proteose Peptone no. 2 BD 212120
Na2HPO4 Fisher S373
KH2PO4 Fisher BP362
NaCl Fisher S27
MgSO4 (anhydrous) Fisher M65
ᴅ-Fructose Fisher L96
Sodium taurocholate Sigma T4009
ᴅ-cycloserine Sigma C6880
Cefoxitin Fluka C4786
Brain heart infusion medium BD 237300
Proteose Peptone BD 211684
(NH4)2SO4 Sigma A5132
Tris base Fisher BP152
Agar BD 214010
L-cysteine Sigma C7755
BactoPeptone BD 211684
Columbian sheep blood agar Fisher L21928
NaCl Fisher S27
KCl Fisher P217
Glycerol Fisher BP2291
Sterile inoculating loops Fisher 22363596
Sterile swabs Fisher 1495990
Coy Vinyl Anaerobic Chamber and Accessories Coy Laboratory Products, Inc Customer Specified These items are custom ordered per laboratory needs
Materials
TCCFA agar

Proteose peptone no. 2 (Difco) 40 g
Na2HPO4 5 g
KH2PO4 1 g
NaCl 2 g
MgSO4 (anhydrous) 0.1 g
Fructose 6 g
Agar 20 g

Bring to 1 L with deionized water and autoclave at 121 °C for 20 min to sterilize.

After autoclaving, add:
10 ml of 10% (w/v) sodium taurocholate, filter-sterilized (dissolve in water; final concentration, 0.1%)
25 ml of 10 mg/ml ᴅ-cycloserine, filter-sterilized (dissolve in water; final concentration, 250 μg/ml)
1.6 ml of 10 mg/ml cefoxitin, filter-sterilized (dissolve in water; final concentration, 16 μg/ml)

BHIS Medium

Brain heart infusion 37 g
Yeast extract 5 g

For plates, add 15 g agar. Bring to 1 L with deionized water and autoclave at 121 °C for 20 min to sterilize.

Optional (add after autoclaving):

3 ml of 10% (w/v) L-cysteine (dissolve in water; final concentration, 0.03%)
10 ml of 10% (w/v) sodium taurocholate (dissolve in water; final concentration, 0.1%)

SMC Sporulation Medium

BactoPeptone 90 g
Protease peptone 5 g
(NH4)2SO4 1 g
Tris base 1.5 g
Agar 15 g

Bring to 1 L with deionized water and autoclave at 121 °C for 20 min to sterilize.

Optional (add after autoclaving):
3 ml of 10% (w/v) L-cysteine (dissolve in water; final concentration, 0.03%)

70:30 Medium

BactoPeptone 63 g
Protease peptone 3.5 g
Brain heart infusion 11.1 g
Yeast extract 1.5 g
(NH4)2SO4 0.7 g
Tris base 1.06 g

For plates, add 15 g agar. Bring to 1 L with deionized water and autoclave at 121 °C for 20 min to sterilize. After autoclaving, add 3 ml of 10% (w/v) L-cysteine (final concentration, 0.03%).

Blood agar

The use of premade Columbia anaerobic sheep blood agar plates (Fisher Scientific, L21928)35 is recommended.

1X Phosphate buffered saline (PBS)

NaCl 8.01 g
KCl 0.2 g
Na2HPO4 1.44 g
KH2PO4 0.27 g

Bring to 1 L with deionized water and adjust pH to 7.4 with HCl. Filter sterilize before use.

References

  1. Hall, I. C., O’Toole, E. Intestinal flora in new-borin infants – With a description of a new pathogenic anaerobe, Bacillus difficilis. Am. J. Dis. Child. 49, 390-402 (1935).
  2. Tedesco, F. J., Barton, R. W., Alpers, D. H. Clindamycin-Associated Colitis – Prospective Study. Ann. Intern. Med. 81, 429-433 (1974).
  3. Gerding, D. N. Clostridium difficile 30 years on: what has, or has not, changed and why. Int. J. Antimicrob. Agents. 33, 2-8 (2009).
  4. Gerding, D. N., Muto, C. A., Owens, R. C. Treatment of Clostridium difficile infection. Clin. Infect. Dis. 46, 32-42 (2008).
  5. Dubberke, E. R., Olsen, M. A. Burden of Clostridium difficile on the healthcare system. Clin. Infect. Dis. 55, 88-92 (2012).
  6. Bouza, E. Consequences of Clostridium difficile infection: understanding the healthcare burden. Clin. Microbiol. Infect. 18, 5-12 (2012).
  7. Peery, A. F., et al. Burden of gastrointestinal disease in the United States: 2012 update. Gastroenterology. 143, 1171-1173 (2012).
  8. Deakin, L. J., et al. The Clostridium difficile spo0A gene is a persistence and transmission factor. Infect. Immun. 80, 2704-2711 (2012).
  9. Drasar, B. S. Cultivation of anaerobic intestinal bacteria. J. Pathol. Bacteriol. 94, 417-427 (1967).
  10. Leach, P. A., Bullen, J. J., Grant, I. D. Anaerobic CO 2 cabinet for the cultivation of strict anerobes. Appl. Microbiol. 22, 824-827 (1971).
  11. Killgore, G. E., Starr, S. E., Del Bene, ., Whaley, V. E., N, D., Dowell, V. R. Comparison of three anaerobic systems for the isolation of anaerobic bacteria from clinical specimens. Am. J. Clin. Pathol. 59, 552-559 (1973).
  12. Bacic, M. K., Smith, C. J. Laboratory maintenance and cultivation of bacteroides species. Curr. Protoc. Microbiol. Chapter 13, Unit 13C 11 (2008).
  13. Doan, N., Contreras, A., Flynn, J., Morrison, J., Slots, J. Proficiencies of three anaerobic culture systems for recovering periodontal pathogenic bacteria. J. Clin. Microbiol. 37, 171-174 (1999).
  14. Socransky, S., Macdonald, J. B., Sawyer, S. The cultivation of Treponema microdentium as surface colonies. Arch. Oral. Biol. 1, 171-172 (1959).
  15. George, W. L., Sutter, V. L., Citron, D., Finegold, S. M. Selective and differential medium for isolation of Clostridium difficile. J. Clin. Microbiol. 9, 214-219 (1979).
  16. Wilson, K. H., Silva, J., Fekety, F. R. Suppression of Clostridium difficile by normal hamster cecal flora and prevention of antibiotic-associated cecitis. Infect. Immun. 34, 626-628 (1981).
  17. Wilson, K. H., Kennedy, M. J., Fekety, F. R. Use of sodium taurocholate to enhance spore recovery on a medium selective for Clostridium difficile. J. Clin. Microbiol. 15, 443-446 (1982).
  18. Bliss, D. Z., Johnson, S., Clabots, C. R., Savik, K., Gerding, D. N. Comparison of cycloserine-cefoxitin-fructose agar (CCFA) and taurocholate-CCFA for recovery of Clostridium difficile during surveillance of hospitalized patients. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 29, 1-4 (1997).
  19. Marler, L. M., et al. Comparison of five cultural procedures for isolation of Clostridium difficile from stools. J. Clin. Microbiol. 30, 514-516 (1992).
  20. Sorg, J. A., Dineen, S. S. Laboratory maintenance of Clostridium difficile. Curr. Protoc. Microbiol. Chapter 9, Unit 9A 1 (2009).
  21. Bouillaut, L., McBride, S. M., Sorg, J. A. Genetic manipulation of Clostridium difficile. Curr. Protoc. Microbiol. Chapter 9, Unit 9A 2 (2011).
  22. Lemee, L., Pons, J. L. Multilocus sequence typing for Clostridium difficile. Methods. Mol. Biol. 646, 77-90 (2010).
  23. Shanholtzer, C. J., Peterson, L. R., Olson, M. N., Gerding, D. N. Prospective study of gram-stained stool smears in diagnosis of Clostridium difficile colitis. J. Clin. Microbiol. 17, 906-908 (1983).
  24. Smith, C. J., Markowitz, S. M., Macrina, F. L. Transferable tetracycline resistance in Clostridium difficile. Antimicrob. Agents Chemother. 19, 997-1003 (1981).
  25. Permpoonpattana, P., et al. Surface layers of Clostridium difficile endospores. J. Bacteriol. 193, 6461-6470 (2011).
  26. Putnam, E. E., Nock, A. M., Lawley, T. D., Shen, A. SpoIVA and SipL are Clostridium difficile spore morphogenetic proteins. J. Bacteriol. , (2013).
  27. Burns, D. A., Minton, N. P. Sporulation studies in Clostridium difficile. J. Microbiol. Methods. 87, 133-138 (2011).
  28. Perez, J., Springthorpe, V. S., Sattar, S. A. Clospore: a liquid medium for producing high titers of semi-purified spores of Clostridium difficile. J. AOAC Int. 94, 618-626 (2011).
  29. Sorg, J. A., Sonenshein, A. L. Inhibiting the initiation of Clostridium difficile spore germination using analogs of chenodeoxycholic acid, a bile acid. J. Bacteriol. 192, 4983-4990 (2010).
  30. O’Connor, J. R., et al. Construction and analysis of chromosomal Clostridium difficile mutants. Mol. Microbiol. 61, 1335-1351 (2006).
  31. Buggy, B. P., Wilson, K. H., Fekety, R. Comparison of methods for recovery of Clostridium difficile from an environmental surface. J. Clin. Microbiol. 18, 348-352 (1983).
  32. Koch, C. J., Kruuv, J. The release of oxygen from polystyrene Petri dishes. Br. J. Radiol. 45, 787-788 (1972).
  33. Ethapa, T., et al. Multiple factors modulate biofilm formation by the anaerobic pathogen Clostridium difficile. J. Bacteriol. , (2012).
  34. Speers, A. M., Cologgi, D. L., Reguera, G. Anaerobic cell culture. Curr. Protoc. Microbiol. Appendix 4, Appendix 4F (2009).
  35. Lyras, D., et al. Toxin B is essential for virulence of Clostridium difficile. Nature. 458, 1176-1179 (2009).

Play Video

Cite This Article
Edwards, A. N., Suárez, J. M., McBride, S. M. Culturing and Maintaining Clostridium difficile in an Anaerobic Environment. J. Vis. Exp. (79), e50787, doi:10.3791/50787 (2013).

View Video