Summary

في المختبر الفحص لقياس فسفاتيديل إيثانولامين ناقلة ميثيل آخر

Published: January 05, 2016
doi:

Summary

The present report describes an in vitro enzymatic assay to measure phosphatidylethanolamine methyltransferase activity using Leishmania cell extracts. This assay is based on the transfer of a radioactive methyl group from S-[Methyl-3H]adenosyl-L-methionine onto endogenous phosphatidylethanolamine.

Abstract

Phosphatidylethanolamine methyltransferases are biosynthetic enzymes that catalyze the transfer of one or more methyl group(s) from S-adenosyl-L-methionine onto phosphatidylethanolamine, monomethyl-phosphatidylethanolamine, or dimethyl-phosphatidylethanolamine to give either monomethyl-phosphatidylethanolamine, dimethyl-phosphatidylethanolamine or phosphatidylcholine. These enzymes are ubiquitous in animal cells, fungi, and are also found in approximately 10% of bacteria. They fulfill various important functions in cell physiology beyond their direct role in lipid metabolism such as in insulin resistance, diabetes, atherosclerosis, cell growth, or virulence. The present manuscript reports on a simple cell-free enzymatic assay that measures the transfer of tritiated methyl group(s) from S-[Methyl-3H]adenosyl-L-methionine onto phosphatidylethanolamine using whole cell extracts as an enzyme source. The resulting methylated forms of phosphatidylethanolamine are hydrophobic and thus, can be separated from water soluble S-[Methyl-3H]adenosyl-L-methionine by organic extraction. This assay can potentially be applied to any other cell types and used to test inhibitors/drugs specific to a phosphatidylethanolamine methyltransferase of interest without the need to purify the enzyme.

Introduction

فسفاتيديل إيثانولامين ناقلة الميثيل (PEMT) إنزيمات تحفز مرفق التساهمية من واحد أو أكثر من مجموعات الميثيل باستخدام S -adenosylmethionine (SAM) بوصفه المانح مجموعة الميثيل على PE، monomethyl-PE أو ثنائي ميثيل-PE لإعطاء monomethyl-PE، ثنائي ميثيل-PE و / أو فسفاتيديل (PC). هذه الأنزيمات هي في كل مكان تقريبا في الخلايا الحيوانية والفطريات. كما يمكن العثور عليها في بعض النباتات (1) وحوالي 10٪ من البكتيريا، لا سيما تلك التي تتفاعل مع حقيقيات النوى 2.

PEMTs ذات الصلة بيولوجيا الخلية ليس فقط عن طريق المساهمة في إنتاج أجهزة الكمبيوتر الشخصية، التي هي الطبقة الدهنية الأساسية في الخلايا الحيوانية، ولكن أيضا عن طريق الوفاء الوظائف الخلوية الهامة الأخرى. في الثدييات، ويتم التعبير عن PEMTs أساسا في الكبد حيث كانت مطلوبة من أجل إفراز طبيعي من البروتين الدهني منخفض الكثافة جدا، وأنها تسهم أيضا في النظام الغذائي الناجم عن السمنة 4 تصلب الشرايين، والأنسولين مقاومة5 تعصب. بالإضافة إلى ذلك، أعرب PEMT الثدييات أيضا في الخلايا الشحمية، على الرغم من أن مستويات أدنى، والمشاركة في ترسب الدهون 6 و 7. كما تم أظهرت دور PEMT في تطور مرض السرطان 9 موت الخلايا المبرمج، ونمو الخلايا 10. في البكتيريا، وقد تبين أن الأنزيمات PEMT إلى أن تكون مهمة للنمو الطبيعي الخلية 2 الفوعة، والتعايش مع النبات المضيف (11).

الهدف والأساس المنطقي لهذا البروتوكول هو قياس النشاط PEMT من مقتطفات خلية كاملة دون الحاجة لتنقية الانزيم. وقد وضعت بروتوكولين متميزة لقياس النشاط PEMT. واحد الأول والأكثر شيوعا يقيس نقل مجموعة الميثيل معالج بالتريتيوم من SAM المشع على PE، الذي هو موضوع هذا المقال. وقد تم هذا البروتوكول وضعت أصلا لقياس النشاط PEMT من الخميرة 12 وخلايا الثدييات (الكبد) 13 لاكتساب understاندينج من الحيوي PC في هذه الخلايا وكذلك لتحديد خصوصية هذه الإنزيمات. وفي وقت لاحق، وقد تم تطبيق هذه التقنية لأنواع الخلايا الأخرى مثل البكتيريا 2 (باستخدام قيمة الرقم الهيدروجيني الأساسية للمقايسة على الرغم 15) والطفيليات 14. هذه التقنية يمكن استخدامها مع مقتطفات خلية كاملة وكذلك انزيم المنقى، ويحتمل أن يكون تطبيقها على أي نظام استخراج الخلايا. كما تم تصميم مقايسة غير المشع الذي يعتمد على القياس الكمي الأنزيمي S -adenosylhomocysteine، والمنتج نقل الميثيل من SAM 16. قد يكون الفحص الأخير أكثر ملاءمة لأنها لا تنطوي على النشاط الإشعاعي لكنه لا يصلح إلا للأنزيمات تنقيته.

Protocol

1. خلية التحضير استخراج تنمو الخلايا الليشمانيا في زجاجة بلاستيكية معقمة مختومة مع الهواء غطاء محكم على 26 درجة مئوية في المتوسط ​​مصنوعة من 1X M199 تستكمل مع 20 ملي HEPES pH7.4، 100 U / البنسلين مل، 100 ميكروغرام / مل الستربتو?…

Representative Results

ويبين الشكل 1 وقت الفحص PEMT المعالين، التي أجريت مع الليشمانيا استخراج خلية كاملة كمصدر للإنزيم باستخدام PE الذاتية باعتبارها الركيزة. وكان كميا مقدار النشاط الإشعاعي في المرحلة العضوية من قبل التلألؤ العد. واستخدمت الأرقام ا?…

Discussion

هذا بسيط، PEMT سريع الفحص يسمح الكمي من أشكال مثيلة من PE التي تنتج من نقل مجموعات الميثيل المشعة من SAM على PE باستخدام استخراج خلية كاملة كمصدر للبروتين. فهي سريعة وحساسة، قابلة للتكرار، ومناسبة أيضا لأنزيمات النقاء 17. Monomethyl- أو ثنائي ميثيل-PE يمكن أن تضاف إلى فحص إذ?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

This work was supported by NIH grants ARRA RO3 AI078145 and 1SC3GM113743 to RZ.

Materials

S-[Methyl-3H]adenosyl-L-methionine (specific activity of 5-15 Ci/mMole) Perkin Elmer NET155050UC Aliquot the reagent and freeze at -20 °C; follow radiation safety guidelines while using this reagent
Protease inhibitor cocktail Roche Life Sciences 11836170001 dilute it fresh 
Glass beads, acid washed, 425-600 mm Sigma Aldrich G8772
Bicinchoninic acid solution Sigma Aldrich B9643
Copper (II) sulfate Sigma Aldrich C2284
Scintillation counter MicroBeta2 with 1-detector Perkin Elmer  2450-0010
Spectrophotometer Biomate 3 Thermo Scientific 840208300
BSA stock solution (10 mg/ml) New England Biolabs B9001S
Scintillation liquid  Research Product International Corp 111198
S-(5'-Adenosyl)-L-methionine chloride (hydrochloride)  Cayman Chemicals 13956 dilute the reagent in 20 mM HCl and freeze aliquots at -80 °C 

References

  1. Keogh, M. R., Courtney, P. D., Kinney, A. J., Dewey, R. E. Functional characterization of phospholipid N-.methyltransferases from Arabidopsis and soybean. J Biol Chem. 284 (23), 15439-15447 (2009).
  2. Geiger, O., Lopez-Lara, I. M., Sohlenkamp, C. Phosphatidylcholine biosynthesis and function in bacteria. Biochim Biophys Acta. 1831 (3), 503-513 (2013).
  3. Gao, X., et al. Decreased lipogenesis in white adipose tissue contributes to the resistance to high fat diet-induced obesity in phosphatidylethanolamine N-.methyltransferase-deficient mice. Biochim Biophys Acta. 1851 (2), 152-162 (2015).
  4. Zhao, Y., et al. Lack of phosphatidylethanolamine N-.methyltransferase alters plasma VLDL phospholipids and attenuates atherosclerosis in mice. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 29 (9), 1349-1355 (2009).
  5. Vance, D. E. Phospholipid methylation in mammals: from biochemistry to physiological function. Biochim Biophys Acta. 1838 (6), 1477-1487 (2014).
  6. Nishimaki-Mogami, T., Suzuki, K., Takahashi, A. The role of phosphatidylethanolamine methylation in the secretion of very low density lipoproteins by cultured rat hepatocytes: rapid inhibition of phosphatidylethanolamine methylation by bezafibrate increases the density of apolipoprotein B48-containing lipoproteins. Biochim Biophys Acta. 1304 (1), 21-31 (1996).
  7. Noga, A. A., Zhao, Y., Vance, D. E. An unexpected requirement for phosphatidylethanolamine N-.methyltransferase in the secretion of very low density lipoproteins. J Biol Chem. 277 (44), 42358-42365 (2002).
  8. Li, D., et al. Epigenetic repression of phosphatidylethanolamine N-.methyltransferase (PEMT) in BRCA1-mutated breast cancer. Oncotarget. 5 (5), 1315-1325 (2014).
  9. Cui, Z., Houweling, M., Vance, D. E. Suppression of rat hepatoma cell growth by expression of phosphatidylethanolamine N-.methyltransferase-2. J Biol Chem. 269 (40), 24531-24533 (1994).
  10. Cui, Z., Shen, Y. J., Vance, D. E. Inverse correlation between expression of phosphatidylethanolamine.N-.methyltransferase-2 and growth rate of perinatal rat livers. Biochim Biophys Acta. 1346 (1), 10-16 (1997).
  11. Minder, A. C., de Rudder, K. E., Narberhaus, F., Fischer, H. M., Hennecke, H., Geiger, O. Phosphatidylcholine levels in.Bradyrhizobium japonicum. membranes are critical for an efficient symbiosis with the soybean host plant. Mol Microbiol. 39 (5), 1186-1198 (2001).
  12. Kodaki, T., Yamashita, S. Yeast phosphatidylethanolamine methylation pathway. Cloning and characterization of two distinct methyltransferase genes. J Biol Chem. 262 (32), 15428-15435 (1987).
  13. Tanaka, Y., Amano, F., Maeda, M., Nishijima, M., Akamatsu, Y. Purification and properties of phosphatidyl-N-.monomethylethanolamine N-.methyltransferase, the enzyme catalyzing the second and the third steps in the phosphatidylethanolamine N-.methyltransferase system, from mouse liver microsomes. Jpn J Med Sci Biol. 43 (3), 59-73 (1990).
  14. Bibis, S. S., Dahlstrom, K., Zhu, T., Zufferey, R. Characterization of Leishmania major phosphatidylethanolamine methyltransferases LmjPEM1 and LmjPEM2 and their inhibition by choline analogs. Mol Biochem Parasitol. 196 (2), 90-99 (2014).
  15. deRudder, K. E., Thomas-Oates, J. E., Geiger, O. Rhizobium meliloti. mutants deficient in phospholipid N-.methyltransferase still contain phosphatidylcholine. J Bacteriol. 179 (22), 6921-6928 (1997).
  16. Aktas, M., Narberhaus, F. In vitro characterization of the enzyme properties of the phospholipid N-.methyltransferase PmtA from Agrobacterium tumefaciens. J Bacteriol. 191 (7), 2033-2041 (2009).
  17. Ridgway, N. D., Vance, D. E. Phosphatidylethanolamine N-.methyltransferase from rat liver. Methods Enzymol. 209, 366-374 (1992).
  18. Gaynor, P. M., Carman, G. M. Phosphatidylethanolamine methyltransferase and phospholipid methyltransferase activities from Saccharomyces cerevisiae. Enzymological and kinetic properties. Biochim Biophys Acta. 1045 (2), 156-163 (1990).
  19. Arondel, V., Benning, C., Somerville, C. R. Isolation and functional expression in Escherichia coli. of a gene encoding phosphatidylethanolamine methyltransferase (EC 2.1.1.17) from Rhodobacter sphaeroides. J Biol Chem. 268 (21), 16002-16008 (1993).
  20. Wessel, M., Klusener, S., Godeke, J., Fritz, C., Hacker, S., Narberhaus, F. Virulence of Agrobacterium tumefaciens. requires phosphatidylcholine in the bacterial membrane. Mol Microbiol. 62 (3), 906-915 (2006).
  21. Klusener, S., Aktas, M., Thormann, K. M., Wessel, M., Narberhaus, F. Expression and physiological relevance of Agrobacterium tumefaciens. phosphatidylcholine biosynthesis genes. J Bacteriol. 191 (1), 365-374 (2009).
  22. Henderson, D. M., et al. Cloning of the gene encoding Leishmania donovani.S.-adenosylhomocysteine hydrolase, a potential target for antiparasitic chemotherapy. Mol Biochem Parasitol. 53 (1-2), 169-183 (1992).
  23. Koszalka, G. W., Krenitsky, T. A., Nyhan, W. L., Thompson, L. F., Watts, R. W. E. 5'-Methylthioadenosine (MTA) phosphorylase from promastigote of Leishmania donovani. Purine and Pyrimidine Metabolism in Man V, Adv Exp Med Biol. 131, 559-563 (1986).
  24. Biastoff, S., Teuber, M., Zhou, Z. S., Dräger, B. Colorimetric activity measurement of a recombinant putrescine N.-methyltransferase from Datura stramonium. Planta Med. 72 (12), 1136-1141 (2006).
  25. Hendricks, C. L., Ross, J. R., Pichersky, E., Noel, J. P., Zhou, Z. S. An enzyme-coupled colorimetric assay for S.-adenosylmethionine-dependent methyltransferases. Anal Biochem. 326 (1), 100-105 (2004).
  26. Cannon, L. M., Butler, F. N., Wan, W., Zhou, Z. S. A stereospecific colorimetric assay for (S.,S.)-adenosylmethionine quantification based on thiopurine methyltransferase-catalyzed thiol methylation. Anal Biochem. 308 (2), 358-363 (2002).
  27. Hoffman, J. L. Chromatographic analysis of the chiral and covalent instability of S.-adenosyl-L-methionine. 생화학. 25 (15), 4444-4449 (1986).
  28. Wu, S. E., Huskey, W. P., Borchardt, R. T., Schowen, R. L. Chiral instability at sulfur of S.-adenosylmethionine. 생화학. 22 (12), 2828-2832 (1983).
  29. Dorgan, K. M., et al. An enzyme-coupled continuous spectrophotometric assay for S.-adenosylmethionine-dependent methyltransferases. Anal Biochem. 350 (2), 249-255 (2006).
check_url/kr/53302?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Zufferey, R. In Vitro Assay to Measure Phosphatidylethanolamine Methyltransferase Activity. J. Vis. Exp. (107), e53302, doi:10.3791/53302 (2016).

View Video