Summary

In Vivo Biosensor Tracks Icke-apoptotiska kaspasaktivitet i Drosophila

Published: November 27, 2016
doi:

Summary

För att detektera friska celler i hela djur som innehåller låga halter av kaspas-aktivitet, var mycket känsliga biosensorn betecknad CaspaseTracker genereras för Drosophila. Kaspas-beroende biosensor aktivitet upptäcks i långlivade friska celler genom de inre organen av vuxna djur som fötts upp under optimerade betingelser i frånvaro av döds stimuli.

Abstract

Caspases are the key mediators of apoptotic cell death via their proteolytic activity. When caspases are activated in cells to levels detectable by available technologies, apoptosis is generally assumed to occur shortly thereafter. Caspases can cleave many functional and structural components to cause rapid and complete cell destruction within a few minutes. However, accumulating evidence indicates that in normal healthy cells the same caspases have other functions, presumably at lower enzymatic levels. Studies of non-apoptotic caspase activity have been hampered by difficulties with detecting low levels of caspase activity and with tracking ultimate cell fate in vivo. Here, we illustrate the use of an ultrasensitive caspase reporter, CaspaseTracker, which permanently labels cells that have experienced caspase activity in whole animals. This in vivo dual color CaspaseTracker biosensor for Drosophila melanogaster transiently expresses red fluorescent protein (RFP) to indicate recent or on-going caspase activity, and permanently expresses green fluorescent protein (GFP) in cells that have experienced caspase activity at any time in the past yet did not die. Importantly, this caspase-dependent in vivo biosensor readily reveals the presence of non-apoptotic caspase activity in the tissues of organ systems throughout the adult fly. This is demonstrated using whole mount dissections of individual flies to detect biosensor activity in healthy cells throughout the brain, gut, malpighian tubules, cardia, ovary ducts and other tissues. CaspaseTracker detects non-apoptotic caspase activity in long-lived cells, as biosensor activity is detected in adult neurons and in other tissues at least 10 days after caspase activation. This biosensor serves as an important tool to uncover the roles and molecular mechanisms of non-apoptotic caspase activity in live animals.

Introduction

Kaspaser är cysteinproteaser som förmedlar apoptotisk celldöd genom att klyva många intracellulära proteiner efter viktiga aspartat rester. Till exempel, initiator kaspaser aktivera effektor kaspaser, derepress DNA nukleaser, klyver cytoskelettala komponenter och förändra lipidkompositionen av cellmembran för att snabbt avveckla celler och stimulera deras erkännande och omvälvning av angränsande celler som omhändertar cell lik. 1-4 Det uppskattas att miljarder celler dör per dag i den mänskliga kroppen, och apoptos är en viktig mekanism för kemoterapiinducerad tumörcelldöd. 5 en annan uppsättning av caspaser kan orsaka celldöd av distinkta icke-apoptotiska processer för att stimulera medfödd immunitet. 6 Därför den mesta forskningen på kaspaser har fokuserat på sina pro-döden funktioner.

Intressant tidiga tecken på området visade att samma kaspaser ansvarar för att främja celldöd har också icke-död fSpecialfunktioner. Banbrytande studier har visat att kaspaser är involverade i olika cellulära funktioner i friska celler, inklusive reglering av celltillväxt och migration under fosterutvecklingen. 7-9 Kaspaser krävs för spermatid individualisering i Drosophila 10,11, för att blockera ett alternativ necroptotic celldöd vägen i möss 12,13, och mikroRNA bearbetning i C. elegans. 14,15 I kanske längsta bodde celler, neuroner, kaspaser och andra apoptotiska maskiner är inblandade i regleringen av nervaktivitet genom beskärning synaptiska ändelser, en process tros vara nödvändigt att stärka andra synapser för inlärning och minne. 16- 18 Det är möjligt att kaspaser underlättar synaptiska beskärning av en typ av mini-apoptos av små neuronala projektioner utan hela celldöd. 19 emellertid kaspaser kan ha alternativa funktioner inte har samband med apoptos-liknande händelser. 20,21 dubbla rollsi liv och död är inte unika för kaspaser, BCL-2 familjeproteiner och cytokrom c har roller i cell energier i friska celler, men är också en del av kärnan apoptotiska vägen som aktiveras av många typer av cellstress. 22-25 Även om det inte bevisat, verkar det logiskt att evolutionen har kopplat dag -jobb till döds jobb inom samma molekyler för att snabbt avskaffa olämpliga eller oönskade celler.

För närvarande är de molekylära mekanismerna för icke-apoptotiska kaspas-aktivitet inte förstått, och omfattningen av icke-apoptotiska kaspas aktivitet under embryonal utveckling och i vuxna vävnader är inte heller känt. En stor utmaning är att det är svårt att skilja dagsjobb från döds jobb kaspaser. I motsats till apoptos och pyroptosis, när kaspasaktivitet förstärks av en proteolytisk kaskad, är dags jobb kaspaser förväntas ske vid mycket lägre nivåer av enzymatisk aktivitet, sannolikt under upptäckt av många tillgängliga teknologies.

Före det arbete som presenteras här, andra utvecklat en rad olika caspase biosensorer för olika ändamål. Scat biosensorer (t.ex. ECFP-DEVD-Venus) snabbt upptäcka realtid kaspas-aktivitet i odlade celler och djurvävnader med hjälp av FRET. 26,27 Vid caspase klyvning, kärn riktade GFP delen av Apoliner (mCD8-RFP-DQVD- nucGFP) genomgår subcellulära relocalization inom några minuter när dess plasmamembran-tjuder klyvs av kaspaser. 28 Likaså ApoAlert-pCaspase3-sensor (NES-DEVD-YFP-NLS) relocalizes från cytosolen till kärnan på caspase klyvning. 29,30 Mer nyligen kromoforen i iCasper skickligt konstruerad för att fluorescera när klyvs av kaspaser, medger detektering av biosensoraktivitet i realtid i nervceller i Drosophila embryon, men framför allt i samband med utvecklings celldöd. 31 kaspas-beroende död lukt neuroner under åldrandet var demonstrankad av immuno-detektion av kaspas-klyvd form av CPV biosensorer (t.ex. mCD8-PARP-Venus). 32,33 Viktigt var den aktiverade formen av kaspas-3 detekterades i frånvaro av celldöd genom känsliga immunostain i taggar i odlade nervceller, och i soma med hjälp av kaspas-beroende fluorescens av kärn CellEvent reporter färgämne, men svårigheter påträffades på grund av fototoxicitet, men celldöd försenades tills efter eliminering ryggraden. 19 Således nya kaspas biosensorer behövs för att upptäcka och spåra celler med basal kaspas-aktivitet in vivo.

För att övervinna dessa svårigheter, genererade vi en ny dubbel färg kaspas biosensor, betecknad CaspaseTracker. Denna strategi kombinerar en modifierad version av Drosophila kaspas känsliga Apoliner biosensor 28 med Drosophila G-TRACE FRT rekombinassystem 34 för att permanent märka och spåra celler in vivo. <sup> 35 Den Gal4-aktiverade G-TRACE systemet tillåter mycket låga nivåer av kaspaser att aktivera CaspaseTracker, vilket resulterar i RFP uttryck i cytoplasman och permanent kärninriktade GFP-uttryck i någon cell som någonsin har upplevt kaspas-aktivitet. 35 Detta system kan märka celler under hela livet i hela djur med användning av Drosophila melanogaster, en lätthanterlig och mycket använt modellsystem för studium av kaspaser och celldöd. 36-38

Protocol

1. Framställning av CaspaseTracker Flies För att förbereda CaspaseTracker (DQVD) flyger för experiment, utföra inlägg: UBI-CaspaseTracker x G-trace (UAS-RFP, UAS-FLP, Ubi> Stopp> GFP-NLS), genom att överföra 7-10 virgin kvinnor (eller män) flugor bär kaspas biosensor substratet mCD8-DIAP1-Gal4 driven av ubikitinpromotorn 35 tillsammans med samma antal män (eller kvinna) G-TRACE flugor, som har den andra kromosomen cyo balancer att undvika letaliteten av den homozy…

Representative Results

Det finns två viktiga komponenter som gör det möjligt CaspaseTracker att upptäcka kaspas-aktivitet i normala friska celler (Figur 1A). Den första av dessa är en 146 aminosyra kaspas-klyvbar polypeptid modellerad efter kaspas biosensor Apoliner (figur 1b). 28 Denna polypeptid är härledd från DIAP1 (Drosophila inhibitor av apoptos) innehållande en enda naturligt förekommande caspas webbplats som klyvs under apoptos typiskt av…

Discussion

Här visar vi bygg- och inre arbetet i CaspaseTracker som underlättar upptäckt av omfattande basal kaspas-aktivitet i friska vävnader. De kritiska stegen för detektering av icke-apoptotiska kaspas-aktivitet in vivo är: 1) att generera flugor med biosensor transgen, 2) kontrollera kaspas-specifik reporter funktion med lämpliga kontroller, 3) tränar dissekering tekniker för att observera alla system av vuxna Drosophila inre organ, och 4) särskiljande biosensoraktivitet från autofluorescerande a…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Vi tackar Polan Santos och Darren Obbard för Drosophila illustrationer i Fig. 2a, Marcelo Jacobs-Lorena för användning av JHMRI insectary. Detta arbete stöddes av Life Science Research Foundation gemenskap (HLT), University Nämndens i Hongkong AoE / B-07/99 (MCF), och NIH bidrag NS096677, NS037402 och NS083373 (JMH). Ho Lam Tang är en Shurl och Kay Curci Foundation Fellow av Life Sciences Research Foundation.

Materials

CONSUMABLES AND REAGENTS
Vectashield Vector Products H-1000 Mounting medium
Forceps Ted Pella #505 (110mm, #5) Dumont tweezer biology grade, stainless steel
Hanging Drop Slides Fisher Scientific 12-565B Glass slides
Hoechst 33342 Molecular Probes H1399 DNA stain
Alexa Fluor 633 Phalloidin Molecular Probes A22284 Actin stain
Rat-Elav-7E8A10 anti-elav antibody  Developmental Studies Hybridoma Bank (DSHB) Antibody Registry ID:  AB_528218  Stain for Drosophla pan-neuronal ELAV
Cleaved caspase-3 (Asp175) antibody Cell Signaling Technology #9661 Stain for active fragment of caspase-3
ProLong Gold antifade reagent Life Technologies P36934 to preserve fluorophores 
ProLong Diamond Antifade Mountant Life Technologies P36961 to preserve fluorophores 
SylGard 182 Silicone Elastomer Kit Dow Corning  Product code: 0001023934 for dissection plates
EQUIPMENT
LSM780 confocal microscope Carl Zeiss N/A Imaging
Carl Zeiss Stereomicroscope Stemi 2000  Carl Zeiss N/A Drosophila dissection
AmScope Fiber Optic Dual Gooseneck Microscope Illuminator, 150W AmScope WBM99316  Light source

References

  1. Salvesen, G. S., Abrams, J. M. Caspase activation – stepping on the gas or releasing the brakes? Lessons from humans and flies. Oncogene. 23, 2774-2784 (2004).
  2. Hay, B. A., Guo, M. Caspase-dependent cell death in Drosophila. Annu Rev Cell Dev Biol. 22, 623-650 (2006).
  3. Segawa, K., et al. Caspase-mediated cleavage of phospholipid flippase for apoptotic phosphatidylserine exposure. Science. 344, 1164-1168 (2014).
  4. Akagawa, H., et al. The role of the effector caspases drICE and dcp-1 for cell death and corpse clearance in the developing optic lobe in Drosophila. Dev Biol. , (2015).
  5. Souers, A. J., et al. ABT-199, a potent and selective BCL-2 inhibitor, achieves antitumor activity while sparing platelets. Nat Med. 19, 202-208 (2013).
  6. Lamkanfi, M., Dixit, V. M. Mechanisms and functions of inflammasomes. Cell. 157, 1013-1022 (2014).
  7. Bergmann, A., Steller, H. Apoptosis, stem cells, and tissue regeneration. Sci Signal. 3, re8 (2010).
  8. Hyman, B. T., Yuan, J. Apoptotic and non-apoptotic roles of caspases in neuronal physiology and pathophysiology. Nat Rev Neurosci. 13, 395-406 (2012).
  9. Juraver-Geslin, H. A., Durand, B. C. Early development of the neural plate: new roles for apoptosis and for one of its main effectors caspase-3. Genesis. 53, 203-224 (2015).
  10. Arama, E., Agapite, J., Steller, H. Caspase activity and a specific cytochrome C are required for sperm differentiation in Drosophila. Dev Cell. 4, 687-697 (2003).
  11. Kaplan, Y., Gibbs-Bar, L., Kalifa, Y., Feinstein-Rotkopf, Y., Arama, E. Gradients of a ubiquitin E3 ligase inhibitor and a caspase inhibitor determine differentiation or death in spermatids. Dev Cell. 19, 160-173 (2010).
  12. Kaiser, W. J., et al. RIP3 mediates the embryonic lethality of caspase-8-deficient mice. Nature. 471, 368-372 (2011).
  13. Gunther, C., et al. Caspase-8 regulates TNF-alpha-induced epithelial necroptosis and terminal ileitis. Nature. 477, 335-339 (2011).
  14. Weaver, B. P., et al. CED-3 caspase acts with miRNAs to regulate non-apoptotic gene expression dynamics for robust development in C. elegans. Elife. 3, e04265 (2014).
  15. Ge, X., et al. A novel mechanism underlies caspase-dependent conversion of the dicer ribonuclease into a deoxyribonuclease during apoptosis. Cell Res. 24, 218-232 (2014).
  16. Fannjiang, Y., et al. BAK alters neuronal excitability and can switch from anti- to pro-death function during postnatal development. Dev Cell. 4, 575-585 (2003).
  17. Ofengeim, D., et al. N-terminally cleaved Bcl-xL mediates ischemia-induced neuronal death. Nat Neurosci. 15, 574-580 (2012).
  18. Li, Z., Sheng, M. Caspases in synaptic plasticity. Mol Brain. 5, 15 (2012).
  19. Erturk, A., Wang, Y., Sheng, M. Local pruning of dendrites and spines by caspase-3-dependent and proteasome-limited mechanisms. J Neurosci. 34, 1672-1688 (2014).
  20. Campbell, D. S., Okamoto, H. Local caspase activation interacts with Slit-Robo signaling to restrict axonal arborization. J Cell Biol. 203, 657-672 (2013).
  21. Feinstein-Rotkopf, Y., Arama, E. Can’t live without them, can live with them: roles of caspases during vital cellular processes. Apoptosis. 14, 980-995 (2009).
  22. Li, P., et al. Cytochrome c and dATP-dependent formation of Apaf-1/caspase-9 complex initiates an apoptotic protease cascade. Cell. 91, 479-489 (1997).
  23. Lewis, J., et al. Inhibition of virus-induced neuronal apoptosis by Bax. Nat Med. 5, 832-835 (1999).
  24. Chen, Y. B., et al. Bcl-xL regulates mitochondrial energetics by stabilizing the inner membrane potential. J Cell Biol. 195, 263-276 (2011).
  25. Yi, C. H., et al. Metabolic regulation of protein N-alpha-acetylation by Bcl-xL promotes cell survival. Cell. 146, 607-620 (2011).
  26. Takemoto, K., Nagai, T., Miyawaki, A., Miura, M. Spatio-temporal activation of caspase revealed by indicator that is insensitive to environmental effects. J Cell Biol. 160, 235-243 (2003).
  27. Takemoto, K., et al. Local initiation of caspase activation in Drosophila salivary gland programmed cell death in vivo. Proc Natl Acad Sci U S A. 104, 13367-13372 (2007).
  28. Bardet, P. L., et al. A fluorescent reporter of caspase activity for live imaging. Proc Natl Acad Sci U S A. 105, 13901-13905 (2008).
  29. Tang, H. L., et al. Cell survival, DNA damage, and oncogenic transformation after a transient and reversible apoptotic response. Mol Biol Cell. 23, 2240-2252 (2012).
  30. Golbs, A., Nimmervoll, B., Sun, J. J., Sava, I. E., Luhmann, H. J. Control of programmed cell death by distinct electrical activity patterns. Cereb Cortex. 21, 1192-1202 (2011).
  31. To, T. L., et al. Rationally designed fluorogenic protease reporter visualizes spatiotemporal dynamics of apoptosis in vivo. Proc Natl Acad Sci U S A. 112, 3338-3343 (2015).
  32. Florentin, A., Arama, E. Caspase levels and execution efficiencies determine the apoptotic potential of the cell. J Cell Biol. 196, 513-527 (2012).
  33. Chihara, T., et al. Caspase inhibition in select olfactory neurons restores innate attraction behavior in aged Drosophila. PLoS Genet. 10, e1004437 (2014).
  34. Evans, C. J., et al. G-TRACE: rapid Gal4-based cell lineage analysis in Drosophila. Nat Methods. 6, 603-605 (2009).
  35. Tang, H. L., Tang, H. M., Fung, M. C., Hardwick, J. M. In vivo CaspaseTracker biosensor system for detecting anastasis and non-apoptotic caspase activity. Sci Rep. 5, 9015 (2015).
  36. Suzanne, M., Steller, H. Shaping organisms with apoptosis. Cell Death Differ. 20, 669-675 (2013).
  37. Jenkins, V. K., Timmons, A. K., McCall, K. Diversity of cell death pathways: insight from the fly ovary. Trends Cell Biol. 23, 567-574 (2013).
  38. Sarkissian, T., Timmons, A., Arya, R., Abdelwahid, E., White, K. Detecting apoptosis in Drosophila tissues and cells. Methods. 68, 89-96 (2014).
  39. Williamson, W. R., Hiesinger, P. R. Preparation of developing and adult Drosophila brains and retinae for live imaging. J Vis Exp. , (2010).
  40. Wong, L. C., Schedl, P. Dissection of Drosophila ovaries. J Vis Exp. , e52 (2006).
  41. Tauc, H. M., Tasdogan, A., Pandur, P. Isolating intestinal stem cells from adult Drosophila midguts by FACS to study stem cell behavior during aging. J Vis Exp. , e52223 (2014).
  42. Ditzel, M., et al. Degradation of DIAP1 by the N-end rule pathway is essential for regulating apoptosis. Nat Cell Biol. 5, 467-473 (2003).
  43. Li, X., Wang, J., Shi, Y. Structural mechanisms of DIAP1 auto-inhibition and DIAP1-mediated inhibition of drICE. Nat Commun. 2, 408 (2011).
  44. Yi, S. X., Moore, C. W., Lee, R. E. Rapid cold-hardening protects Drosophila melanogaster from cold-induced apoptosis. Apoptosis. 12, 1183-1193 (2007).
  45. Drummond-Barbosa, D., Spradling, A. C. Stem cells and their progeny respond to nutritional changes during Drosophila oogenesis. Dev Biol. 231, 265-278 (2001).
  46. Fan, Y., Bergmann, A. The cleaved-Caspase-3 antibody is a marker of Caspase-9-like DRONC activity in Drosophila. Cell Death Differ. 17, 534-539 (2010).
  47. Fogarty, C. E., Bergmann, A. Detecting caspase activity in Drosophila larval imaginal discs. Methods Mol Biol. 1133, 109-117 (2014).
  48. Koushika, S. P., Lisbin, M. J., White, K. ELAV, a Drosophila neuron-specific protein, mediates the generation of an alternatively spliced neural protein isoform. Curr Biol. 6, 1634-1641 (1996).
  49. Albeck, J. G., et al. Quantitative analysis of pathways controlling extrinsic apoptosis in single cells. Mol Cell. 30, 11-25 (2008).
  50. Galluzzi, L., et al. Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring cell death in higher eukaryotes. Cell Death Differ. 16, 1093-1107 (2009).
  51. Holland, A. J., Cleveland, D. W. Chromoanagenesis and cancer: mechanisms and consequences of localized, complex chromosomal rearrangements. Nat Med. 18, 1630-1638 (2012).
  52. Green, D. R. . Means to an end : apoptosis and other cell death mechanisms. , (2011).
  53. Chau, B. N., et al. Signal-dependent protection from apoptosis in mice expressing caspase-resistant Rb. Nat Cell Biol. 4, 757-765 (2002).
  54. Lin, Y., Devin, A., Rodriguez, Y., Liu, Z. G. Cleavage of the death domain kinase RIP by caspase-8 prompts TNF-induced apoptosis. Genes Dev. 13, 2514-2526 (1999).
  55. Han, M. H., et al. The novel caspase-3 substrate Gap43 is involved in AMPA receptor endocytosis and long-term depression. Mol Cell Proteomics. 12, 3719-3731 (2013).
  56. Nakagawa, A., Shi, Y., Kage-Nakadai, E., Mitani, S., Xue, D. Caspase-dependent conversion of Dicer ribonuclease into a death-promoting deoxyribonuclease. Science. 328, 327-334 (2010).
check_url/kr/53992?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Tang, H. L., Tang, H. M., Fung, M. C., Hardwick, J. M. In Vivo Biosensor Tracks Non-apoptotic Caspase Activity in Drosophila. J. Vis. Exp. (117), e53992, doi:10.3791/53992 (2016).

View Video