Summary

Analyse av Ambient Svevestøv-indusert kromosomavvik ved hjelp av en<em> In Vitro</em> System

Published: December 21, 2016
doi:

Summary

Denne protokollen beskriver teknikker for kvantifisering og karakterisering av kromosomale avvik in vitro i RAW264.7 musemakrofager etter behandling med omgivende luft partikler.

Abstract

Eksponering for svevestøv (PM) er en stor verden helse bekymring, noe som kan skade ulike cellulære komponenter, inkludert kjernefysisk genetisk materiale. For å vurdere effekten av PM på kjernefysisk genetisk integritet, er strukturelle kromosomavvik scoret i de metafase sprer av mus RAW264.7 makroceller. PM er hentet fra luften med et høyt volum total suspenderte partikler sampler. Det oppsamlede materiale er oppløst, og filtrert for å holde den vannoppløselige, fine parti. Partiklene er kjennetegnet for den kjemiske sammensetning av kjernemagnetisk resonans (NMR) spektroskopi. Forskjellige konsentrasjoner av partikkelsuspensjonen blir tilsatt til en in vitro-kultur av RAW264.7 musemakrofager for en total eksponeringstid på 72 timer, sammen med ubehandlede kontrollceller. På slutten av eksponeringen, blir kulturen behandlet med colcemid å stanse celler i metafase. Cellene blir så høstet, behandlet med hypoton oppløsning, fiksert i acetomethanol, dropped på glassplater og til slutt farget med Giemsa løsning. Lysbilder blir undersøkt for å vurdere strukturelle kromosomavvik (CAS) i metafase sprer på 1,000X forstørrelse ved hjelp av en lys-feltet mikroskop. 50-100 metafase spredning er scoret for hver behandlingsgruppe. Denne teknikken er tilpasset for påvisning av strukturelle kromosomavvik (CAS), som kromatid-type pauser, kromatid-type utveksling, asentrisk fragmenter, disentrisk og ring kromosomer, dobbel minutter, endoreduplication og Robertsonske trans in vitro etter eksponering for PM. Det er en kraftig metode for å knytte et veletablert cytogenetisk endepunkt til epigenetiske forandringer.

Introduction

Det har blitt anslått at eksponering for svevestøv (PM) forårsaker over 3 millioner overflødig dødsfall årlig, hovedsakelig fra hjerte- og karsykdommer og lungekreft en. Faktisk PM ble anerkjent som kreftfremkallende for mennesker ved International Agency for Research on Cancer (gruppe 1), som økt risiko for lungekreft med økende nivåer av eksponering for PM har blitt vist to. Interessant, nesten alle kreftceller havn numeriske og / eller strukturelle kromosomavvik. Partikkelformet organisk karbon er en variant, kompleks, og heterogen blanding, hvis sammensetning og størrelsesfordeling avhenger av utslipp, så vel som fysiske og kjemiske omdannelser. Det står 35-55% av urban PM 2,5 masse (PM 2,5 mikrometer i størrelse og mindre) og mer enn 60% av landlige og kontinentale bakgrunn PM 2,5 masse tre, fire. Den vannløselig fraksjon står for 30-90% av organisk aerosol. Et stort antall organiske forbindelserer blitt identifisert, inkludert alifatiske hydrokarboner, polysykliske aromatiske hydrokarboner og deres oksygenerte og nitrerte derivater, alifatiske aldehyder og alkoholer, frie fettsyrer og deres salter, dikarboksylsyrer, multifunksjonelle forbindelser, proteiner og humuslignende makromolekyler (HULIS) ved hjelp kromatografiske metoder kombinert med massespektrometri teknikker 5-8. Disse forbindelser utgjør mindre enn 10-20% av partikkelformet organisk karbon, og således de fleste av organisk karbon er ukjent 9.

Eksperimentelle bevis tyder på at cytotoksisitet, oksidativt stress og betennelse er involvert i utviklingen av PM-assosierte patologiske tilstander. Det har nylig blitt vist, men at utsettelse for PM resulterer også i en rekke epigenetiske endringer, inkludert forandringer i DNA-metylering av repetitive elementer, i både eksperimentelle in vitro-systemer, og i mennesker 10-12. Av spesiell interesse er virkningen avPM på satellitt DNA – store og små satellitter – som er funnet i heterochromatic regionen rundt cent av kromosomer. Det ble vist at disse effekter kan vedvare av natur, som de kan påvises i minst 72 timer etter eksponering 12. Endringer i DNA-metylering, spesielt rundt sentromerer, kan føre til akkumulering av satellitt-DNA-mRNA-transkripter, kompromiss kromosomalt integritet under celledeling og, senere, resulterer i utvikling av en rekke patologiske tilstander 13.

Tilpasning av cytogenetisk tilnærming for analyse av instanser som et sluttpunkt av epigenetiske endringer forårsaket av PM, derfor er av stor betydning. Her rapporterer vi tilnærming for omgivelses PM innsamling og forberedelse, in vitro eksponering og analyse av instanser bruker murine makrofag RAW264.7 modellsystem. Makrofager utgjør den første forsvarslinje mot inhalerte fremmedlegemer og derfor tsin cellelinje tjener som en etablert og den mest brukte modellen i partikkel toksikologi 11, 12, 14, 15.

Protocol

1. Partikkel Collection og klargjøring Kalibrering av høyt volum total suspenderte partikler sampler Frakoble sampler motoren fra massestrømningsregulatoren og kobler motoren til en stabil strømkilden (figur 1). MERK: Et filter brukes ikke under denne prosedyren. Monter kalibratoren åpning og topplading av adapterplaten til sampler. Stram de beste lasting adapter hold-down nøtter sikkert for å sikre at ingen luftlekkasjer er til stede. Tillat …

Representative Results

Stor forsiktighet bør utvises i å velge plasseringen av TSP sampler, samt den tiden av året når samlingen er utført. Den kjemiske sammensetningen, så vel som størrelsen på partiklene kan i vesentlig grad påvirke resultatene. Det innsamlede materialet skal være synlig mot den hvite filteret. En vanlig mus metafase spredning vil ha 40 asentrisk kromosomer. Målet med teknikken er å påvise en endring (eller mangel på sådan) i andelen av unormale kromosomer i behandlede celler …

Discussion

Cytogenetisk undersøkelse eller mikroskopisk analyse av tallene eller strukturer av kromosomer, først og fremst i metafase sprer seg, gir informasjon avgjørende for prognose, risikovurdering, og behandling for ulike sykdommer. Det er nå godt etablert som cytogenetiske abnormiteter er forbundet med progresjon og utvikling av en rekke sykdommer, inkludert kreft. Hittil har instanser blitt funnet i alle de store krefttyper. CAer kan oppstå spontant eller av enten eksterne eller interne stimuli, slik som ioniserende st…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Arbeidet ble støttet delvis av National Institute of Health Center of Biological fremragende forskning [stipend nummer 1P20GM109005], Arkansas Space Grant Consortium gjennom National Aeronautics and Space Administration [stipend nummer NNX15AK32A], og National Institute for Occupational Safety og helse (NIOSH) [tilskuddet antallet 2T420H008436]. Forfatterne ønsker å takke Christopher Fettes for korrekturlesing og redigering av dette manuskriptet.

Materials

Total suspended particulate sampler Tisch Environmental TE-5170
Bruker Avance III NMR spectrometer  Bruker NA
TopSpin 3.5/pl2 software Bruker NA
ACD/NMR Processor Academic Edition ACD/Labs NA
RAW264.7 murine macrophages ATCC ATCC TIB-71
High glucose DMEM GlutaMAX media ThermoFisher 10569010 Warm in a 37°C waterbath before use
Fetal Bovine Serum ThermoFisher 16000044 Warm in a 37°C waterbath before use
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) ThermoFisher 15140163 Warm in a 37°C waterbath before use
Trypsin-EDTA (0.25%) ThermoFisher 25200056 Warm in a 37°C waterbath before use
PBS, pH 7.4 ThermoFisher 10010049 Warm in a 37°C waterbath before use
KaryoMAX Colcemid Solution in PBS ThermoFisher 15212012 Warm in a 37°C waterbath before use
KaryoMAX Potassium Chloride Solution ThermoFisher 10575090 Warm in a 37°C waterbath before use
Methanol (HPLC) Fisher Scientific A452N1-19
Acetic Acid, Glacial Fisher Scientific BP1185-500
Decon Contrad 70 Liquid Detergent Fisher Scientific 04-355-1
Wright and Wright-Giemsa Stain Solutions Fisher Scientific 23-200733
Permount Mounting Medium Fisher Scientific SP15-100
Axio Imager 2 Zeiss NA

References

  1. Lim, S. S., et al. A comparative risk assessment of burden of disease and injury attributable to 67 risk factors and risk factor clusters in 21 regions, 1990-2010: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2010. Lancet. 380, 2224-2260 (2012).
  2. . . IARC: Outdoor air pollution a leading environmental cause of cancer deaths. , (2013).
  3. Putaud, J., et al. A European aerosol phenomenology-2: chemical characteristics of particulate matter at kerbside, urban, rural and background sites in Europe. Atmos. Environ. 38 (16), 2579-2595 (2004).
  4. Hand, J., Schichtel, B., Pitchford, M., Malm, W., Frank, N. Seasonal composition of remote and urban fine particulate matter in the United States. J Geophys Res-Atmos. 117 (5), (2012).
  5. Schauer, J. J., et al. Source apportionment of airborne particulate matter using organic compounds as tracers. Atmos. Environ. 30 (22), 3837-3855 (1996).
  6. Simoneit, B. R. A review of biomarker compounds as source indicators and tracers for air pollution. Environ. Sci. Pollut. Res. 6 (3), 159-169 (1999).
  7. Kavouras, I. G., Stephanou, E. G. Particle size distribution of organic primary and secondary aerosol constituents in urban, background marine, and forest atmosphere. J Geophys Res-Atmos. 107 (8), (2002).
  8. Graber, E., Rudich, Y. Atmospheric HULIS: How humic-like are they? A comprehensive and critical review. Atmos. Chem. Phys. 6 (3), 729-753 (2006).
  9. Pöschl, U., et al. Atmospheric aerosols: composition, transformation, climate and health effects. Angew. Chem. Int. 44 (46), 7520-7540 (2005).
  10. Hou, L., et al. Altered methylation in tandem repeat element and elemental component levels in inhalable air particles. Environ. Mol. Mutagen. 55 (3), 256-265 (2014).
  11. Miousse, I. R., et al. Epigenetic alterations induced by ambient particulate matter in mouse macrophages. Environ. Mol. Mutagen. 55 (5), 428-435 (2014).
  12. Miousse, I. R., et al. In Vitro Toxicity and Epigenotoxicity of Different Types of Ambient Particulate Matter. Toxicol. Sci. 148 (2), 473-487 (2015).
  13. Ehrlich, M. Genomic instability in cancer development. Genome Instability in Cancer Development. , 363-392 (2005).
  14. Michael, S., Montag, M., Dott, W. Pro-inflammatory effects and oxidative stress in lung macrophages and epithelial cells induced by ambient particulate matter. Environ Pollut. 183, 19-29 (2013).
  15. Li, N., et al. Induction of heme oxygenase-1 expression in macrophages by diesel exhaust particle chemicals and quinones via the antioxidant-responsive element. J Immunol. 165 (6), 3393-3401 (2000).
  16. Pathak, R., Ramakumar, A., Subramanian, U., Prasanna, P. G. Differential radio-sensitivities of human chromosomes 1 and 2 in one donor in interphase- and metaphase-spreads after 60Co gamma-irradiation. BMC Med. Phys. 9, 6649 (2009).
  17. Pathak, R., Dey, S. K., Sarma, A., Khuda-Bukhsh, A. R. Genotoxic effects in M5 cells and Chinese hamster V79 cells after exposure to 7 Li-beam (LET= 60keV/µm) and correlation of their survival dynamics to nuclear damages and cell death. Mutat. Res. Genet. Toxicol. Environ. Mutagen. 628 (1), 56-66 (2007).
  18. Pathak, R., Dey, S. K., Sarma, A., Khuda-Bukhsh, A. R. Cell killing, nuclear damage and apoptosis in Chinese hamster V79 cells after irradiation with heavy-ion beams of 16 O, 12 C and 7 Li. Mutat. Res. Genet. Toxicol. Environ. Mutagen. 632 (1), 58-68 (2007).
  19. Chalbot, M. C., Kavouras, I. G. Nuclear magnetic resonance spectroscopy for determining the functional content of organic aerosols: a review. Environ. Pollut. 191, 232-249 (2014).
check_url/kr/54969?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Miousse, I. R., Koturbash, I., Chalbot, M., Hauer-Jensen, M., Kavouras, I., Pathak, R. Analysis of the Ambient Particulate Matter-induced Chromosomal Aberrations Using an In Vitro System. J. Vis. Exp. (118), e54969, doi:10.3791/54969 (2016).

View Video