음이온 교환 수 지 기반 방법, 바이러스의 충돌-기반 bioaerosol 샘플링 시연 액체에 적응 합니다. 다운스트림 분자 탐지와 결합 하면 메서드 bioaerosols에서 바이러스의 손쉬운 및 민감한 감지.
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음이온 교환 수 지 기반 방법, 바이러스의 충돌-기반 bioaerosol 샘플링 시연 액체에 적응 합니다. 다운스트림 분자 탐지와 결합 하면 메서드 bioaerosols에서 바이러스의 손쉬운 및 민감한 감지.
이 프로토콜에서는 바이러스에 대 한 사용자 지정된 bioaerosol 샘플링 방법을 보여 줍니다. 이 시스템에서는, 음이온 교환 수 지에서 bioaerosols 부정 청구 바이러스의 효능 농도 액체 치는 행위 기반 공기 샘플링 디바이스와 결합 이다. 따라서, 수 지 bioaerosol 샘플링 워크플로에 추가 농도 단계 역할을 합니다. 바이러스 성 입자의 핵 산 추출 다음 결과 샘플 분자 분석에 대 한 적합 한 음이온 교환 수 지에서 직접 수행 됩니다. 또한,이 프로토콜 사용자 bioaerosol 챔버 다양 한 환경 조건과 환경 변수 온도, 습도, 등의 지속적인 모니터링에 대 한 허용 아래 바이러스 라덴 bioaerosols 생성할 수 설명 바람 속도, 고 졸 대량 농도입니다. 이 프로토콜을 사용 하 여의 주요 장점은 수정 되지 않은 기존의 액체 임 핀 저를 직접 비교를 통해 평가 바이러스 탐지의 감도 증가입니다. 다른 장점은 집중 다양 한 부정 청구 바이러스, 음이온 교환 수 지 (샘플 당 ~$0.14), 및 사용의 용이성의 저렴 한 비용을 포함 합니다. 단점 수 지 흡착 바이러스 성 입자의 infectivity 평가이 프로토콜의 무 능력을 포함 하 고 액체 샘플링 버퍼의 최적화에 대 한 필요는 임 핀 저 내에서 사용 하는 잠재적으로.
이 방법의 목적은 bioaerosols에서 부정 청구 바이러스의 분자 탐지를 촉진 하기 위하여 매우 중요 한 bioaerosol 샘플링 플랫폼을 제공. 미생물, 바이러스 성 입자를 포함 하 여 장시간 시간1bioaerosols에서 살아남을 수 있습니다. Bioaerosols 비교적 긴 거리를 여행 하 고 생존 및 infectivity, 산업 영향 받은 개인에서 6 킬로미터의 거리에 있는 타워에서 Legionnaires' 질병의 발발에 의해 입증으로 유지 수 및 18 사망자2결과. 간접 전송 bioaerosols 중재 하는 인 간에 게 바이러스의 여러 설정에서 발생할 수 있으며 학교와 레스토랑3,4노로바이러스 감염에 대 한 입증 되었습니다. 바이러스의 bioaerosol 전송의 생산 시설5, 바이러스의 운동에 주요 요인으로 간주 되 고이 전송 경로와 마찬가지로, 돼지 및 가금류 농장에서와 같은 농업 설정에서 발생할 수 있습니다. 6 , 7 ....
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1. Bioaerosol 챔버의 설치 ( 그림 2참조)
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그림 1 에서 bioaerosols 액체 기반의 impingers 수 지의 포함을 통해 바이러스의 차지 기반 캡처의 뒤에 원리를 보여 줍니다. 그림 2 는 사용자 bioaerosol 챔버의 설치. 그림 3 에서는 aerosolization 실험 및 측정 품질 관리를 보장 하기 위해 설정에 관련 된 단계를 설명 합니다. 그림 4 는 qRT-PCR bioaerosols에서 캡처한 부정 청구 바이러스의 검출을 위한 증폭 곡선. 표 1 뇌관 및 프로브 qRT-PCR이이 연구에 사용 된 예제에서는 바이러스에 대 한 사용을 보여 줍니다.
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이 프로토콜에서 bioaerosols 수정된 액체 impingers를 사용 하 여 민감한 바이러스 캡처 하는 방법을 설명 합니다. 방법은 탐지 및 정량화 bioaerosols에 바이러스 부하의 최적화 되어 있습니다. 여기 설명 하는 특정 수정 일반적인 액체 임 핀 저 안에 포함 된 액체에 음이온 교환 수 지의 추가 포함 한다. 이 메서드는 원심 분리, 여과, 강 수 기반 방법 등 다른 샘플 처리 기술 이러한 이점을 제공 하지 않는 반면 다운스트림 샘플 처리에 그것의 단순에 대 한 개발 되었다. 핵 산의 추출 대량 elutions에 대 한 필요성 및 궁극적으로 효과적인 샘플에서 감소를 통해 방법의 향상 된 탐지 감도에 기여 하는 여러 샘플 준비 단계를 만듦으로써 수 지에서 직접 수행 볼륨입니다. 또한, 그것은 보였다 그 immobilization 바이러스 성 입자의 고체에 표면 바이러스 핵 산의 증가 한 안정성 또는 바이러스 infectivity17,
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저자는 공개 없다.
이 작품은 농업 건강과 안전 (5U54OH008085)에 대 한 CDC/NIOSH 높은 평야 Intermountain 센터와 콜로라도 생명 과학 발견 평가 그랜트 프로그램 (14BGF-16)에서 자금에 의해 지원 되었다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| Escherichia coli bacteriophage MS2 (ATCC 15597-B1) | American Type Culture Collection | ATCC 15597-B1 | |
| FluMist Quadrivalent | AstraZeneca | Contact manufacturer | 이 백신의 바이러스 성분은 매년 변경될 수 있습니다. |
| CFX96 Touch Real-Time PCR 검출 시스템 | Bio-Rad | 1855195 | |
| 프라이머 및 프로브 | 통합 DNA 기술 | NA | |
| 0.2 &마이크로; M 멸균 필터 | NA | NA | |
| 1L 파이렉스 병 또는 동급 | NA | NA | |
| 1mL 피펫 팁 | NA | NA | |
| 1mL 피펫 NA | |||
| 50mL 혈청학적 피펫 | NA | NA | |
| PCR 튜브 | NA | NA | |
| Pipet-aid 또는 동급 | NA | NA | |
| QIAamp 바이러스 RNA 미니 키트 | Qiagen | 52904 | |
| QuantiTect 프로브 RT-PCR 키트 | Qiagen | 204443 | |
| Amberlite IRA-900 chloride form | Sigma-Aldrich | 216585-500G | |
| 인산염 완충 식염수 | Sigma-Aldrich | P5368-10PAK | |
| 물(분자생물학 등급) | Sigma-Aldrich | W4502-1L | |
| Eppendorf DNA LoBind 마이크로 원심분리기 튜브 | ThermoFisher | 13-698-791 | |
| Falcon 50 mL 원추형 원심분리기 튜브 | ThermoFisher | 14-432-22 | |
| Falcon 폴리프로필렌 원심분리기 튜브 | ThermoFisher | 05-538-62 | |
| SuperScript III Platinum One-Step qRT-PCR Kit w/ROX | ThermoFisher | 11745100 | |
| SKC Biosampler 20 mL, 3-piece glass set | SKC Inc. | 225-9593 | |
| Vac-u-Go 샘플 펌프 | SKC Inc. | 228-9695 | |
| Collison 분무기(6-젯) | BGI Inc. | ||
| HEPA 캡슐 | PALL | 12144 | |
| Q-TRAK 실내 공기질 모니터 8554 | TSI Inc. | ||
| Alnor 속도계 열 풍속계 AVM440-A | TSI Inc. | ||
| SidePak AM510 개인용 에어로졸 모니터 | TSI Inc. | ||
| 바이오에어로졸 챔버 | NA | NA |
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