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방법 논문

면역 형광 측정 바이오 마커 단백질 일상적인 조직 샘플에 대 한 유효성을 검사 하는 표준으로 세포의 양적 Immunoblotting

8.5K 조회수

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DOI:

10.3791/58735

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2019년 1월 7일

 ,  ,  , 

이 논문에서

요약

포 르 말린 조정의 파라핀 끼워 넣어진 조직 샘플 (FFPE)에 관심사의 단백질을 측정 하는 수단으로 이미지 분석와 결합 하 여 면역 형광 조직학 유효성을 양적 immunoblotting 사용 하 여를 설명 합니다. 우리의 결과 일상적인 생 검 견본에 있는 바이오 마커 단백질의 상대적 수량을 ascertaining에 대 한 면역 형광 조직학의 유틸리티를 보여 줍니다.

초록

포 르 말린 조정의 파라핀 끼워 넣어진 조직 샘플 (FFPE)에 관심사의 단백질의 정량화는 임상에서 중요 한 응용 프로그램을 연구 하는 고. 정량화 하는 최적의 방법 정확 하 고 광범위 한 선형 동적 범위를가지고 개별 세포 유형의 식별 수 있도록 샘플의 구조적 무결성을 유지 합니다. Immunohistochemistry (IHC), 질량 분석 등 immunoblotting 현재 방법 각 그들의 범주 특성상 이러한 규정에 맞게 실패 또는 샘플을 균질 필요가 있다. 대체 방법으로 우리는 면역 형광 검사 (IF) 및 FFPE 조직에 관심사의 단백질의 관계 되는 풍부를 결정 하기 위해 이미지 분석의 사용을 제안 합니다. 여기이 방법은 쉽게 최적화 된 넓은 동적 범위를 산출 및 선형 양적 immunoblotting의 황금 표준에 비해 정량은 설명 합니다. 또한,이 메서드는 샘플의 구조적 무결성의 유지 관리를 허용 하 고 진단 응용 프로그램에 중요 한 있을 수 있습니다 다양 한 세포 유형의 구별 허용 합니다. 전반적으로,이 FFPE 샘플에 있는 단백질의 상대적 정량화에 대 한 강력한 방법 이며 임상 적응 하거나 요구를 연구에 쉽게 적용할 수 있습니다.

서론

포 르 말린 조정의 파라핀 끼워 넣어진 (FFPE) 조직 생 검 견본에 있는 단백질을 정할 필요가 많은 임상 분야에 존재 합니다. 예를 들어 일상적인 생 검 표본에서 바이오 마커 단백질의 정량화는 암 환자1에 대 한 치료 예 후를 명료 하 사용 됩니다. 그러나, 현재 메서드는 일반적으로 주관적 및 유효성 검사 부족.

Immunohistochemistry (IHC) 병 리 실험실에서 일상적으로 사용 되 고 일반적으로 1 차적인 항 체 대상 단백질에 지시 및 양 고추냉이 과산화 효소2등 효소 상표로 활용 된 이차 항 체에 따라 달라 집니다. 기존의 IHC 구분, 만들 수 있습니다 사용 분의 샘플링 하 고 그로 인하여 그것의 관련 조직학 컨텍스트 내에서 단백질 식의 평가 허용 하는 조직 샘플의 형태학 무결성을 보존 한다. 그러나, IHC에 의해 생성 된 비 신호 빼기 때문에, 그것은 상대적으로 좁은 동적 범위에서 겪고 있다 고 멀티플렉싱2,,34에 대 한 제한 된 잠재력을 제공. 매트릭스 보조 레이....

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프로토콜

기본 인간의 조직 샘플을 사용 하 여 승인 보건 복지부 산하 교육 병원 연구 윤리 위원회 (HSREB) 여왕의 대학에서 얻은 했다.

1. 건물 셀 라인 조직 Microarray (TMA)

  1. 수확 하 고 세포를 씻어.
    참고:이 프로토콜 (예: 헬러, Jurkat, RCH ACV) 다양 한 설립된 불멸 하 게 셀 라인에서 테스트 되었습니다.
    1. 부착 세포, 그들은 약 80 %confluency 도달 약 1.3 x 107 셀을 수확. 셀 라인에 대 한 적절 한 시 약을 사용 하 여 셀을 분리 합니다.
      참고: Ethylenediaminetetraacetic 산 (EDTA)는 표면 단백질을 저하의 위험을 줄이기 위해 트립 신 이상으로 일반적으로 선호. 트립 신을 사용 하는 경우 셀 수확 직후 소 태아 혈 청 (FBS)를 사용 하 여 트립 신을 중화.
    2. 현 탁 액 셀, 약 8 x 10의7 셀 로그-성장의 단계에서 수확.
    3. 50 mL 원뿔 튜브에 225 x g에 5 분 동안 centrifuging 여 수확/분리 된 세포를 수집 합니다.
    4. 가만히 따르다는 상쾌한 고 다시 인산 염 버퍼 식 염 수 (PBS) X 1....

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결과

이 프로토콜 FFPE 직물 구획으로 만든 셀 라인에서 안티-apoptotic 단백질 Bcl-2의 상대 수량을 결정 하는 경우의 기능 확인을 위해 사용 되었다. 암 세포에 선택적으로 측정 Bcl-2 종양 메커니즘을 명료 하 게 수 고 병 적인 진단 및 임상 관리 결정24알리는에서 유용할 수 있습니다. 좀 더 구체적으로, Bcl-2 적절 한 B-lymphocyte 개발에 역할 그리고의 식은 일반적으로 림프 종25,,2627의 맥락에서 조사. 그림 1 프로토콜에 관련 된 단계를 설명합니다. 초기 면 최적화 단계에서 기본 안티-Bcl-2 항 체의 다양 한 희석 단계 2.1에에서 설명 된 대로 자동된 immunohist.......

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토론

메서드를 설명 하는 우리가 사용 하는 양적 immunoblotting (IB)의 면역 형광 검사 (면)의 유틸리티를 보여 FFPE 조직 샘플에서 대상 단백질의 관계 되는 풍부를 ascertaining에 대 한. 현재 단백질 정량화 방법 비 IHC2,3, 등 그들의 명백한 자연 또는 균질 샘플, 샘플 구조와 세포 인구에 대 한 조사와 같은 방지 하는 필요에 의해 제한 됩니다. IB 및 질량 분석8,9,,1011. 양이 많은 경우 메서드는 유효성을 검사 하 고 신중 하 게 적용 하는 경우 이러한 한계를 초월 수 있습니다. 불멸 하 게 세포의 양적 iIF IF 정보를 비교 하 여 반 정량적 성격의 경우 .......

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공개 사항

저자는 공개 없다.

감사의 글

이 작품은 프레드릭 밴팅과 찰스 베스트 캐나다 대학원 장학금 (오전)에 의해 부분적으로 투자 되었다.

....

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
697DSMZACC 42세포주
JeKo-1ATCCCRL-3006세포주
JurkatATCCTIB-152세포주
RCH-ACVDSMZACC 548세포주
Granta-519DSMZACC 342세포주
REHDSMZACC 22세포주
RajiATCCCCL-86세포주
HeLaATCCCCL-2세포주
트립신/EDTA 용액InvitrogenR001100접착 세포 분리용
소 태아 혈청(FBS)Wisent Inc.81150트립신 중
화 Neutral Buffered Formalin프로토콜245-684세포 펠릿 UltraPure
저 융점 아가로스고정용 Invitrogen15517-022세포 펠릿 주조용
마우스 단클론 항인간 Bcl-2 항체, 클론 124Dako (Agilent)cat#: M088729-2, RRID: 2064429면역불련 및 면역블롯으로 Bcl-2를 검출하기 위해 (lot#:  00095786
Ventana Discovery XTRoche-면역형광 염색 자동화용
EnVision+ 시스템- HRP 표지 폴리머(안티-마우스)Dako(애질런트)K4000면역형광 신호 증폭용
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Bromophenol blueBioShopBRO777Laemlli 완충액
Dithiothreitol (DTT)Bio-Rad161-0611Laemlli 완충
소 혈청 알부민 (BSA)BioShopALB001면역 블롯 세척 단백질
사다리 (Precision Plus Protein Dual Color Standards)Bio-Rad161-0374단백질 젤 여과
지 (매우 두꺼운 오점지)Bio-Rad1703969블로팅 용
전사 니트로셀룰로오스 멤브레인Bio-Rad162-0115블로팅 전사
Trans-blot SD 반건조 전사 셀Bio-Rad1703940반건조 전사용
탈지 분유(무지방 분유)세포 신호 전달 기술9999S차단 완충액용
Tween 20BioShopTWN510세척 완충액용
GAPDH rabbit 단클론 항체Epitomics2251-11차 항체 조절 단백질(lot#: YE101901C)
염소 항-마우스 IgG(HRP 접합) 항체abcamcat#: ab6789, RRID: AB_955439면역블롯
염소 항토끼 IgG(HRP conjugated) 항체abcamcat#: ab6721, RRID: AB_955447면역블롯에 대한 2차 항체(lot#: GR3192725-5)
Clarity Western ECL 기판Bio-Rad1705060면역블롯 신호 감지용
Amersham Imager 600GE Healthcare Life Sciences29083461면역블롯 신호 감지용
ImageJ 소프트웨어프리웨어, NIH-밀도 분석용
면역 형광 단백질 분해 효소 억제제액 용 나트륨 액 용

참고문헌

  1. Khoury, J. D., et al. Validation of Immunohistochemical Assays for Integral Biomarkers in the NCI-MATCH EAY131 Clinical Trial. Clinical Cancer Research. 24 (3), 521-531 (2018).
  2. Matos, L. L., Trufelli, D. C., de Matos, M. G. L., da Silva Pinhal, M. A.

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