이 프로토콜의 목적은 진핵 병원체 인간 노로바이러스의 결합을 박테리아에 정량화하는 것이다. 초기 바이러스-박테리아 부착 분석을 수행한 후, 유동 세포측정은 집단 내에서 바이러스 결합 박테리아를 검출하는 데 사용된다.
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이 프로토콜의 목적은 진핵 병원체 인간 노로바이러스의 결합을 박테리아에 정량화하는 것이다. 초기 바이러스-박테리아 부착 분석을 수행한 후, 유동 세포측정은 집단 내에서 바이러스 결합 박테리아를 검출하는 데 사용된다.
생균은 진핵 바이러스의 감염에 영향을 미치기 위하여 잘 설치됩니다. 병원체와 숙주 미생물군유전체 사이의 직접 결합은 이러한 바이러스의 많은 감염을 변경하는 책임이 있다. 따라서, 바이러스-박테리아 결합의 특성화는 박테리아가 바이러스 감염을 변화시키는 메커니즘(들)을 해명하는 데 필요한 기초 단계이다. 인간 노로 바이러스에 대 한, 연구용 박테리아 B 세포 감염을 향상. 바이러스는 직접 이러한 박테리아에 바인딩, 이 직접 적인 상호 작용 감염 향상의 메커니즘에 관여 하는 것을 나타내는. 방사성 표지된 바이러스 및 중합효소 연쇄 반응(PCR)의 주식 계수를 포함하여 박테리아와 바이러스 간의 상호 작용을 정량화하는 데 다양한 기술을 사용할 수 있습니다. 두 방법 모두 실험실에서 생성해야 할 수도 있는 살아있는 바이러스의 사용을 필요로 합니다. 현재, 인간 노로바이러스에 사용할 수 있는 체외 배양 시스템 중 어느 것도 고농축 바이러스 성 주식의 생성을 허용할 만큼 충분히 견고하지 않다. 살아있는 바이러스 대신에, 바이러스 같이 입자 (VLPs)는 노로바이러스와 박테리아 사이 상호 작용을 특성화하기 위하여 이용되었습니다. 본 명세서에서 유동 세포분석 방법은 그람 음성 및 그람 양성 박테리아에 VLP 결합을 정량화하기 위해 바이러스 특이적 항체를 사용하여 기술된다. 박테리아 만 및 이소형 대조군 모두의 포함은 시험된 박테리아에 대한 VLP 부착의 배경 항체 결합 및 정확한 정량화를 감소시키기 위해 분석법의 최적화를 허용하였다. 높은 VLP: 박테리아 비율은 세균 인구의 큰 비율에 결합하는 VLPs 귀착됩니다. 그러나, VLP 수량 감소 하는 경우, 결합 하는 박테리아의 백분율 또한 감소. 궁극적으로, 이 방법은 노로바이러스:세균 상호 작용을 조절하는 특정 조건 및 구조적 구성 요소를 해명하는 향후 실험에 사용될 수 있다.
인간 노로바이러스(HuNoVs)는 전 세계적으로 위장병의 주요 원인으로,매년6억 8,500만 건의 감염과 200,000명 이상의 사망을 초래합니다. 다른 장내 바이러스와 마찬가지로, 동보 박테리아의 존재는 이 병원체뿐만 아니라 대리 바이러스, 뮤린 노로바이러스2,,3의감염을 향상시키는 것으로 나타났다. 박테리아가 인간 노로 바이러스4,,5,,6에의한 감염을 억제 할 수 있다는 충돌보고서가 있습니다. 여러 바이러스의 경우, 바이러스와 박테리아 간의 직접적인 상호작용은 바이러스감염에영향을 미치는 메커니즘의 근간을 이룬 것으로 나타나며2,7,,8,,9,,10,전자 현미경을 통해 인간 노로바이러스가 ....
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참고: 프로토콜에 설명 된 세균 성장 조건은 Enterobacter cloacae 및 유산 균 gasseri에대 한 표준 배양 조건. 바이러스를 수행하기 위하여:박테리아 부착 분석은 그밖 세균종으로, 선택된 박테리아는 박테리아를 위해 적당한 표준 조건 하에서 배양되어야 합니다.
1. 세균 성장 배지 준비
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공생 박테리아에 결합하는 인간 노로바이러스 VLP를 정량화하는 데 사용되는 게이팅 전략은 도 1에나타내었다. 대표적인 밀도 도트는 VLP 부착이 단일 집단에서 결정되도록 세포 파편 및 세포 덩어리를 제거하기 위해 시료를 문게 한 방법에 대한 개요를제공합니다(그림 1A). 대표적인 히스토그램은 이소형 조절 항체로 염색된 VLP-박테리아 시료의 노로바이러스 VLP 및 낮은 배경 신호가 결여된 시료에서만 항노로바이러스 항체 신호의 낮은 수준을 입증한다(도1B). 이소타입 제어 피크는 또한 얼룩이 없는 샘플과 겹치면서 동일한 시료를 반인간 노로바이러스 GII 항체로 염색하면 피크에서 상당한 변화가 발생합니다.
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박테리아에 장바이러스의 결합을 정량화하는 기능은 이 박테리아가 바이러스성 감염을 바꾸는 기계장치를 해명하기 위한 중요한 첫번째 단계입니다. 본 명세서에 기재된 방법은 인간 노로바이러스 VLP 상호작용을 E. 클로아카(gram-negative 박테리아) 및 L. gasseri(그람 양성 박테리아)와 측정하도록 최적화되었지만, 임의의 포유류 바이러스 및 관심 있는 박테리아와 함께 사용하도록 적응될 수 있다. VLPs는 부착 분석에서 사용하기 위한 살아있는 바이러스에 대한 이상적인 대안이며 이들 입자는 유세포 분석기를 사용하여 쉽게 정량화될 수 있지만, P 입자는 또한 인간 노로바이러스와박테리아(24)사이의 상호작용을 조사하기 위해 사용되어 왔다. 이 연구에서는, 박테리아에 결합된 바이러스의 양은 세균 집단과 반대로 정량화되었다, 여기에서 보고되는 바와 같이. P 입자는 VLP 및 야생형
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저자는 이해 관계의 충돌이 없습니다.
수토누카 바르와 샤넬 모스비-하운드루프가 작성된 원고에 대한 비판적 검토와 세균 표준 곡선 생성에 도움을 준 알폰소 카릴로에게 감사드립니다. 이 작품은 건강의 국립 연구소에서 보조금에 의해 부분적으로 자금 (R21AI140012) 플로리다 대학에서 종자 보조금에 의해, 식품 및 농업 과학 연구소.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 5ml 폴리스렌 라운드 바텀 튜브(셀 스트레이너 캡 포함 | Corning | 352235 | 항체 염색 후 샘플은 유세포 분석을 위해 튜브로 옮겨집니다. |
| Agar | Sigma | A7002 | 배지 준비에 사용 |
| AnaeroPack | Thermo Scientific | R681001 | Lactobacillus gasseri |
| BD FacsDiva 소프트웨어 | |||
| BD LSR Fortessa 유세포 분석기 | |||
| 소 혈청 알부민 | Fisher Bioreagents | BP1605 | 유세포 분석에 사용 |
| 유세포 분석 염색 완충액(FCSB) | BD Biosciences | 554657 | 유세포 분석 |
| 마우스 IgG2b kappa Isotype Control (eBMG2b), PE, eBioscience | Thermo Fisher Scientific | 12473281 | Isotype control에 사용됩니다. 이 항체는 제조업체에서 접합 형태로 구입합니다. |
| MRS Powder | BD Biosciences | 288130 | 배지 준비 및 락토바실러스 가세리 배양에 사용됩니다. |
| Norovirus capsid G2 Monoclonal Antibody (L34D) | Thermo Fisher Scientific | MA5-18241 | Norovirus GII 항체. 이 항체는 unconjugated 형태로만 사용할 수 있으므로 설명된 유세포 분석 분석에서 사용하기 전에 형광 접합해야 합니다. 이 프로토콜에서 PE는 선택된 형광이었지만 연구원이 사용하는 유세포 분석기에 가장 적합한 다른 형광 분자를 선택할 수 있습니다. |
| 노로바이러스 GII.4 VLP | Creative Biostructure | CBS-V700 | 인간 노로바이러스 유사 입자, VLP는 바큘로바이러스 시스템을 사용하여 생성되었으며 10% 글리세롤이 함유된 인산염 완충 식염수에 재현탁되었습니다. 저자는 VLP의 입자 농도를 결정하기 위해 독립적인 나노사이트 추적 분석을 수행했습니다. 농도는 밀리리터당 약 1011 VLP입니다. VLP의 단백질 농도에 따라 VLP 부착 분석에서 박테리아당 약 200개의 입자가 추가됩니다. |
| PBS 10X | Fisher Bioreagents | BP665 | 사용하기 전에 1X로 희석하십시오. |
| SiteClick R-PE 항체 라벨링 키트 | Thermo Fisher Scientific | S10467 | 접합 키트는 비접합 항체를 라벨링하는 데 사용됩니다. |
| 염화나트륨 | Fisher Scientific | S271 | 배지 준비에 사용 |
| Tryptone | Oxoid | LP0042 | 미디어 준비에 사용 |
| 튜브 리볼버 | ThermoFisher Scientific | 88881001 | 바이러스에 사용: 박테리아 부착 분석. 최대 속도(40rpm)로 설정합니다. |
| 효모 추출물 | BD Biosciences | 212750 | 배지 준비에 사용 |
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