Summary

Mikroskopitekniker för tolkning av svampkolonisering i mykoheterotrofa växtvävnader och symbiotisk spiring av frön

Published: May 17, 2022
doi:

Summary

Detta protokoll syftar till att tillhandahålla detaljerade procedurer för insamling, fixering och underhåll av mykoheterotrofa växtprover, med tillämpning av olika mikroskopitekniker som skannings- och överföringselektronmikroskopi, ljus-, konfokal- och fluorescensmikroskopi för att studera svampkolonisering i växtvävnader och frön groddar med mykorrhizasvampar.

Abstract

Strukturell botanik är ett oumbärligt perspektiv för att fullt ut förstå växternas ekologi, fysiologi, utveckling och utveckling. När man undersöker mykoheterotrofa växter (dvs växter som får kol från svampar) kan anmärkningsvärda aspekter av deras strukturella anpassningar, mönstren för vävnadskolonisering av svampar och morfoanatomin hos underjordiska organ upplysa deras utvecklingsstrategier och deras relationer med hyfer, källan till näringsämnen. En annan viktig roll av symbiotiska svampar är relaterad till spiring av orkidéfrön; alla Orchidaceae-arter är mykoheterotrofa under groning och plantor (initial mykoheterotrofi), även de som fotosyntetiserar i vuxna stadier. På grund av bristen på näringsreserver i orkidéfrön är svampsymbionter viktiga för att ge substrat och möjliggöra spiring. Att analysera grobarhetsstadier med strukturella perspektiv kan också svara på viktiga frågor om svamparnas interaktion med fröna. Olika avbildningstekniker kan tillämpas för att avslöja svampendofyter i växtvävnader, som föreslås i denna artikel. Frihand och tunna delar av växtorgan kan färgas och sedan observeras med hjälp av ljusmikroskopi. En fluorokrom konjugerad till vetegroddar agglutinin kan appliceras på svamparna och inkuberas tillsammans med Calcofluor White för att markera växtcellväggar i konfokalmikroskopi. Dessutom beskrivs metoderna för skanning och överföringselektronmikroskopi för mykoheterotrofa orkidéer, och möjligheterna att tillämpa sådana protokoll i besläktade växter undersöks. Symbiotisk spiring av orkidéfrön (dvs i närvaro av mykorrhizasvampar) beskrivs i protokollet i detalj, tillsammans med möjligheter att förbereda strukturerna erhållna från olika stadier av spiring för analyser med ljus-, konfokal- och elektronmikroskopi.

Introduction

Strukturforskning inom botanik, som omfattar växtmorfologi och anatomi, är grundläggande för att förstå hela organismen1,2 och ger oumbärliga perspektiv för att integrera och bidra till kunskap om växters ekologi, fysiologi, utveckling och utveckling3. Metoder inom växtmorfologi och anatomi omfattar för närvarande protokoll, utrustning och kunskap som utvecklats nyligen såväl som för mer än ett sekel sedan2. Det kontinuerliga utförandet och anpassningen av klassiska metoder (t.ex. ljusmikroskopi) tillsammans med nyare tekniker (t.ex. konfokalmikroskopi, röntgenmikrotomografi) har samma väsentliga grund: teoretisk kunskap som möjliggör utveckling av en metod.

Huvudverktyget i växtanatomi och morfologi är bilden. Trots missuppfattningen att sådana analyser är enkla observationer, vilket ger utrymme för subjektiva tolkningar2, kräver analys och förståelse av bilder inom detta område kunskap om de metoder som tillämpas (utrustning, typ av analys, metodologiska förfaranden), cellkomponenter, histokemi och växtkroppen (vävnadsorganisation och funktion, ontogeni, morfologiska anpassningar). Tolkning av de bilder som erhållits via en mängd olika metoder kan leda till korrelerande form och funktion, dechiffrera den kemiska sammansättningen av en struktur, bekräfta i beskrivningen av taxa, förstå infektioner av fytopatogener och andra sådana bedömningar.

När man undersöker mykoheterotrofa (MH) växter (dvs. icke-fotosyntetiska växter som erhåller kol från mykorrhizasvampar4,5), kan anmärkningsvärda aspekter av deras strukturella anpassningar, mönstren för vävnadskolonisering av svampar och morfoanatomin hos underjordiska organ upplysa deras utvecklingsstrategier och relationer med hyfer, som är källan till näringsämnen. De underjordiska organen hos MH-växter visar vanligtvis viktiga anpassningar relaterade till deras förening med marksvampar, därför är det viktigt att utföra dessa anatomiska och morfologiska undersökningar6. MH-arters luftorgan bör inte ignoreras, eftersom endofyter också kan finnas i dessa vävnader, även om de inte är mykorrhizasvampar (personliga observationer, inte publicerade ännu).

Förutom den väletablerade väsentligheten hos mykorrhizasvampar som associeras med MH-arter under hela deras livscykel7, har varje orkidéart, även de autotrofa, ett initialt obligatoriskt mykoheterotrofiskt stadium i naturliga miljöer. Det uppstår eftersom orkidéernas embryo är odifferentierat och saknar endosperm eller kotyledoner, vilket är oförmöget att utveckla och etablera sig i naturliga miljöer utan näringsstöd från svamppartners 4,8. Med tanke på detta kan symbiotiska grobarhetsprotokoll tillämpas inte bara på MH-arter utan också på fotosyntetiserande orkidéer, som syftar till att undersöka orkidé-svampspecificitet vid grobarhet och protocormutveckling, en mycket tillämpad metod i initiativ för bevarande av hotade arter 9,10,11.

I denna metodsammansättning beskriver vi viktiga steg som är involverade i insamling, fixering och lagring av MH-växtprover för anatomiska studier (avsnitt 1), ytanalys och provval (avsnitt 2), sektionsmetoder (frihand: avsnitt 3, mikrotomi: avsnitt 4, kryomikrotomi: avsnitt 5), färgning och montering (avsnitt 6), fluorescens och konfokalmikroskopi av svampendofyter (avsnitt 7), svepelektronmikroskopi (avsnitt 8), och transmissionselektronmikroskopi (avsnitt 9). Dessutom beskriver vi en symbiotisk grobarhetsmetod för orkidéfrön (MH och autotrofisk, avsnitt 10), eftersom de tidigare nämnda avbildningsmetoderna framgångsrikt kan tillämpas för att analysera svampkolonisering av frön, protokormer och plantor i groningsprocessen.

Figure 1
Figur 1: Schematisk sammanfattning av avbildningsmetoder. Scheman ger indikationer på protokollsteg där de är detaljerade. Förkortningar: GMA = glykolmetakrylat, OCT = optimal skärtemperaturförening, SEM = svepelektronmikroskopi. Klicka här för att se en större version av denna siffra.

De mikroskopitekniker som beskrivs här i detalj (figur 1) föregås av följande viktiga steg: insamling, fixering, uttorkning, inbäddning och sektionering av prover. Eftersom stegen är variabla (figur 1) beroende på den eller de valda teknikerna är det viktigt att tänka framåt, med tanke på de fixeringsmedel som ska beredas och transporteras till uppsamlingsplatsen, hur proverna måste beredas innan de fixeras, de uttorkningsprocesser som ska användas (avsnitt 1) och olika inbäddningsmöjligheter och sektioneringsmetoder (avsnitt 4, 5). och 9). Figur 1 sammanfattar sekventiellt alla steg som krävs för varje mikroskopiteknik som beskrivs noggrant nedan.

Protocol

1. Insamling, fixering och underhåll av prover OBS: Helt MH-växter kan vanligtvis hittas i den mörka skogen understory 12,13, främst i fuktiga och kullrika områden, medan delvis MH-växter finns i mer öppna skogar12,13. MH-växter har vanligtvis välutvecklade underjordiska organ i olika former och storlekar. När du samlar MH-arter, utforska jo…

Representative Results

Efter de väsentliga stadierna för fixering av växtvävnad ger cellulära strukturer så lika som möjligt till levande tillstånd, med tanke på morfologi, volym och rumslig organisation av cellulära komponenter och vävnader16. Observera sådana egenskaper i proverna efter kemisk fixering (figur 4). Figur 4C-F representerar tillräckligt fixerade prover under ljusmikroskopi. Att följa de beskrivna f…

Discussion

Bildanalyser inom växtanatomi och morfologi har en viktig potential att uppfylla mål och hjälpa till att förstå sambanden mellan mykoheterotrofa växter och deras oumbärliga svampendofyter, vilket framgår av studier av underjordiska organ6,40, strukturella analyser av symbiotisk spiring av frön39 och luft- och reproduktionsstrukturer 41 . Strukturell botanik, trots att den har förlorat sin prestige och sitt…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Författarna tackar finansiering från FAEPEX och FAPESP (2015/26479-6). MPP tackar Capes för hans magisterexamen stipendium (process 88887.600591/2021-00) och CNPq. JLSM tackar CNPq för produktivitetsbidrag (303664/2020-7). Författarna tackar också tillgången till utrustning och hjälp från LME (Laboratory of Electron Microscopy – IB / Unicamp), INFABiC (National Institute of Science and Technology on Photonics Applied to Cell Biology – Unicamp) och LaBiVasc (Laboratory of Vascular Biology – DBEF / IB / Unicamp); LAMEB (UFSC) och Eliana de Medeiros Oliveira (UFSC) för bidrag till kryoskyddsprotokollet; LME för bidrag till TEM-protokollet.

Materials

Acetone Sigma-Aldrich 179124 (for SEM stubs mounting)
Agar-agar (AA) Sigma-Aldrich A1296 (for seeds germination tests)
Calcofluor White Stain Sigma-Aldrich 18909 fluorescent dye (detects cellulose)
Citrate Buffer Solution, 0.09M pH 4.8 Sigma-Aldrich C2488 (for toluidine blue O staining)
Conductive Double-Sided Carbon Tape Fisher Scientific 50-285-81 (for SEM)
Confocal Microscope Zeiss (any model)
Copper Grids Sigma-Aldrich G4776 (for TEM)
Critical-point dryer Balzers (any model)
Cryostat Leica Biosystems (any model)
Dissecting microscope Leica Biosystems (= stereomicroscope, any model)
Entellan Sigma-Aldrich 107960 rapid mounting medium for microscopy
Ethyl alcohol, pure (≥99.5%) Sigma-Aldrich 459836 (= ethanol, for dehydration processes)
Formaldehyde solution, 37% Sigma-Aldrich 252549 (for NBF solution preparation)
Formalin solution, neutral buffered, 10% Sigma-Aldrich HT501128 histological tissue fixative
Gelatin capsules for TEM Fisher Scientific 50-248-71 (for resin polymerisation in TEM)
Gelatin solution, 2% in H2O Sigma-Aldrich G1393 (dilute for slides preparation – OCT adherence)
Glutaraldehyde solution, 25% Sigma-Aldrich G6257 (for Karnovsky’s solution preparation)
HistoResin Leica Biosystems 14702231731 glycol methacrylate (GMA) embedding kit
Iodine Sigma-Aldrich 207772 (for Lugol solution preparation)
Lead(II) nitrate Sigma-Aldrich 228621 Pb(NO3)2 (for TEM contrast staining)
Light Microscope Olympus (any model)
LR White acrylic resin Sigma-Aldrich L9774 hydrophilic acrylic resin for TEM
Lugol solution Sigma-Aldrich 62650 (for staining)
Metal stubs for specimen mounts Rave Scientific (for SEM, different models)
Microtome Leica Biosystems manual rotary microtome or other model
Oatmeal agar (OMA) Millipore O3506 (for seeds germination tests)
OCT Compound, Tissue-Tek Sakura Finetek USA 4583 embedding medium for frozen tissues
Osmium tetroxide Sigma-Aldrich 201030 OsO4 (for TEM postfixation)
Parafilm M Sigma-Aldrich P7793 sealing thermoplastic film
Paraformaldehyde Sigma-Aldrich 158127 (for Karnovsky’s solution preparation)
Poly-L-lysine solution, 0.1% in H2O Sigma-Aldrich P8920 (for slides preparation – OCT adherence)
Poly-Prep Slides Sigma-Aldrich P0425 poly-L-lysine coated glass slides
Polyethylene Molding Cup Trays Polysciences 17177A-3 (6x8x5 mm, for embbeding samples in GMA resin)
Polyethylene Molding Cup Trays Polysciences 17177C-3 (13x19x5 mm, for embbeding samples in GMA resin)
Potassium iodide Sigma-Aldrich 221945 (for Lugol solution preparation)
Potato Dextrose Agar (PDA) Millipore 70139 (for seeds germination tests)
Scanning Electron Microscope Jeol (any model)
Silane [(3-Aminopropyl)triethoxysilane] Sigma-Aldrich A3648 (for slides preparation – OCT adherence)
Silane-Prep Slides Sigma-Aldrich S4651 glass slides coated with silane
Silica gel orange, granular Supelco 10087 (for dessicating processes)
Sodium cacodylate trihydrate Sigma-Aldrich C0250 (for glutaraldehyde-sodium cacodylate buffer)
Sodium hydroxide Sigma-Aldrich S5881 NaOH (for Karnovsky’s solution preparation and TEM contrast staining)
Sodium hypochlorite solution Sigma-Aldrich 425044 NaClO (for seeds surface disinfection)
Sodium phosphate dibasic, anhydrous Sigma-Aldrich 71640 Na2HPO4 (for NBF solution and PB preparation)
Sodium phosphate monobasic monohydrate Sigma-Aldrich S9638 NaH2PO4·H2O (for NBF and PB)
Sputter coater Balzers (any model)
Sucrose Sigma-Aldrich S0389 C12H22O11 (for cryoprotection and germination test)
Sudan III Sigma-Aldrich S4131 (for staining)
Sudan IV Sigma-Aldrich 198102 (for staining)
Sudan Black B Sigma-Aldrich 199664 (for staining)
Syringe (3 mL, any brand, for TEM contrast staining)
Syringe Filter Unit, Millex-GV 0.22 µm Millipore SLGV033R PVDF, 33 mm, gamma sterilized (for TEM contrast staining)
Tek Bond Super Glue 793 Tek Bond Saint-Gobain 78072720018 liquid cyanoacrylate adhesive, medium viscosity
Toluidine Blue O Sigma-Aldrich T3260 (for staining)
Transmission Electron Microscope Jeol (any model)
Triphenyltetrazolium chloride Sigma-Aldrich T8877 (for the tetrazolium test in seeds germination)
Trisodium citrate dihydrate Sigma-Aldrich S1804 Na3(C6H5O7)·2H2O (for TEM contrast staining)
Ultramicrotome Leica Biosystems (any model)
Uranyl acetate Fisher Scientific 18-607-645 UO2(CH3COO)2 (for TEM contrast staining)
Vacuum pump (any model)
Wheat Germ Agglutinin, Alexa Fluor 488 Conjugate TermoFisher Scientific W11261 fluorescent dye-conjugated lectin (detects sialic acid and N-acetylglucosaminyl residues)

References

  1. Evert, R. F. . Esau’s Plant Anatomy: Meristems, Cells, and Tissues of the Plant Body: Their Structure, Function, and Development. , (2006).
  2. Yeung, E. C. T., Stasolla, C., Sumner, M. J., Huang, B. Q. . Plant Microtechniques and Protocols. , (2015).
  3. Sokoloff, D. D., Jura-Morawiec, J., Zoric, L., Fay, M. F. Plant anatomy: at the heart of modern botany. Botanical Journal of the Linnean Society. 195 (3), 249-253 (2021).
  4. Leake, J. R. The biology of myco-heterotrophic (‘saprophytic’) plants. New Phytologist. 127 (2), 171-216 (1994).
  5. Bidartondo, M. I. The evolutionary ecology of myco-heterotrophy. New Phytologist. 167 (2), 335-352 (2005).
  6. Imhof, S., Massicotte, H. B., Melville, L. H., Peterson, R. L. Subterranean morphology and mycorrhizal structures. Mycoheterotrophy. , 157-214 (2013).
  7. Rasmussen, H. N., Rasmussen, F. N. Orchid mycorrhiza: implications of a mycophagous life style. Oikos. 118 (3), 334-345 (2009).
  8. Rasmussen, H. N., Dixon, K. W., Jersáková, J., Těšitelová, T. Germination and seedling establishment in orchids: a complex of requirements. Annals of Botany. 116 (3), 391-402 (2015).
  9. Zettler, L. W. Terrestrial orchid conservation by symbiotic seed germination: techniques and perspectives. Selbyana. 18 (2), 188-194 (1997).
  10. Stewart, S. L., Kane, M. E. Symbiotic seed germination and evidence for in vitro mycobiont specificity in Spiranthes brevilabris (Orchidaceae) and its implications for species-level conservation. In Vitro Cellular & Developmental Biology – Plant. 43 (3), 178-186 (2007).
  11. Zhao, D. -. K., et al. Orchid reintroduction based on seed germination-promoting mycorrhizal fungi derived from protocorms or seedlings. Frontiers in Plant Science. 12, 701152 (2021).
  12. Selosse, M. A., Roy, M. Green plants that feed on fungi: facts and questions about mixotrophy. Trends in Plant Science. 14 (2), 64-70 (2009).
  13. Merckx, V. S. F. T., Mennes, C. B., Peay, K. G., Geml, J. Evolution and diversification. Mycoheterotrophy: The Biology of Plants Living on Fungi. , 215-244 (2013).
  14. Boon, M. E., Drijver, J. Routine Cytological Staining Techniques: Theoretical Background and Practice. Macmillan International Higher Education. , (1986).
  15. Karnovsky, M. A formaldehyde-glutaraldehyde fixative of high osmolality for use in electron microscopy. Journal of Cell Biology. 27 (2), 137-138 (1964).
  16. Hayat, M. . Fixation for Electron Microscopy. , (1981).
  17. Roland, J. C., Vian, B. General preparation and staining of thin sections. Electron Microscopy of Plant Cells. 1, 675 (1991).
  18. Gerrits, P. O., Horobin, R. W. Glycol methacrylate embedding for light microscopy: basic principles and trouble-shooting. Journal of Histotechnology. 19 (4), 297-311 (1996).
  19. Zhang, Z., Niu, L., Chen, X., Xu, X., Ru, Z. Improvement of plant cryosection. Frontiers in Biology. 7 (4), 374-377 (2012).
  20. BeneŠ, K. On the media improving freeze-sectioning of plant material. Biologia Plantarum. 15 (1), 50-56 (1973).
  21. Fischer, A. H., Jacobson, K. A., Rose, J., Zeller, R. Preparation of slides and coverslips for microscopy. Cold Spring Harbor Protocols. 2008 (5), (2008).
  22. Sakai, W. S. Simple method for differential staining of paraffin embedded plant material using toluidine blue O. Stain Technology. 48 (5), 247-249 (1973).
  23. O’Brien, T., Feder, N., McCully, M. E. Polychromatic staining of plant cell walls by toluidine blue O. Protoplasma. 59 (2), 368-373 (1964).
  24. Ventrella, M. C., Almeida, A. L., Nery, L. A., Coelho, V. P. d. e. M. Métodos Histoquímicos Aplicados às Sementes. Universidade Federal de Viçosa. , (2013).
  25. Pearse, A. G. E. . Histochemistry, Theoretical and Applied. , (1960).
  26. Andrade-Linares, D. R., Franken, P. Fungal endophytes in plant roots: taxonomy, colonization patterns, and functions. Symbiotic Endophytes. , 311-334 (2013).
  27. Wymer, C. L., Beven, A. F., Boudonck, K., Lloyd, C. W. Confocal microscopy of plant cells. Confocal Microscopy Methods and Protocols. , 103-130 (1999).
  28. Marques, J. P. R., Soares, M. K. M. Manual de Técnicas Aplicadas à Histopatologia Vegetal. FEALQ. , (2021).
  29. Navarro, B. L., Marques, J. P. R., Appezzato-da-Glória, B., Spósito, M. B. Histopathology of Phakopsora euvitis on Vitis vinifera. European Journal of Plant Pathology. 154 (4), 1185-1193 (2019).
  30. Marques, J. P. R., et al. Sugarcane cell wall-associated defense responses to infection by Sporisorium scitamineum. Frontiers in Plant Science. 9, 698 (2018).
  31. Jeffree, C. E., Read, N. D. Ambient-and low-temperature scanning electron microscopy. Electron Microscopy of Plant Cells. , 313-413 (1991).
  32. Bozzola, J. J., Russell, L. D. . Electron Microscopy: Principles and Techniques for Biologists. , (1999).
  33. Murray, S. Basic transmission and scanning electron microscopy. Introduction to electron Microscopy for Biologists. , 3-18 (2008).
  34. . Glossary of TEM terms Available from: https://www.jeol.co.jp/en/words/emterms/ (2021)
  35. Seaton, P. T., et al. Orchid seed and pollen: a toolkit for long-term storage, viability assessment and conservation. Orchid Propagation: From Laboratories to Greenhouses—Methods and Protocols. , 71-98 (2018).
  36. Otero, J. T., Ackerman, J. D., Bayman, P. Differences in mycorrhizal preferences between two tropical orchids. Molecular Ecology. 13 (8), 2393-2404 (2004).
  37. Koch, R. A., et al. Marasmioid rhizomorphs in bird nests: Species diversity, functional specificity, and new species from the tropics. Mycologia. 112 (6), 1086-1103 (2020).
  38. Webster, J., Weber, R. . Introduction to Fungi. , (2007).
  39. Sisti, L. S., et al. The role of non-mycorrhizal fungi in germination of the mycoheterotrophic orchid Pogoniopsis schenckii Cogn. Frontiers in Plant Science. 10, 1589 (2019).
  40. Martos, F., et al. Independent recruitment of saprotrophic fungi as mycorrhizal partners by tropical achlorophyllous orchids. New Phytologist. 184 (3), 668-681 (2009).
  41. Alves, M. F., et al. Reproductive development and genetic structure of the mycoheterotrophic orchid Pogoniopsis schenckii Cogn. BMC Plant Biology. 21 (1), 332 (2021).
  42. Merckx, V. S. F. T. Mycoheterotrophy: an introduction. Mycoheterotrophy: The Biology of Plants Living on Fungi. , 1-17 (2013).
  43. Hall, J. L., Hawes, C. . Electron Microscopy of Plant Cells. , (1991).
check_url/kr/63777?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Pena-Passos, M., Sisti, L. S., Mayer, J. L. S. Microscopy Techniques for Interpreting Fungal Colonization in Mycoheterotrophic Plants Tissues and Symbiotic Germination of Seeds. J. Vis. Exp. (183), e63777, doi:10.3791/63777 (2022).

View Video