Denna studie presenterar ett nytt protokoll för att direkt applicera mekanisk kraft på cellkärnan genom magnetiska mikrober som levereras in i cytoplasman och för att genomföra samtidig fluorescerande avbildning av levande celler.
En grundläggande fråga inom mekanobiologin är hur levande celler känner av extracellulära mekaniska stimuli i samband med cellfysiologi och patologi. Den cellulära mekano-känslan av extracellulära mekaniska stimuli tros vara genom membranreceptorerna, det associerade proteinkomplexet och cytoskeletten. Nya framsteg inom mekanobiologi visar att cellkärnan i cytoplasma själv självständigt kan känna av mekaniska stimuli samtidigt. En mekanistisk förståelse av hur cellkärnan känner av, omvandlar och svarar på mekaniska stimuli saknas dock, främst på grund av de tekniska utmaningarna med att komma åt och kvantifiera kärnmekaniken med konventionella verktyg. Detta dokument beskriver design, tillverkning och implementering av ett nytt magnetiskt kraftställdon som tillämpar exakta och icke-invasiva 3D-mekaniska stimuli för att direkt deformera cellkärnan. Med hjälp av CRISPR/Cas9-konstruerade celler visar denna studie att detta verktyg, i kombination med högupplöst konfokal fluorescerande avbildning, möjliggör avslöjandet av realtidsdynamiken hos ett mekanokänsligt ja-associerat protein (YAP) i enskilda celler som en funktion av kärndeformation. Denna enkla metod har potential att överbrygga det nuvarande teknikgapet i mekanobiologisamhället och ge svar på den kunskapslucka som finns i förhållandet mellan kärnmekanotransduktion och cellfunktion.
Denna studie syftar till att utveckla och tillämpa en ny teknik för att belysa kärnmekanobiologi genom att kombinera de magnetiska ställdonen som applicerar mekanisk kraft direkt på cellkärnan och den konfokala fluorescensmikroskopin som samtidigt avbildar de strukturella och funktionella subcellulära förändringarna. Celler känner av extracellulära biofysiska signaler inklusive vävnadsstyvhet 1,2,3,4, interstitiellt vätsketryck och skjuvspänning 5,6,7, yttopologi/geometri 8,9,10,11,12 och spännings-/kompressionsspänning13,14, 15,16. Biofysiska signaler omvandlas till biokemiska signaler och utlöser potentiella nedströmsförändringar av genuttryck och cellbeteenden – en process som kallas mekanotransduktion 17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27 . För att studera mekanotransduktionsprocesser har en myriad av tekniker utvecklats för att tillämpa mekanisk kraft på cellerna, såsom atomkraftmikroskopi28, cellsträckningsanordning29, bio-MEMS (mikroelektromekaniska system) kraftsensor 15,30,31, skjuvreologi 32 och Stereo Vision System 33 . En ny granskning sammanfattar metoderna för att tillämpa extracellulära mekaniska ledtrådar och störa mekanosensering34. Hittills tillämpar de flesta av dessa metoder kraft på cellplasmamembranet, och celler tar direkt emot dessa extracellulära biofysiska signaler via membranreceptorer såsom integrin, kadherin, jonkanaler och G-proteinkopplade receptorer. Därefter sänder de signalen till den intracellulära cytoskeletten och kärnan. Till exempel, med hjälp av ja-associerad protein (YAP) translokation som en indikator på mekano-avkänning, visas celler att känna av de mekaniska signalerna om substratstyvhet och extracellulär spänning från cellmembranet och överföra dem genom cytoskeletten till kärnan för att inducera YAP-cytoplasma-till-kärntranslokation28,35.
Nya bevis tyder på att själva cellkärnan är en oberoende mekanosensor 8,36,37. Detta bevisas av experiment som utförs på den isolerade kärnan som skördats från celler, där det avslöjades att kärnor adaptivt ändrar sin styvhet som svar på den mekaniska kraften som direkt appliceras på dem36. Under många fysiologiska förhållanden känner kärnor i både tumör- och friska celler av extracellulära biofysiska signaler och ändrar deras mekaniska egenskaper och sammansättningar38,39,40. Till exempel, vid extravasation, minskar tumörcellernas kärnstyvhet och upprätthåller mjukhet i över 24 timmar38. Under migration genom begränsat interstitiellt utrymme förlorar kärnorna i tumörceller ofta och återställer sin strukturella integritet39. Hur kärnan känner av den biofysiska signalen är dock okänt, även om flera kärnhöljeproteiner och familjer av proteiner har visat sig vara inblandade, såsom Lamin A / C och linker av nukleoskelett och cytoskelett (LINC) komplex38,41. Därför kommer nya icke-invasiva metoder som direkt kan applicera kraft på kärnan att frikoppla effekten av kraftöverföring från cellplasmamembranet och cytoskelettet och kommer att hjälpa till att belysa de tidigare otillgängliga molekylära mekanismerna för kärnmekanoavkänning.
Forskning som använde optisk pincett för att manipulera organeller42 och mikrober injicerade i celler43 visade den tekniska förmågan att direkt applicera kraft på kärnan. Den optiska pincetttekniken har emellertid flera begränsningar: (1) optisk pincett med låg genomströmning manipulerar ofta bara en cell eller mikrob åt gången; och (2) potentiell fotoskada och temperatur artefakt-deformation av kärnkraft kräver tiotals pN36, och motsvarande nödvändiga lasereffekt är cirka 10 mW per pN44,45. Sådan laserintensitet är tillräcklig för att utlösa fotoskador i cellerna och störa cellfunktionerna under experimentet46.
Magnetisk kraft applicerad genom mikrober i levande celler visar potentialen att direkt applicera kraft på kärnan och övervinner begränsningarna hos optisk pincett. När mikrober levereras in i cytoplasman kan ett magnetfält utöva en magnetisk kraft på flera mikrober samtidigt på ett sätt med hög genomströmning. Magnetfältet påverkar inte cellfunktioner47, men genererar kraft från pN till nN, vilket är tillräckligt för att inducera kärndeformation 36,48,49. Hittills har manipulation av magnetiska mikrober applicerats på cellplasmamembran48, inuti cytoplasman50, på F-aktin51, inuti kärnan47 och på den isolerade kärnan36. Magnetisk manipulation av mikrober har emellertid aldrig använts för att applicera direkt mekanisk kraft på kärnhöljet för att studera mekanotransduktion i kärnan.
I detta dokument utvecklas en enkel teknik för att icke-invasivt leverera magnetiska mikrober till cytoplasman och använda dessa mikrober för att applicera mekanisk kraft på kärnan (figur 1). Här används CRISPR / Cas9-konstruerade mänskliga normala B2B-cellinjer som endogent uttrycker mNeonGreen21-10/11-taggad YAP för att validera metoden. YAP är ett mekanokänsligt protein, och translokationen av YAP regleras av kärnmekanoavkännande 14,28. Den CRISPR/Cas9-reglerade knock-in-metoden valdes för att märka endogen YAP med ett fluorescerande protein (FP) mNeonGreen21-10/11. Även om CRISPR-redigering är känd för att ha ofullständig effektivitet och off-target-effekt, integrerade protokollen i tidigare publikationer fluorescenssortering för att välja för korrekt öppen läsraminsättning52,53,54. Med detta ytterligare urvalslager observerades ingen taggningshändelse utanför målet i 20+ cellinjer som tidigare genererat52,53,54,55. Detta är en delad fluorescerande proteinkonstruktion, men i princip kan vilken uttryckbar fluorescerande tagg som helst vara användbar. Denna märkningsmetod är överlägsen transgen- eller antikroppsmetoder. För det första, till skillnad från transgenuttrycket, upprätthåller det taggade proteinet enkopiegendosering och uttrycker sig i det fysiologiska sammanhanget för det inhemska genreglerande nätverket, vilket begränsar avvikelser i proteinkoncentration, lokalisering och interaktion. Taggningsmetoden som används i denna studie uppnår över en storleksordning högre genomströmning och effektivitet än full FP-taggning. Det undviker också utmaningar i samband med immunofluorescens på grund av fixeringsartefakter och den begränsade tillgången på högkvalitativa antikroppar med hög specificitet. För det andra gör tillvägagångssättet som används i detta dokument minimal störning av cellfysiologin och möjliggör realtidsuppenbarelse av alla endogena YAP: er autentiskt. Däremot leder andra vanliga transgenmetoder ofta till överuttryck av YAP. Den resulterande artificiella fördelningen kan potentiellt orsaka cytotoxicitet och påverka mekanoavkänning av celler56,57,58.
Denna studie presenterar ett protokoll för att direkt applicera kraft på kärnan genom magnetiska mikrober som levereras in i cytoplasman och för att genomföra samtidig fluorescerande avbildning av levande celler. Sammanfattningsvis visar protokollen som presenteras här hur man (1) levererar magnetiska mikrober in i cellen utanför kärnan, (2) manipulerar mikroberna för att applicera magnetisk kraft på kärnan, (3) utför konfokal fluorescerande avbildning av cellerna under manipulation och (4) kvantitativt analyserar YAP-kärn- / cytoplasmaförhållandet (N / C) under hela kraftapplikationsprocessen. Resultaten tyder på att (1) genom endocytos kan magnetiska mikrober icke-invasivt levereras till cytoplasman hos B2B-celler inom 7 timmar (figur 2 och figur 3); och (2) kvantifierad magnetisk kraft som appliceras direkt på kärnan (figur 4, figur 5 och figur 6) ensam kan utlösa olika förändringar av YAP N / C-förhållandet i CRISPR / Cas9-konstruerade B2B-celler (figur 7 och figur 8).
Internalisering av magnetiska mikrober (avsnitt 2.2) är avgörande eftersom extracellulära mikrober inte kan applicera kraft direkt på kärnan. Krafttillämpning och avbildning (avsnitt 5.3) är kritiska steg i detta experiment, och den kraft som behövs för att deformera kärnan och inducera meningsfulla biologiska konsekvenser kan vara provberoende. Kraftstorleken i detta experiment (0,8 nN och 1,4 nN) kan ökas ytterligare för att utlösa kärnmekanoavkänning i mindre känsliga celler.
<p class="jove_content…The authors have nothing to disclose.
Detta projekt finansieras av UF Gatorade Award Start-up Package (X. T.), UFHCC Pilot Award (X. T. och Dr. Dietmar Siemann), UF Opportunity Seed Fund (X. T.) och UFHCC University Scholars Program (H. Y. Wang). Vi uppskattar uppriktigt de intellektuella diskussionerna med och den tekniska supporten från Dr. Jonathan Licht (UFHCC), Dr. Rolf Renne (UFHCC), Dr. Christopher Vulpe (UFHCC), Dr. Blanka Sharma (BME), Dr. Mark Sheplak (MAE & ECE), Dr. Daniel Ferris (BME), Dr. Malisa Sarntinoranont (MAE), Dr. Ashok Kumar (MAE), Dr. Benjamin Keselowsky (BME), Dr. Brent Gila (RSC), Dr. Philip Feng (ECE), Dr. Gregory A. Hudalla (BME), Dr. Steven Ghivizzani (OSSM), Dr. Yenisel Cruz-Almeida (CDBS), Dr. Roger Fillingim (CD-BS), Dr. Robert Caudle (OMS), Dr. John Neubert (DN-OR), Dr. Justin Hiliard (Neurokirurgi), Dr. Tian He (Harvard University), Dr. Youhua Tan (Hong Kong Polytechnic University), Dr. Jessie L-S Au (Institute of Quantitative Systems Pharmacology), Dr. David Hahn (University of Arizona), och supportteam av Nikon (Drs. Jose Serrano-Velez, Larry Kodon och Jon Ekman). Vi är djupt tacksamma för det effektiva stödet från alla medlemmar i Tangs, Yamaguchis, Sharmas, Au: s, Siemanns och Guans forskningslaboratorier och alla anställda på UF MAE-avdelningen.
0.05 % Trypsin | Corning | 25-051-CI | |
25 cm2 flask | Corning | 156340 | |
7-µm mean diameter carbonyl iron microbeads | N/A | N/A | |
A1R confocal system | Nikon | ||
Carbonyl Iron Powder CM | BASF | 30042253 | Magnetic microbead |
Culture medium (RPMI-1640) | Gibco | 11875093 | |
Desktop Computer | Dell | with Windows 10 operating system | |
Environmental chamber TIZB | Tokai Hit | TIZB | |
Fetal bovine serum (FBS) | Gibco | 26140 | |
Fiji ImageJ | National Institutes of Health and the Laboratory for Optical and Computational Instrumentation | ||
Glass-bottom petri dish | MatTek | P35G-1.5-14-C | |
Magnet | K&J Magnetics, Inc. | D99-N52 | |
Monochrome Camera | FLIR | BFS-U3-70S7M-C | |
NIS-Elements software platform | Nikon | software platform | |
Nucleus mask ImageJ macro | https://github.com/KOLIUG/Nuclear mask | ||
NucSpot Live 650 | Biotium | #40082 | Nuclear stain |
Penicillin-streptomycin | Gibco | 15140122 | |
Phosphate buffered saline (PBS) | Gibco | 10010023 | |
Ti2-E inverted microscope | Nikon | ||
XYZ mover (CAD files) | https://github.com/KOLIUG/XYZ-mover |