Summary

がん細胞におけるイオンチャネルのスクリーニング

Published: June 16, 2023
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Summary

イオンチャネルの薬理学的標的化は、固形腫瘍を治療するための有望なアプローチです。がん細胞におけるイオンチャネル機能を特徴付け、がんの生存率に対するイオンチャネルモジュレーターの効果をアッセイするための詳細なプロトコルが提供されています。

Abstract

イオンチャネルは、細胞の発生と細胞の恒常性の維持に不可欠です。イオンチャネル機能の摂動は、広範囲の障害またはチャネル障害の発症に寄与する。がん細胞は、イオンチャネルを利用して自身の発生を促進し、腫瘍として改善し、さまざまな非がん細胞を含む微小環境に同化します。さらに、腫瘍微小環境内の成長因子およびホルモンのレベルの増加は、イオンチャネル発現の増強をもたらし、癌細胞の増殖および生存に寄与する。したがって、イオンチャネルの薬理学的標的化は、原発性および転移性脳腫瘍を含む固形悪性腫瘍を治療するための有望なアプローチとなる可能性があります。ここでは、癌細胞におけるイオンチャネルの機能を特徴付けるためのプロトコル、および癌生存率への影響を決定するためにイオンチャネルのモジュレーターを分析するためのアプローチについて説明します。これらには、イオンチャネルの細胞の染色、ミトコンドリアの分極状態のテスト、電気生理学を使用したイオンチャネル機能の確立、および薬物効力を評価するための生存率アッセイの実行が含まれます。

Introduction

膜輸送タンパク質は、細胞間のコミュニケーションや細胞の恒常性の維持に不可欠です。膜輸送タンパク質の中で、イオンチャネルは細胞の成長と発達を促進し、困難で変化する環境で細胞の状態を維持するのに役立ちます。イオンチャネルは、全身および中枢神経系(CNS)の両方で固形腫瘍の発生を促進し、サポートすることも報告されています1,2。例えば、KCa3.1チャネルは、膜電位の調節と細胞周期の調節に重要な細胞体積の制御に関与しています。欠陥のあるKCa3.1チャネルは、腫瘍細胞の異常な増殖に寄与することが報告されています3。さらに、イオンチャネルは癌の転移性播種に寄与し得る。一過性受容器電位(TRP)チャネルは、例えば、Ca2+およびMg2+流入に関与している。この流入は、腫瘍を取り囲む細胞外マトリックスを調節するように機能するいくつかのキナーゼとヒートショックタンパク質を活性化し、これは癌転移の開始に重要です4

イオンチャネルはがんの発症に寄与する可能性があるため、薬物関連のがん治療の標的にもなり得る。例えば、化学療法および新規免疫療法を含む治療法に対する耐性は、イオンチャネル機能調節不全に関連している5,6,7さらに、イオンチャネルは、がんの成長と発生を妨げる重要な創薬標的として浮上しており、再利用された低分子(FDA承認)薬や、モノクローナル抗体を含む生体高分子が検討されています1,2,8,9。この面では多くの進歩がありましたが、イオンチャネルがんの創薬は未発達のままです。これは、がん細胞のイオンチャネルを研究するという独特の課題に一部起因しています。例えば、遅効性化合物の電気生理学アッセイの設定には技術的な限界があり、チャネル活性化と薬物作用の時間的な違いがあります。さらに、今日一般的に使用されている自動電気生理学システムのほとんどは疎水性基質を利用しているため、化合物の溶解性も進行を妨げる可能性があり、化合物吸着の結果としてアーティファクトに寄与する可能性があります。さらに、天然物、ペプチド、モノクローナル抗体などの大規模な生物有機分子治療薬は、従来の電気生理学アッセイ10を使用してスクリーニングすることが技術的に困難です。最後に、がん細胞の生体電気的特性はよくわかっていません11

一方、イオンチャネルの免疫蛍光染色はしばしば困難です。これは、部分的には、それらの構造の複雑さと膜内のコンテキストによるものであり、顕微鏡研究のための抗体の生成と使用の両方の能力に影響を与えます。イオンチャネルの染色に使用される抗体が、特異性、親和性、再現性について検証されていることが特に重要です。イオンチャネル用の市販抗体は、その検証戦略と発表記録に基づいて検討する必要があります。実験には、標的タンパク質のノックダウンまたはノックアウトのいずれかによる非特異的結合の欠如を実証するためのネガティブコントロールを含める必要があります。あるいは、標的タンパク質が存在しない、またはmRNAまたはタンパク質の決定に基づいて存在量が少ない細胞株は、ネガティブコントロールとして役立ち得る。例えば、この研究は、髄芽腫細胞株(D283)における(GABA)受容体サブユニットGabra5の局在を示す。siRNAノックダウンを有するD283細胞および別の小脳髄芽腫細胞株であるDaoy細胞をGabra5について染色したが、認識可能な染色は示されなかった(データ示さず)。

ここでは、イオンチャネル機能、ならびに癌細胞に対するイオンチャネルモジュレーターの効果を分析およびアッセイするための方法が提示される。(1)イオンチャネルの細胞の染色、(2)ミトコンドリアの分極状態の検査、(3)電気生理学を用いたイオンチャネル機能の確立、および(4)in vitro薬物検証のためのプロトコルが提供されています。これらのプロトコルは、A型ガンマアミノ酪酸(GABAA)受容体2,12,13,14,15,16、塩化物アニオンチャネルおよび主要な抑制性神経伝達物質受容体の研究を強調しています。ただし、ここで紹介する方法は、他の多くの癌細胞やイオンチャネルの研究に適用されます。

Protocol

1. 培養細胞における免疫標識イオンチャネル 細胞の準備と実験のセットアップ細胞を75cm2の培養フラスコで活発に増殖する培養物として維持する。使用する細胞株の倍加時間に応じて、細胞が50%〜90%コンフルエントになるまで細胞を1回継代します。注:本研究では、グループ3髄芽腫細胞株であるD283細胞を使用しました。 培養フラスコから細胞を遠沈管(15 mLま…

Representative Results

上記は、がん細胞のイオンチャネルの特性評価に使用できる手順です。最初のプロトコルは、イオンチャネルの染色を強調しています。詳述したように、イオンチャネル、さらに言えば、細胞外膜に存在するタンパク質を染色する場合、多くの課題があります。図1に示すのは、五量体GABAA受容体のサブユニットに対する染色である。2番目のプロトコルは、癌細?…

Discussion

イオンチャネル機能の変化は、細胞内シグナル伝達カスケードを変化させ、細胞の全体的な機能に影響を与える可能性があります。過去10年間で、イオンチャネルが癌細胞の成長と転移に重要であることがますます明らかになっています。重要なことに、多くのイオンチャネルは、広範囲の障害を標的とする承認された治療薬の主要な標的である24。研究者らは、イオンチャ…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

著者らは、Thomas E. & Pamela M. Mischell Family FoundationからSSへの支援、およびHarold C. Schott FoundationがUC College of MedicineのHarold C. Schott寄付講座からSSへの資金提供を認めている。

Materials

ABS SpectraMax Plate Reader Molecular Devices ABS
Accutase Invitrogen 00-4555-56
Alexa Flor 488 Invitrogen A32723 Goat Anti-Rabbit
Antibiotic-Antimycotic Gibco 15240-062 100x
B27 Supplement Gibco 12587-010 Lacks vitamin A
Biosafety Cabinet LABCONCO 302381101 Class II, Type A2
Bovine Serum Albumin Fisher Scientific BP1606-100
CO2 Incubator Fisher Scientific 13-998-211 Heracell VIOS 160i
Calcium Chloride Fisher Scientific C7902 Dihydrate
Cell Culture Dishes, 150 mm Fisher Scientific 12-600-004 Cell culture treated
Cell Culture Flasks, 75 cm2 Fisher Scientific 430641U Cell culture treated
Cell Culture Plates, 6 well Fisher Scientific 353046 Cell culture treated
Cell Culture Plates, 96 well Fisher Scientific 353072 Cell culture treated
Centrifuge Eppendorf EP-5804R Refrigerated
Corning CoolCell Fisher Scientific 07-210-0006
Coverslips, 22 x 22 mm Fisher Scientific 12-553-450 Corning brand
D283 Med ATCC HTB-185
DABCO Mounting Media EMS 17989-97
D-Glucose Sigma Life Sciences D9434
Dimethyl Sulfoxide Sigma Aldrich D2650 Cell culture grade
DMEM/F12, base media Fisher Scientific 11330-032 With phenol red
DMEM/F12, phenol red free Fisher Scientific 21041-025
EGTA Sigma Aldrich E4378
Epidermal Growth Factor STEMCELL 78006.1
FCCP Abcam AB120081
Fetal Bovine Serum, Qualified Gibco 10437-028
Fibroblast Growth Factor, Basic Millipore GF003
GARBA5 Antibody Aviva ARP30687_P050 Rabbit Polyclonal
Glutamax Gibco 35050-061
Glycerol Mounting Medium EMS 17989-60 With DAPI+DABCO
Hemocytometer Millipore Sigma
Heparin STEMCELL 7980
HEPES HyClone SH3023701 Solution
HEPES Fisher Scientific BP310-500 Solid
ImageJ Open platform With Fiji plugins
Immuno Mount DAPI EMS 17989-97
KRM-II-08 experimental compounds not available from a commercial source
Leica Application Suite X Leica Microsystems
Leukemia Inhibitory Factor Novus N276314100U
L-Glutamine Gibco 25030-081
Magnesium Chloride Sigma Aldrich M9272 Hexahydrate
Microscope, Confocal Leica SP8
Microscope, Light VWR 76382-982 DMiL Inverted
MTS – Promega One Step Promega G3581
Multi-channel pipette, 0.5-10 µL Eppendorf Z683914
Multi-channel pipette, 10-100 µL Eppendorf Z683930
Multi-channel pipette, 30-300 µL Eppendorf Z683957
Nest-O-Patch Heka
Neurobasal-A Medium Gibco 10888022 Without vitamin A
Neurobasal-A Medium Gibco 12348-017 Phenol red free
Non-Essential Amino Acids Gibco 11140-050
NOR-QH-II-66 experimental compounds not available from a commercial source
Parafilm Fisher Scientific 50-998-944 4 inch width
Paraformaldehyde EMS RT-15710
PATHCHMASTER Heka
Penicillin-Streptomycin Gibco 15140-122
Perfusion System Nanion 4000120
PFA EMS RT-15710
Phosphate Bufered Saline Fisher Scientific AAJ75889K2 Reagent grade
Poly-D-Lysine Fisher Scientific A3890401
Poly-L-Lysine Sigma Life Sciences P4707
Port-a-Patch Nanion 21000072
Potassium Chloride Sigma Life Sciences P5405
Primary Antibody Invitrogen MA5-34653 Rabbit Monoclonal
Prism GraphPad
Propofol Fisher Scientific NC0758676 1 mL ampule
QH-II-66 experimental compounds not available from a commercial source
Reagent Reservoirs VWR 89094-664 Sterile
Slides, 75 x 25 mm Fisher Scientific 12-544-7 Frosted one side
Sodium Bicarbonate Corning 25-035-Cl
Sodium Chloride Fisher Scientific S271-3
Sodium Pyruvate Gibco 11360-070
Synth-a-Freeze Medium Gibco R00550 Cryopreservation
TMRE Fisher Scientific 50-196-4741 Reagent
TMRE Kit Abcam AB113852 Kit
Triton X-100 Sigma Aldrich NC0704309
Trypan Blue Gibco 15-250-061 Solution, 0.4%
Trypsin/EDTA Gibco 25200-072 Solution, 0.25%
Vortex Mixer VWR 97043-562
Whatman Filter Paper Fisher Scientific 09-927-841

References

  1. Prevarskaya, N., Skryma, R., Shuba, Y. Ion channels in cancer: Are cancer hallmarks oncochannelopathies. Physiological Reviews. 98 (2), 559-621 (2018).
  2. Rao, R., et al. Ligand-gated neurotransmitter receptors as targets for treatment and management of cancers. Frontiers in Physiology. 13, 839437 (2022).
  3. Mohr, C. J., et al. Cancer-associated intermediate conductance Ca2+-activated K+ channel KCa3.1. Cancers. 11 (1), 109 (2019).
  4. Fels, B., Bulk, E., Petho, Z., Schwab, A. The role of TRP channels in the metastatic cascade. Pharmaceuticals. 11 (2), 48 (2018).
  5. Eil, R., et al. Ionic immune suppression within the tumour microenvironment limits T cell effector function. Nature. 537 (7621), 539-543 (2016).
  6. Haustrate, A., Hantute-Ghesquier, A., Prevarskaya, N., Lehen’kyi, V. Monoclonal antibodies targeting ion channels and their therapeutic potential. Frontiers in Pharmacology. 10, 606 (2019).
  7. Kischel, P., et al. Ion channels: New actors playing in chemotherapeutic resistance. Cancers. 11 (3), 376 (2019).
  8. Tuszynski, J., Tilli, T. M., Levin, M. Ion channel and neurotransmitter modulators as electroceutical approaches to the control of cancer. Current Pharmaceutical Design. 23 (32), 4827-4841 (2017).
  9. Kale, V. P., Amin, S. G., Pandey, M. K. Targeting ion channels for cancer therapy by repurposing the approved drugs. Biochimica Biophysica Acta. 1848 (10), 2747-2755 (2015).
  10. Wickenden, A., Priest, B., Erdemli, G. Ion channel drug discovery: Challenges and future directions. Future Medicinal Chemistry. 4 (5), 661-679 (2012).
  11. Rocha, P. R. F., Elghajiji, A., Tosh, D. Ultrasensitive system for electrophysiology of cancer cell populations: A review. Bioelectricity. 1 (3), 131-138 (2019).
  12. Sengupta, S., et al. α5-GABAA receptors negatively regulate MYC-amplified medulloblastoma growth. Acta Neuropathologica. 127 (4), 593-603 (2014).
  13. Jonas, O., et al. First in vivo testing of compounds targeting Group 3 medulloblastomas using an implantable microdevice as a new paradigm for drug development. Journal of Biomedical Nanotechnology. 12 (6), 1297-1302 (2016).
  14. Kallay, L., et al. Modulating native GABAA receptors in medulloblastoma with positive allosteric benzodiazepine-derivatives induces cell death. Journal of Neurooncology. 142 (3), 411-422 (2019).
  15. Pomeranz Krummel, D. A., et al. Melanoma cell intrinsic GABAA receptor enhancement potentiates radiation and immune checkpoint response by promoting direct and T cell-mediated anti-tumor activity. International Journal of Radiation Oncology, Biology, Physics. 109 (4), P1040-P1053 (2021).
  16. Bhattacharya, D., et al. Therapeutically leveraging GABAA receptors in cancer. Experimental Biology and Medicine. 246 (19), 2128-2135 (2021).
  17. Mazia, D., Schatten, G., Sale, W. Adhesion of cells to surfaces coated with polylysine. Applications to electron microscopy. Journal of Cell Biology. 66 (1), 198-200 (1975).
  18. Wiatrak, B., Kubis-Kubiak, A., Piwowar, A., Barg, E. PC12 cell line: Cell types, coating of culture vessels, differentiation and other culture conditions. Cells. 9 (4), 958 (2020).
  19. Baker, J. R. Fixation in cytochemistry and electron-microscopy. Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 6 (5), 303-308 (1958).
  20. Chung, J. Y., et al. Histomorphological and molecular assessments of the fixation times comparing formalin and ethanol-based fixatives. Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 66 (2), 121-135 (2018).
  21. Crowley, L. C., Christensen, M. E., Waterhouse, N. J. Measuring mitochondrial transmembrane potential by TMRE staining. Cold Spring Harbor Protocols. 2016 (12), (2016).
  22. Cory, A. H., Owen, T. C., Barltrop, J. A., Cory, J. G. Use of an aqueous soluble tetrazolium/formazan assay for cell growth assays in culture. Cancer Communications. 3 (7), 207-212 (1991).
  23. Maro, B., Marty, M. C., Bornens, M. In vivo and in vitro effects of the mitochondrial uncoupler FCCP on microtubules. EMBO Journal. 1 (11), 1347-1352 (1982).
  24. Zheng, J., et al. Mechanism for regulation of melanoma cell death via activation of thermo-TRPV4 and TRPV. Journal of Oncology. 2019, 7362875 (2019).
  25. Konno, K., Watanabe, M., Luján, R., Ciruela, F. Immunohistochemistry for ion channels and their interacting molecules: Tips for improving antibody accessibility. Receptor and Ion Channel Detection in the Brain. , (2016).
  26. Mortensen, M., Smart, T. G. Single-channel recording of ligand-gated ion channels. Nature Protocols. 2 (11), 2826-2841 (2007).
  27. Franken, N. A., Rodermond, H. M., Stap, J., Haveman, J., van Bree, C. Clonogenic assay of cells in vitro. Nature Protocols. 1 (5), 2315-2319 (2006).
  28. Rafehi, H., et al. Clonogenic assay: Adherent cells. Journal of Visualized Experiments. (49), 2573 (2011).
  29. Scudiero, D. A., et al. Evaluation of a soluble tetrazolium/formazan assay for cell growth and drug sensitivity in culture using human and other tumor cell lines. 암 연구학. 48 (17), 4827-4833 (1988).
  30. Wang, P., Henning, S. M., Heber, D. Limitations of MTT and MTS-based assays for measurement of antiproliferative activity of green tea polyphenols. PLoS One. 5, e10202 (2010).
  31. Berridge, M. V., Tan, A. S. Characterization of the cellular reduction of 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide (MTT): subcellular localization, substrate dependence, and involvement of mitochondrial electron transport in MTT reduction. Archives of Biochemistry and Biophysics. 303 (2), 474-482 (1993).
  32. Plumb, J. A., Milroy, R., Kaye, S. B. Effects of the pH dependence of 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyl-tetrazolium bromide-formazan absorption on chemosensitivity determined by a novel tetrazolium-based assay. 암 연구학. 49 (16), 4435-4440 (1989).
  33. Chakrabarti, R., Kundu, S., Kumar, S., Chakrabarti, R. Vitamin A as an enzyme that catalyzes the reduction of MTT to formazan by vitamin C. Journal of Cellular Biochemistry. 80 (1), 133-138 (2000).
  34. Dong, G. W., Preisler, H. D., Priore, R. Potential limitations of in vitro clonogenic drug sensitivity assays. Cancer Chemotherapy and Pharmacology. 13 (3), 206-210 (1984).
  35. Sun, J., et al. STIM1- and Orai1-Mediated Ca2+oscillation orchestrates invadopodium formation and melanoma invasion. Journal of Cell Biology. 207 (4), 535-548 (2014).
check_url/kr/65427?article_type=t

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Kallay, L., Gawali, V. S., Toukam, D. K., Bhattacharya, D., Jenkins, A., Sengupta, S., Pomeranz Krummel, D. A. Screening Ion Channels in Cancer Cells. J. Vis. Exp. (196), e65427, doi:10.3791/65427 (2023).

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