Den foreliggende protokollen beskriver metoden for analyse av tarmflora ved bruk av Illumina-basert 16S rRNA-gensekvensering og gir et rammeverk for å evaluere effektiviteten av urtedekk.
For å foreløpig undersøke effekten av Desmodium caudatum på gastritt og tarmflora hos rotter, ble det etablert en kronisk gastrittrottemodell ved hjelp av den klassiske natriumsalisylatmetoden. Atten SPF-rotter ble delt inn i tre grupper: kontrollgruppen (gruppe C), modellgruppen (gruppe M) og behandlingsgruppen (gruppe T). Patologiske deler av mageveggen ble tatt fra rotter i hver gruppe. Videre ble konsentrasjonene av gastrin og malondialdehyd i serum hos rotter i hver gruppe bestemt av ELISA. I tillegg ble effekten av D. caudatum på tarmfloraen hos rotter med gastritt undersøkt gjennom en detaljert sammenligning av tarmbakteriesamfunn i de tre gruppene, ved bruk av Illumina-basert 16S rRNA-gensekvensering. Resultatene indikerte at D. caudatum decoction kunne redusere malondialdehydinnholdet og øke gastrininnholdet. Videre ble D. caudatum decoction funnet å øke mangfoldet og overflod av tarmfloraen, og utøve en positiv innvirkning på behandlingen av gastritt ved å regulere og gjenopprette tarmfloraen.
Kronisk gastritt (CG), en av de vanligste kliniske sykdommene, er preget av kroniske og vedvarende inflammatoriske forandringer i mageslimhinneepitelet, som ofte og gjentatte ganger angripes av ulike patogene faktorer1. Forekomsten av CG rangerer først blant alle typer magesykdommer, og står for 40% til 60% av den ambulante servicegraden i Institutt for gastroenterologi2. Videre øker forekomsten generelt med alderen, spesielt hos personer som er middelaldrende og eldre3. Utvilsomt reduserer CG folks livskvalitet betydelig, og understreker det kritiske behovet for å oppdage nye terapeutiske midler.
Tallrike studier har rapportert at forekomsten og utviklingen av CG er knyttet til sekresjonen av gastrointestinale hormoner, som gastrin (GAS)4,5. GAS, et vanlig gastrointestinalt peptidhormon i fordøyelseskanalen, stimulerer celler til å utskille magesyre ved å fremme frigjøring av histamin fra eosinofiler. I tillegg forbedrer det ernæringen og blodtilførselen til mageslimhinnen, og fremmer spredning av mageslimhinne og parietalceller6. Derfor kan gastrin brukes som en indikator for å evaluere utviklingsnivået til CG. Videre kan lipidperoksidasjonsprodukter utløst av reaktive oksider aktivere inflammatoriske celler, noe som fører til CG. Malondialdehyd (MDA), en lipidperoksidasjonsmarkør, er en vanlig indikator for å måle graden av oksidativt stress. Det gjenspeiler nivået av frie radikaler i mageslimhinnen til en viss grad. MDA-nivået kan indikere angrepet av umettede fettsyrer i den lokale mageslimhinnen forårsaket av frie radikaler 7,8.
Intestinal mikroøkologi består av millioner av mikroorganismer som bor i vertstarmen, og spiller en viktig rolle i å opprettholde vertshelsen og regulere vertsimmunitet. En sunn tarmflora, preget av høy rikdom, mangfold og stabil mikrobiotafunksjon, fungerer som en beskyttende barriere mot invasjonen av patogene mikroorganismer ved å delta i metabolisme. Forstyrrelser i tarmfloraen gjør individer mer utsatt for akutte og kroniske gastrointestinale sykdommer 9,10. De siste årene har mikrobiotabehandling for gastrointestinale sykdommer utviklet seg raskt og vist signifikant effekt11. Oppsummert er hensynet til tarmfloraen avgjørende for å forstå og håndtere gastrointestinale sykdommer.
Som en uunnværlig del av skattekisten til tradisjonell kinesisk medisin, har folkemedisinske materialer stor betydning for klinisk praksis og modernisering av nasjonalmedisin. Røttene og hele delene av Desmodium caudatum (Thunb.) DC. har vært mye brukt for å lindre ubehag i magen i Beichuan Qiang-området i Mianyang City i en lengre periode. Noen artikler indikerer det vitenskapelige grunnlaget for behandling av gastrointestinale sykdommer med D. caudatum, med henvisning til dens effekter som hemostase, antioksidasjon og gastrointestinal beskyttelse 12,13,14. På grunn av mangel på grundig forskning er det imidlertid ikke etablert noen klinisk farmakodynamikkmekanisme. Denne artikkelen tar sikte på å studere effekten av D. caudatum ved behandling av gastritt basert på gastrointestinale hormoner og tarmflora, noe som gir grunnlag for sin rasjonelle kliniske anvendelse.
D. caudatum, en vanlig folkemedisin av Qiang nasjonalitet12, har vist betydelig effekt i behandling av gastrointestinale sykdommer. Med utviklingen av moderne farmakologisk forskning er ubalansen i flora som følge av ubalanse i gastrointestinal mikroøkologi identifisert som en nøkkelfaktor i akutte og kroniske gastrointestinale sykdommer22,23. Visse mikroorganismer i tarmkanalen spiller en avgjørende rolle for å opprettholde …
The authors have nothing to disclose.
Dette arbeidet ble finansiert av de viktigste FoU-prosjektene til vitenskaps- og teknologiavdelingen i Sichuan-provinsen (2020YFS0539).
Alpha diversity analysis | Mothur 1.30.2 | ||
AxyPrep deoxyribonucleic acid (DNA) gel extraction kit | Axygen Biosciences | AP-GX-50 | |
Beta diversity analysis | Qiime 1.9.1 | ||
Cryogenic refrigerator | Forma-86C ULT freezer | ||
Desmodium caudatum | The Traditional Chinese Medicine Hospital of Beichuan Qiang Autonomous County | ||
E.Z.N.A. soil kit | Omega Bio-tek | D5625-01 | |
Illumina MiSeq Platform | Illumina Miseq PE300/NovaSeq PE250 | ||
Multiskan Spectrum | spectraMax i3 | ||
OTU clustering | Uparse 7.0.1090 | ||
OTU statistics | Usearch 7.0 | ||
PCR instrument | TransGen AP221-02 | ||
PCR instrument | ABI GeneAmp 9700 | ||
QuantiFluor-ST double-stranded DNA (dsDNA) system | Promega Corp. | ||
Sequence classification annotation | RDP Classifier 2.11 | ||
Sodium salicylate | Sichuan Xilong Chemical Co., Ltd | 54-21-7 | |
SPF rats | Chengdu Dashuo Experimental Animal Co., Ltd | ||
SPSS 18.0 | IBM |