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環境トランスクリプトミクスを使って海洋微生物群集からの遺伝子発現の分析
JoVE 신문
생물학
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JoVE 신문 생물학
Analyzing Gene Expression from Marine Microbial Communities using Environmental Transcriptomics
DOI:

13:51 min

February 18, 2009

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Chapters

  • 00:00Title
  • 01:06Introduction
  • 01:51Preparation and Environmental RNA Collection
  • 03:32Total RNA Extraction
  • 06:03First rRNA Removal
  • 07:29Second rRNA Removal
  • 10:38mRNA Amplification
  • 12:01cDNA Synthesis
  • 12:51Representative Results/ Outcome
  • 13:16Conclusion

Summary

자동 번역

私たちは、環境のmRNAからcDNAを生成するための方法を提示する。一般的に、トータルRNAは、最初の環境から収集され、rRNAを選択的に除去され、mRNAが選択的に増幅され、濃縮mRNAのプールから合成したcDNAは、配列決定される。回収された配列は、発現遺伝子を識別するために、標準的なバイオインフォマティクス技術を用いて注釈を付けることができます。

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