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プロービングDNA安定同位体（DNA - SIP）
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JoVE 신문 생물학
DNA Stable-Isotope Probing (DNA-SIP)
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プロービングDNA安定同位体（DNA - SIP）

DOI:
10.3791/2027-v

•

14:57 min

•

August 02, 2010

•

,
1Department of Biology,University of Waterloo

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:07Introduction
  • 02:11Sample Incubation and DNA Extraction
  • 03:47Gradient Solns for Ultracentrifugation
  • 05:26Ultracentrifugation
  • 07:49Gradient Fractionation
  • 09:46DNA Precipitation
  • 11:22Representative Results
  • 14:04Conclusion

Summary

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DNA安定同位体プロービングには、特定の基質を利用することのできる微生物の活発なコミュニティを識別し、特徴付けるために栽培に依存しない方法です。重い同位体に富む基板の同化は、微生物バイオマスへの標識原子の取り込みにつながる。密度勾配超遠心分離は、下流の分子解析のための標識DNAを取得します。

Tags

DNA-SIPStable-isotope ProbingMicroorganismsCarbon SubstratesNutrientsCellular BiomassCultivation-independent TechniqueMetabolic FunctionTerrestrial EnvironmentsAquatic EnvironmentsStable-isotope Labelled CompoundsNucleic AcidDensity Gradient UltracentrifugationGradient FractionationDNA PurificationCesium ChlorideMolecular CharacterizationFingerprintingMicroarraysClone LibrariesMetagenomics

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