Journal
/
생물학
/
Genoom-brede analyse met behulp van chip Isoform-specifieke Gene targets te identificeren
JoVE 신문
생물학
This content is Free Access.
JoVE 신문 생물학
Genome-wide Analysis using ChIP to Identify Isoform-specific Gene Targets
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Genoom-brede analyse met behulp van chip Isoform-specifieke Gene targets te identificeren

DOI:
10.3791/2101-v

•

11:19 min

•

July 07, 2010

•

, , , , , ,
1Department of Biochemistry and Molecular Genetics,University of Illinois Chicago – UIC, 2Research Unit on Biomedical Informatics,Universitat Pompeu Fabra, 3Genome Technology Core,Whitehead Institute for Biomedical Research

Chapters

  • 00:00Title
  • 00:53Introduction
  • 01:33Cell Cross-linking
  • 02:39Cell Sonication
  • 04:03Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)
  • 07:06Amplification of Genomic DNA
  • 08:27Gel Purification of Amplified Products
  • 09:46Representative Results for Genome-wide Analysis Using ChIP
  • 10:53Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Hier presenteren we een chromatine immunoprecipitatie (ChIP) procedure voor genoom-brede locatie analyse van eiwit-isovormen die verschillen in een histon-bindend domein. We zijn toe te passen op ChIP-Seq analyse om de doelstellingen van het KDM5A/JARID1A/RBP2 histon demethylase te identificeren.

Tags

Genome-wide AnalysisChIPIsoform-specific Gene TargetsTranscriptional FactorsEpigenetic FactorsProtein DomainsPlant Homeodomain (PHD)Histone ModificationsRBP2Oncogenic FusionHuman LeukemiaTrimethylated Lysine 4Histone H3 (H3K4me3)RBP2 IsoformDifferentiationU937 CellsGenomic RegionsHistone Demethylase ActivityTranscriptional Activity

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

Bacteriële Gene Expression analyse met behulp van Microarrays

Genoom-brede analyse van aminoacylatie (Charging) niveaus van tRNA Met behulp van Microarrays

Genoom-brede scherm voor miRNA Doelen Met behulp van de MISSION Target ID Bibliotheek

Kwantitatieve en geautomatiseerde high-throughput genoomwijde RNAi schermen in C. elegans</em

Isolatie van Ribosoom Bound Nascent Polypeptiden<em> In vitro</em> Om Translationeel Pauze plaatsen langs mRNA identificeren

A Novel Bayesiaanse Change-point algoritme voor Genoom-brede analyse van diverse ChIPseq Data Types

Genoom-brede gendeleties in<em> Streptococcus sanguinis</em> Door High Throughput PCR

Polysome fractionering en analyse van zoogdieren Translatomes op een genoom-brede schaal

DNA-affiniteit-gezuiverd Chip (DAP-chip) methode om Gene Doelen bepalen voor bacteriële Twee componenten Regulatory Systems

Genoombrede kartering van Drug-DNA interacties in cellen met kosmische (Crosslinking van kleine moleculen te isoleren chromatine)

Read Article