Genome-wide Analysis using ChIP to Identify Isoform-specific Gene Targets

Michael L. Beshiri; Abul Islam; Dannielle C. DeWaal; William F. Richter; Jennifer Love; Nuria Lopez-Bigas; Elizaveta V. Benevolenskaya

doi:10.3791/2101

Journal

/

생물학

/

הגנום כולו ניתוח באמצעות שבב זיהוי איזופורם ספציפי מטרות ג'ין

JoVE 신문
생물학

This content is Free Access.

JoVE 신문 생물학

Genome-wide Analysis using ChIP to Identify Isoform-specific Gene Targets

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

הגנום כולו ניתוח באמצעות שבב זיהוי איזופורם ספציפי מטרות ג'ין

DOI:

10.3791/2101-v

•

11:19 min

•

July 07, 2010

•

Michael L. Beshiri, Abul Islam, Dannielle C. DeWaal, William F. Richter, Jennifer Love, Nuria Lopez-Bigas, Elizaveta V. Benevolenskaya

¹Department of Biochemistry and Molecular Genetics,University of Illinois Chicago – UIC, ²Research Unit on Biomedical Informatics,Universitat Pompeu Fabra, ³Genome Technology Core,Whitehead Institute for Biomedical Research

Chapters

00:00Title
00:53Introduction
01:33Cell Cross-linking
02:39Cell Sonication
04:03Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)
07:06Amplification of Genomic DNA
08:27Gel Purification of Amplified Products
09:46Representative Results for Genome-wide Analysis Using ChIP
10:53Conclusion

Summary

자동 번역

כאן אנו מציגים immunoprecipitation הכרומטין (שבב) נוהל לניתוח הגנום כולו מיקום isoforms חלבונים שונים בתחום היסטון מחייב. אנו מיישמים אותו לניתוח שבב Seq לזהות מטרות demethylase היסטון KDM5A/JARID1A/RBP2.

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Gene Expression חיידקית ניתוח שימוש microarrays

הגנום כולו ניתוח (טעינה) רמות Aminoacylation של tRNA שימוש microarrays

הגנום כולו מסך עבור מטרות מירנה שימוש יעד המשימה ספריית מזהה

כמותיים אוטומטי תפוקה גבוהה הגנום כולו RNAi המסכים ג elegans</em

הבידוד של הריבוזום פוליפפטידים המתהווה כרוכים<em> במבחנה</em> כדי לזהות אתרים השהה של תרגום לאורך ה-mRNA

אלגוריתם רומן ייס שינוי נקודות לניתוח הגנום רחב, של סוגי נתוני ChIPseq מגוונים

מחיקות Gene הגנום ב<em> סטרפטוקוקוס sanguinis</em> על ידי תפוקה הגבוהה PCR

Polysome היפוך חלוק וניתוח של יונקי Translatomes בקנה מידת הגנום

שיטת צ'יפ (DAP-שבב) מטוהרת-DNA-זיקה לקביעת מטרות גן לחיידקית שתי מערכות רגולטוריות רכיב

מיפוי הגנום של תרופות-DNA בתאי אינטראקציות עם COSMIC (Crosslinking של מולקולות קטנות לבודד הכרומטין)