Journal
/
생물학
/
iCLIP - トランスクリプトーム全体の個々のヌクレオチド分解能タンパク質- RNA相互作用のマッピング
JoVE 신문
생물학
This content is Free Access.
JoVE 신문 생물학
iCLIP – Transcriptome-wide Mapping of Protein-RNA Interactions with Individual Nucleotide Resolution
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

iCLIP - トランスクリプトーム全体の個々のヌクレオチド分解能タンパク質- RNA相互作用のマッピング

DOI:
10.3791/2638-v

•

10:45 min

•

April 30, 2011

•

, , , , , , , ,
1Laboratory of Molecular Biology,Medical Research Council – MRC, 2European Bioinformatics Institute,EMBL Heidelberg, 3Computer and Information Science,University of Ljubljana, 4Wellcome Trust Genome Campus,Wellcome Trust Sanger Institute

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:19UV Cross-linking of Tissue Culture Cells
  • 02:10Bead Preparation
  • 02:53Cell Lysis and Partial RNA Digestion
  • 03:47Immunoprecipitation
  • 04:26RNA 5′ End Labelling
  • 05:08SDS-PAGE and Membrane Transfer
  • 06:27Gel Purification of cDNA
  • 08:44Representative Results
  • 10:00Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

転写でRNA結合蛋白質の空間配置は、転写後調節の重要な決定要因である。したがって、我々は、RNA結合タンパク質の結合部位の正確なゲノムワイドなマッピングを可能にする個々のヌクレオチドの解像度のUV架橋及び免疫沈降（iCLIP）を開発。

Tags

ICLIPTranscriptome-wide MappingProtein-RNA InteractionsIndividual Nucleotide ResolutionRNA-binding ProteinsPost-transcriptional RegulationPositional InformationBinding SitesBiochemical MethodsNative Cellular ContextAffinity PurificationImmunoprecipitationDifferential DisplayMicroarray AnalysisRIP-CHIPIndirect InteractionsNon-physiological InteractionsCLIP (UV Cross-linking And Immunoprecipitation)UV Cross-linkingRigorous Purification SchemesDenaturing Polyacrylamide Gel ElectrophoresisHigh-throughput Sequencing TechnologiesHITS-CLIPCLIP-seqPAR-CLIPPhotoreactive Ribonucleoside Analogs

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

check_url/kr/2638?article_type=v

シンクロトロンX線トモグラフィを用いたサブミクロン分解能を持つ非侵襲的3次元可視化
check_url/kr/2638?article_type=v

個々のシナプス前終末でのドーパミン放出はFFNsと可視化
check_url/kr/2638?article_type=v

PAR -クリップ - RNA結合タンパク質のトランスクリプトーム全体の結合部位を同定する方法
check_url/kr/2638?article_type=v

クロマチンの相互作用のマッピングと転写調節を理解するためのペアエンドタグシーケンシング（CHIA-PET）によるクロマチンの相互作用の解析
check_url/kr/2638?article_type=v

蛍光共鳴エネルギー移動によるリガンド - 受容体相互作用のリアルタイム監視
check_url/kr/2638?article_type=v

機能イメージングによるヒト聴覚皮質上のシータバースト刺激の後遺症のマッピング
check_url/kr/2638?article_type=v

高解像度メルト解析を用いたPCRを使用して、迅速かつ効率的なゼブラフィッシュ遺伝子型決定
check_url/kr/2638?article_type=v

COSMICと細胞の薬剤-DNA相互作用のゲノムワイドなマッピング（小分子の架橋は、クロマチンを分離するために）
check_url/kr/2638?article_type=v

DamID-配列：アデニンメチル化DNA断片のハイスループットシークエンシングによるタンパク質-DNA相互作用のゲノムワイドなマッピング
check_url/kr/2638?article_type=v

マウス洞房結節の高分解能光学マッピング

Read Article