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ゲノムMRI - ゲノムDNA内の配列パターンを研究するためのパブリックリソース
JoVE 신문
생물학
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JoVE 신문 생물학
Genomic MRI – a Public Resource for Studying Sequence Patterns within Genomic DNA
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ゲノムMRI - ゲノムDNA内の配列パターンを研究するためのパブリックリソース

DOI:
10.3791/2663-v

•

12:36 min

•

May 09, 2011

•

, ,
1Department of Medicine,University of Toledo Health Science Campus

Chapters

  • 00:05Title
  • 02:04Preparation and Input Sequence Upload
  • 03:50Short-Range Inhomogeneity (SRI) and Random Sequence Generation
  • 06:20Analysis of Mid-Range Inhomogeneity (MRI)
  • 09:38Using Genomic MRI to Identify MRI Patterns
  • 11:00Viewing Saved Data
  • 12:20Conclusion

Summary

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我々は、ゲノム配列の解析のために公共の計算のウェブサイトを提示する。それは様々な非ランダムな塩基組成とDNA配列のパターンを検出します。このリソースは、また複雑さの多様なレベルでランダム化されたシーケンスを生成します。

Tags

Genomic MRISequence PatternsNon-coding Genomic RegionsIntergenic AreasIntronsUntranslated SegmentsMid-Range Inhomogeneity (MRI) RegionsNucleotide CompositionBase EnrichmentNon-B-form DNA StructuresGene Expression RegulationRecombinationGenetic ProcessesFixation BiasSequence InhomogeneityComputational AnalysisMRI PatternsRandomized SequencesNatural Input DNA SequencesNon-coding DNA Examination

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