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Mit SCOPE potenzieller regulatorischer Motive in Coregulated Gene zu identifizieren
JoVE 신문
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JoVE 신문 생물학
Using SCOPE to Identify Potential Regulatory Motifs in Coregulated Genes
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Mit SCOPE potenzieller regulatorischer Motive in Coregulated Gene zu identifizieren

DOI:
10.3791/2703-v

•

07:55 min

•

May 31, 2011

•

,
1Department of Biology,Dartmouth College

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:53SCOPE Motif Discovery
  • 04:30Representative SCOPE Results
  • 07:00Conclusion

Summary

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Eine geradlinige und robuste Methode, um potenzielle regulatorische Motive in Zusammenarbeit regulierten Gene zu identifizieren wird vorgestellt. SCOPE erfordert keine User-Parameter und liefert Motive, die ausgezeichnete Kandidaten stellen für regulatorische Signale. Die Identifikation solcher Regulationssignale hilft, die zugrunde liegenden Biologie zu verstehen.

Tags

SCOPERegulatory MotifsEnsemble Motif FinderComponent AlgorithmsOver-representationMotif Position PreferenceTelomere MaintenanceGene AnalysisGene SetMotif ScoreTranscription Factor Binding Sites

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