JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다. 전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
Chapters
- 00:05Title
- 01:49Installation of the Software Package
- 04:02Analysis of a Crystal Structure
- 05:22Construction of a DNA Structure from Rigid-body Parameters
- 06:38Analysis of Multi-model Structure Files
- 08:15Superposition of Multi-model Structures onto a Common Reference Frame
- 09:29Construction of a Protein-decorated DNA Molecule
- 11:54Results: Nucleic Acid Structure Analysis and Reconstruction with 3DNA
- 15:52Conclusion
De 3DNA softwarepakket is een populaire en veelzijdige bioinformatica tool met mogelijkheden om te analyseren, construeren, en drie-dimensionale nucleïnezuur structuren te visualiseren. Dit artikel presenteert gedetailleerde protocollen voor een subset van nieuwe en populaire functies die beschikbaar zijn in 3DNA, van toepassing op zowel individuele structuren en ensembles van verwante structuren.
Tags
3DNA Software PackageBioinformatics ToolNucleic Acid StructuresAnalyze StructuresConstruct StructuresVisualize StructuresProtocolsDownload SoftwareInstall SoftwareBase Pair AssignmentRigid-body ParametersAtomic Model ReconstructionEnsembles Of StructuresNMR MeasurementsMD SimulationsW3DNA Web ServerUser-friendly InterfaceBuild ModelsDNA MoleculesBound Proteins
