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代高通量测序技术（ChIP-seq的高品质的染色质免疫沉淀DNA模板）
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JoVE 신문 생물학
Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing (ChIP-seq)
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代高通量测序技术（ChIP-seq的高品质的染色质免疫沉淀DNA模板）

DOI:
10.3791/50286-v

•

09:52 min

•

April 19, 2013

•

, , ,
1Division of Human Genetics,Children’s Hospital of Philadelphia Research Institute, 2Department of Pediatrics, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:59Cross-linking Chromatin
  • 02:27Sonication
  • 04:14Pre-clearing Chromatin
  • 05:15Chromatin Immunoprecipitation
  • 07:10Reversing Cross-link and Purifying DNA
  • 08:12Results: Generation of a High Quality ChIP Template
  • 09:28Conclusion

Summary

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染色质免疫沉淀和超高通量测序（芯片起）的组合可以识别并映射在一个给定的组织或细胞系的蛋白质-DNA相互作用。概述是如何产生一个高质量的ChIP随后的测序模板，使用的经验，例如转录因子TCF7L2。

Tags

ChIP-seqChromatin ImmunoprecipitationHigh-throughput SequencingTranscription FactorsTCF7L2Type 2 DiabetesCancerHCT116Protein-DNA InteractionsGenome Sequencing

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