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比較プロテオーム解析のための代謝標識および膜分画<em>シロイヌナズナ</em>サスペンション細胞培養

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JoVE 신문 생물학

Metabolic Labeling and Membrane Fractionation for Comparative Proteomic Analysis of Arabidopsis thaliana Suspension Cell Cultures

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比較プロテオーム解析のための代謝標識および膜分画<em>シロイヌナズナ</em>サスペンション細胞培養

DOI:

10.3791/50535-v

•

11:44 min

•

September 28, 2013

•

Witold G. Szymanski, Sylwia Kierszniowska, Waltraud X. Schulze²

¹Signaling Proteomics,Max Plank Institute of Molecular Plant Physiology, ²Department of Plant Systems Biology,University of Hohenheim

Chapters

00:05Title
01:35Plasma Membrane Purification
03:56Detergent Resistant Membrane Preparation
05:33Extraction of Proteins from the Detergent Resistant Fraction and In-solution Trypsin Digestion
07:04Use of C₁₈-StageTips for Peptide Desalting and Concentration
08:48Results: Comparative Proteomic Analysis
11:00Conclusion

Summary

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ここでは、 シロイヌナズナの細胞培養というラベルのN ^15、完全に標識されていないとの混合物をベース洗剤に耐性と洗剤の可溶性膜にし、 生体内で植物の形質膜の分画するための堅牢な方法が記載されている。手順は、シグナリングプロセスを理解するために、比較プロテオミクス研究のために適用される。

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Keywords: Metabolic Labeling Membrane Fractionation Comparative Proteomics Arabidopsis Thaliana Suspension Cell Cultures Plasma Membrane Microdomains Detergent-resistant Membrane Fraction Sucrose Gradient Quantitative Proteomics K15NO3 Labeling

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