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Una guía práctica para Phylogenetics para no expertos
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JoVE 신문 생물학
A Practical Guide to Phylogenetics for Nonexperts
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Una guía práctica para Phylogenetics para no expertos

DOI:
10.3791/50975-v

•

12:00 min

•

February 05, 2014

•

1Department of Biological Sciences and Institute for Neuroscience,The George Washington University

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:59Basic Local Alignment Search Tool (BLAST): Online Interface
  • 01:57BLAST: Local Executables for Windows
  • 03:52BLAST: Local Executables for Macs
  • 05:54Generating Multiple Sequence Alignments
  • 06:50Determining Best-fit Models of Evolution
  • 07:24Inferring Sequence Based Phylogenies by Maximum Likelihood or Bayesian Inference
  • 08:25Visualizing Phylogenies
  • 08:56Results: Similarity Searches, Alignments, Determining Best-fit Models, and Reconstructing Phylogenetic Trees
  • 11:29Conclusion

Summary

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Aquí se describe una tubería de paso a paso para generar filogenias confiables desde el nucleótido o secuencia de aminoácidos conjuntos de datos. Esta guía tiene como objetivo servir a los investigadores o estudiantes nuevos para el análisis filogenético.

Tags

PhylogeneticsPhylogenetic AnalysisSequence AlignmentEvolutionary ModelsMaximum LikelihoodBayesian InferencePhylogenetic Tree VisualizationBioinformatics ToolsPractical GuideNonexpert Researchers

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