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Studieren von DNA-Looping von Einzelmolekül-FRET

JoVE 신문
생물학

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JoVE 신문 생물학

Studying DNA Looping by Single-Molecule FRET

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Studieren von DNA-Looping von Einzelmolekül-FRET

DOI:

10.3791/51667-v

•

11:27 min

•

June 28, 2014

•

Tung T. Le, Harold D. Kim

¹School of Physics,Georgia Institute of Technology

Chapters

00:05Title
01:21Double Stranded (ds)DNA Sample Preparation
02:52Flow Cell Preparation
05:04Single-molecule Imaging
06:18Image Processing and Data Analysis
07:48Determining the J Factor
09:44Results: Representative Analysis of DNA Looping
10:52Conclusion

Summary

자동 번역

Diese Studie stellt eine detaillierte experimentelle Verfahren zur Looping Dynamik der Doppelstrang-DNA mit Einzelmolekül-Fluoreszenz-Resonanz-Energie-Transfer (FRET) zu messen. Das Protokoll beschreibt auch, wie die Looping-Wahrscheinlichkeitsdichte genannt J-Faktor zu extrahieren.

Tags

DNA Looping FRET DNA Bending DNA-protein Interactions DNA Packaging Nucleosome Cyclization DNA Ligase DNA Structure Looping Kinetics PCR FRET Pair Biotin Linker J Factor Intrinsic Curvature

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