Здесь мы опишем протокол, что пары две протеомные методы, а именно 2-мерный электрофорез (2DE) и масс-спектрометрия (MS), чтобы идентифицировать дифференциально экспрессируются / посттрансляционные модифицированные белки между двумя или более группами первичных проб. Этот подход, вместе с функциональными экспериментов, позволяет идентифицировать и охарактеризовать прогностических маркеров / терапевтических мишеней.