Journal
/
생물학
/
Rense Impure: Sekvense Metagenomes og Metatranscriptomes fra Komplekse Animal-assosiert Samples
JoVE 신문
생물학
This content is Free Access.
JoVE 신문 생물학
Purifying the Impure: Sequencing Metagenomes and Metatranscriptomes from Complex Animal-associated Samples

Rense Impure: Sekvense Metagenomes og Metatranscriptomes fra Komplekse Animal-assosiert Samples

DOI:
10.3791/52117-v

•

11:23 min

•

December 22, 2014

•

, , , , ,
1Department of Biology,San Diego State University, 2DOE Joint Genome Institute, 3Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado, 4Department of Pediatrics, School of Medicine,University of Colorado

Chapters

  • 00:05Title
  • 02:01Sample Collection and Pre-treatment
  • 04:11Generating Viral Metagenome and Viral-like Particle Enrichment and Purification
  • 07:12Generating Microbial Metagenome
  • 08:57Results: Generation of Viral and Microbial Metagenomes
  • 10:44Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Bruke cystisk fibrose airway som et eksempel, presenterer manuskriptet en omfattende arbeidsflyt består av en kombinasjon av metagenomic og metatranscriptomic tilnærminger for å karakterisere mikrobiell og viral lokalsamfunn i dyreassosierte prøver.

Tags

Keywords: MetagenomicsMetatranscriptomicsHost-associated MicrobiomeCystic FibrosisSputumDNA ExtractionRNA ExtractionHigh-throughput SequencingMicrobial CommunityViral CommunityTaxonomyFunctional Analysis

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

check_url/kr/52117?article_type=v

Purifying Plasmid DNA from Bacterial Colonies Using the Qiagen Miniprep Kit
check_url/kr/52117?article_type=v

Gross Dissection of the Stomach of the Lobster, Homarus Americanus
check_url/kr/52117?article_type=v

A Lectin HPLC Method to Enrich Selectively-glycosylated Peptides from Complex Biological Samples
check_url/kr/52117?article_type=v

Quantitation of γH2AX Foci in Tissue Samples
check_url/kr/52117?article_type=v

Kjemisk-blokkert Antibody Microarray for Multiplexed High-throughput profilering av bestemt protein Glykosylering i komplekse prøver
check_url/kr/52117?article_type=v

Påvisning av sjeldne genomisk Varianter fra Pooled Sekvensering Bruke Splinter
check_url/kr/52117?article_type=v

Den MultiBac Protein Complex produksjonsplattform på EMBL
check_url/kr/52117?article_type=v

Forsterkning, Neste generasjons sekvensering, og Genomisk DNA Kartlegging av Retrovirale Integrasjons nettsteder
check_url/kr/52117?article_type=v

Målrettet RNA sekvense analysen å karakter Gene Expression og Genomisk Endringer
check_url/kr/52117?article_type=v

Trekke membran nanorør fra gigantiske Unilamellar blemmer

Read Article