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Electrophoretic Maiusc Mobility Assay (EMSA) per lo studio delle interazioni RNA-proteina: La IRE / IRP Esempio
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Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA) for the Study of RNA-Protein Interactions: The IRE/IRP Example
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Electrophoretic Maiusc Mobility Assay (EMSA) per lo studio delle interazioni RNA-proteina: La IRE / IRP Esempio

DOI:
10.3791/52230-v

•

12:44 min

•

December 03, 2014

•

, ,
1Lady Davis Institute for Medical Research,Jewish General Hospital, 2Department of Medicine,McGill University

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:28Preparation of Protein Extracts from Cultured Cells
  • 03:05Preparation of Protein Extracts from Mouse Liver and Spleen
  • 04:56Synthesis of Radiolabeled IRE-containing RNA Probe
  • 05:55Purification of Radiolabeled IRE-containing RNA Probe
  • 07:48Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA)
  • 10:27Results: The Iron-dependence of IRE/IRP Interactions
  • 12:17Conclusion

Summary

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Qui vi presentiamo un protocollo per analizzare le interazioni RNA / proteine. Il saggio spostamento mobilità elettroforetica (EMSA) si basa sulla migrazione differenziale di complessi RNA / proteine ​​e RNA libero durante elettroforesi su gel nativo. Utilizzando una sonda RNA radioattivo, RNA complessi / proteici possono essere visualizzati mediante autoradiografia.

Tags

RNA-protein InteractionsIron Regulatory ProteinsIRP1IRP2Iron Responsive ElementsIREUTRsEMSAGel RetardationBandshift AssayRNA-binding ProteinsProtein-RNA ComplexesPost-transcriptional Regulation

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