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면역학 및 감염병학
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Métodos para aumentar a sensibilidade de alta resolução de derretimento Single Nucleotide Polymorphism Genotipagem em Malária
JoVE 신문
면역학 및 감염병학
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JoVE 신문 면역학 및 감염병학
Methods to Increase the Sensitivity of High Resolution Melting Single Nucleotide Polymorphism Genotyping in Malaria

Métodos para aumentar a sensibilidade de alta resolução de derretimento Single Nucleotide Polymorphism Genotipagem em Malária

DOI:
10.3791/52839-v

•

10:27 min

•

November 10, 2015

•

, , , , , ,
1Department of Organismic and Evolutionary Biology,Harvard University, 2Department of Immunology and Infectious Diseases,Harvard T.H. Chan School of Public Health, 3Faculty of Medicine and Pharmacy,Cheikh Anta Diop University, 4School of Nursing and Health Sciences,Simmons College, 5Institute of Infectious Diseases,Broad Institute

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:58Template Preparation
  • 03:46PCR Amplification
  • 05:37HRM Analysis
  • 08:26Results: Blocked-probe-based and MAAB Increases HRM Genotyping Sensitivity
  • 09:46Conclusion

Summary

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Enquanto a análise de alta resolução de fusão oferece a capacidade de diferenciar entre polimorfismos de nucleotídeo único em uma população heterogênea, viés amplificação alelo mutante pode aumentar a sua capacidade para detectar alelos presentes em percentagens relativamente baixas dentro de uma amostra. Este protocolo descreve melhorias que melhoram a sensibilidade da análise de fusão de alta resolução.

Tags

Keywords: MalariaPlasmodiumSingle-nucleotide Polymorphisms (SNPs)Drug ResistancePopulation SurveillanceHigh-resolution Melting (HRM) AnalysisPolygenomic InfectionsPCR AmplificationMinor AlleleGenotyping Sensitivity

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