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Systembiologie der Stoffwechselregulation von Estrogen Receptor Signaling bei Brustkrebs
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Systems Biology of Metabolic Regulation by Estrogen Receptor Signaling in Breast Cancer
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Systembiologie der Stoffwechselregulation von Estrogen Receptor Signaling bei Brustkrebs

DOI:
10.3791/53832-v

•

10:36 min

•

March 17, 2016

•

,
1Department of Food Sciences and Human Nutrition,University of Illinois, Urbana-Champaign

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:45Preparation of RNA-Seq Samples
  • 02:47Preparation of ChIP-Seq Samples
  • 06:13Metabolomics Assay Sample Collection and Cell Count for Normalization
  • 07:32Results: Metabolic Changes in MCF7 Cells from Estradiol Treatment
  • 09:15Conclusion

Summary

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Integration of data from genome-wide sequencing experiments and metabolomics experiments is a challenge. In this paper we report, for the first time, generation, analysis and integration of transcriptome, cistrome and metabolome data from breast cancer cells treated with estradiol.

Tags

Keywords: Systems BiologyMetabolic RegulationEstrogen Receptor SignalingBreast CancerTranscriptomeSystromeMetabolomeTranscription FactorsMetabolismCell AggressivenessMCF7 CellsRNA IsolationChloroformIsopropanolEthanolDEPC WaterFormaldehydeChromatin Cross-linkingCell Lysis BufferChromatin Fragmentation

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