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Utilizzando RNA-sequenziamento per rilevare Novel Splice varianti correlati alla resistenza ai farmaci in<em> In Vitro</em> modelli di cancro
JoVE 신문
암 연구학
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JoVE 신문 암 연구학
Using RNA-sequencing to Detect Novel Splice Variants Related to Drug Resistance in In Vitro Cancer Models
DOI:

09:58 min

December 09, 2016

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Chapters

  • 00:05Title
  • 01:09Characterization of Drug Resistance Profiles through Cytotoxicity Assays
  • 05:01RNA Isolation and Library Preparation for RNA-sequencing
  • 05:55Validation of the Results by RT-PCR and qRT-PCR Assays
  • 07:21Results: Detection of Differential Splicing Events in Chemotherapy-resistant Cell Lines Compared to Parental Wild-type by Using RNA-sequencing
  • 09:07Conclusion

Summary

자동 번역

Qui si descrive un protocollo volto ad indagare l'impatto di aberrant splicing sulla resistenza ai farmaci nei tumori solidi e le neoplasie ematologiche. A questo scopo, abbiamo analizzato i profili trascrittomica dei modelli genitoriali e resistenti in vitro attraverso RNA-Seq e stabilito un metodo basato qRT-PCR per convalidare geni candidati.

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