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Analisi trascrittomica di<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA Sequencing dati attraverso la suite Tuxedo sul Progetto Galaxy
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Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project
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Analisi trascrittomica di<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA Sequencing dati attraverso la suite Tuxedo sul Progetto Galaxy

DOI:
10.3791/55473-v

•

10:19 min

•

April 08, 2017

•

,
1Department of Pediatrics,University of Pittsburgh School of Medicine, Children’s Hospital of Pittsburgh

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:56Getting Started with Galaxy
  • 03:28Data Analysis with Tuxedo Suite
  • 06:19Gene Ontology (GO) Term Analyses Using DAVID
  • 07:56Results: Transcriptome Dictated by the Transcription Elongation Factor TCER-1, that Extends Lifespan of Germline-less C. elegans
  • 09:39Conclusion

Summary

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Galaxy e David sono emersi come strumenti popolari che permettono ai ricercatori senza formazione bioinformatica per analizzare e interpretare i dati di RNA-Seq. Descriviamo un protocollo per la C. elegans ai ricercatori di effettuare RNA-Seq esperimenti, l'accesso ed elaborare il set di dati utilizzando Galaxy e ottenere informazioni biologiche significative dalle liste di geni con David.

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Keywords: C. ElegansRNA SequencingTranscriptomic AnalysisTuxedo SuiteGalaxy ProjectBioinformaticsDifferential Gene ExpressionGene OntologyNGS RNA AnalysisFASTQData UploadWorkflow

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