Journal
/
유전학
/
Optimalisering og sammenligningsanalyse av organellar DNA-berigelsesmetoder som er egnet for neste generasjons sekvensering
JoVE 신문
유전학
JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다.  전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
JoVE 신문 유전학
Optimization and Comparative Analysis of Plant Organellar DNA Enrichment Methods Suitable for Next-generation Sequencing

Optimalisering og sammenligningsanalyse av organellar DNA-berigelsesmetoder som er egnet for neste generasjons sekvensering

DOI:
10.3791/55528-v

•

12:33 min

•

July 28, 2017

•

, ,
1Cereal Disease Laboratory,United States Department of Agriculture-Agricultural Research Service, 2Department of Horticultural Science,University of Minnesota, 3Department of Plant Pathology,University of Minnesota

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:49Growing Wheat Plants
  • 01:51Organellar DNA Enrichment by Differential Centrifugation (DC)
  • 07:31Organellar DNA Enrichment by Methyl-fractionation (MF)
  • 09:44Results: Both Enrichment Methods Yield Sufficient DNA Highly Enriched for Organellar Sequences and Suitable for NGS
  • 11:33Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Sammenligningen og optimaliseringen av to organellar DNA-anrikningsmetoder presenteres: Tradisjonell differensial sentrifugering og fraksjonering av totalt gDNA basert på metyleringsstatus. Vi vurderer den resulterende DNA-kvantiteten og kvaliteten, demonstrerer ytelse i kortlestende neste generasjons sekvensering, og drøfter potensialet for bruk i langlestende enkeltmolekylesekvensering.

Tags

Keywords: Plant OrganelleDNA EnrichmentNext-generation SequencingDifferential CentrifugationMeta FractionationWheat SeedlingOrganelle IsolationSTE BufferFiltration

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

check_url/kr/55528?article_type=v

Utnyttelse av CyVerse Resources for<em> De Novo</em> Comparative Transcriptomics of Underserved (Non-Model) Organisms
check_url/kr/55528?article_type=v

Vurdering av DNA forurensning i RNA eksempler basert på Ribosomal DNA
check_url/kr/55528?article_type=v

Rensing av High Molecular Weight Genomisk DNA fra meldugg for Long-Les Sekvense
check_url/kr/55528?article_type=v

Robust DNA isolasjon og høy gjennomstrømming sekvensering biblioteket konstruksjon for Herbarium prøver
check_url/kr/55528?article_type=v

Neste generasjons sekvensering og bioinformatikk rørledning for å evaluere genetisk determinanter av konstitusjonelle sykdom
check_url/kr/55528?article_type=v

Sjelden hendelse gjenkjenning feil-korrigert DNA og RNA sekvensering
check_url/kr/55528?article_type=v

Forsterkning av nær full lengde HIV-1-Proviruses for neste generasjons sekvensering
check_url/kr/55528?article_type=v

Høy gjennomstrømming identifikasjon av regulatoriske gensekvenser med neste generasjons sekvensering av runde kromosom konformasjon fange (4C-seq)
check_url/kr/55528?article_type=v

RNA neste generasjons sekvensering og en bioinformatikk rørledning for å identifisere uttrykt linje-1s på det geometriske-spesifikke nivået
check_url/kr/55528?article_type=v

Single-molekylet Förster resonans energi overføring metoder for Real-Time gransking av Holliday Junction oppløsning av GEN1

Read Article