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LERLIC-MS / MS进行深入表征和谷氨酰胺的定量和天冬酰胺脱酰胺在鸟枪蛋白质组学

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생화학

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JoVE 신문 생화학

LERLIC-MS/MS for In-depth Characterization and Quantification of Glutamine and Asparagine Deamidation in Shotgun Proteomics

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LERLIC-MS / MS进行深入表征和谷氨酰胺的定量和天冬酰胺脱酰胺在鸟枪蛋白质组学

DOI:

10.3791/55626-v

•

08:01 min

•

April 09, 2017

•

Xavier Gallart-Palau*¹, Aida Serra*¹, Siu Kwan Sze

¹Division of Structural Biology and Biochemistry, School of Biological Sciences,Nanyang Technological University

Chapters

00:05Title
00:44Long-length Anion-exchange (LAX) Capillary Column Packing
01:43Tissue Sample Preparation
05:33One-dimension Long-length Electrostatic Repulsion-hydrophilic Interaction Chromatography-tandem Mass Spectrometry (LERLIC-MS/MS) Separation and Data Analysis
06:48Results: Separation of Deamidation Isoforms of Glutamine and Asparagine by LERLIC-MS/MS
07:34Conclusion

Summary

자동 번역

这里，我们提出的长条静电排斥亲水相互作用色谱 - 串联质谱（LERLIC-MS / MS）的方法的一个步骤一步协议。这是一种新的方法，使通过鸟枪蛋白质组学的谷氨酰胺和天冬酰胺脱酰胺亚型的第一次定量和定性。

Tags

Keywords: LERLIC-MS/MS Glutamine Deamidation Asparagine Deamidation Shotgun Proteomics Peptide Separation Anion Exchange Chromatography Protein Quantification Dithiothreitol Iodoacetamide

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