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레트로 바이러스 스캐닝 : MLV 통합 사이트 맵핑으로 세포 특정 규제 지역 정의

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Retroviral Scanning: Mapping MLV Integration Sites to Define Cell-specific Regulatory Regions

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레트로 바이러스 스캐닝 : MLV 통합 사이트 맵핑으로 세포 특정 규제 지역 정의

DOI:

10.3791/55919-v

•

10:10 min

•

May 28, 2017

•

Oriana Romano², Ingrid Cifola, Valentina Poletti, Marco Severgnini, Clelia Peano, Gianluca De Bellis, Fulvio Mavilio⁴, Annarita Miccio^2,4,5

¹Center for Genome Research, Department of Life Sciences,University of Modena and Reggio Emilia, ²Laboratory of Chromatin and Gene Regulation During Development,Imagine Institute, ³Institute for Biomedical Technologies,CNR, ⁴Généthon, ⁵Sorbonne Paris Cité – Université Paris Descartes

Chapters

00:05Title
00:45MLV Transduction of Human Cells
01:41Restriction Enzyme Digestion and Linker Ligation
03:05First-round Linker-mediated PCR
03:43Second Round Linker-mediated PCR
05:17Library Preparation and Dilution for Massive Sequencing of MLV Integration Sites
07:53Results: Mapping MLV Integration into Epigenetically-defined Regulatory Regions
09:23Conclusion

Summary

자동 번역

여기, 우리는 인간 세포에서 Moloney 뮤린 백혈병 바이러스 기반의 레트로 바이러스 벡터의 통합 사이트의 게놈 전체 매핑을위한 프로토콜을 설명합니다.

Tags

Keywords: Retroviral Scanning MLV Integration Sites Cell-specific Regulatory Regions Gene Therapy Gene Regulation MLV-derived Retroviral Vector EGFP Reporter Gene Flow Cytometric Analysis Genomic DNA Preparation Restriction Enzyme Digestion Linker Ligation First-round PCR Second-round PCR

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