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생화학

ARNm Interactome Captura de Planta Protoplastos

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JoVE 신문 생화학

mRNA Interactome Capture from Plant Protoplasts

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ARNm Interactome Captura de Planta Protoplastos

DOI:

10.3791/56011-v

•

12:29 min

•

July 28, 2017

•

Zhicheng Zhang, Kurt Boonen, Meixia Li, Koen Geuten

¹Department of Biology,KU Leuven

Chapters

00:05Title
01:15In Vivo mRNA-protein Crosslinking by UV Irradiation
02:38Protoplast Lysis Under Denaturing Conditions
03:59mRNP Pull-down and Purification by Oligo-d(T)₂₅ Beads
08:14mRBP Concentration and Protein Assays
10:04Results: Capture of UV-crosslinked mRNA-bound Proteins by Oligo-d(T)₂₅ Beads
11:53Conclusion

Summary

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Aquí, presentamos un protocolo de captura interactome aplicado a Arabidopsis thaliana protoplastos hoja mesófilo. Este método depende crıticamente de la reticulación UV in vivo y permite el aislamiento e identificación de proteınas de unión a mRNA de plantas desde un entorno fisiológico.

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Complejo de proteínas de captura por afinidad a partir de células de mamífero Cryomilled

Diseño experimental para microdisección láser RNA-Seq: Lecciones de un análisis del desarrollo de la hoja de maíz

Un método de extracción fraccionada simple para el análisis comprensivo de metabolitos, lípidos y proteínas a partir de una sola muestra

Aislamiento y medidas respiratoria de las mitocondrias de Arabidopsis thaliana

Espectrometría de masa de hoja aerosol: Una técnica rápida ionización ambiental evaluar directamente los metabolitos de los tejidos vegetales

Extracción de cafeína, la actividad enzimática y la expresión del gen de la sintasa de cafeína de suspensiones celulares de plantas

Estudiando la importación de la proteína en cloroplastos con protoplastos

Captura e identificación de proteínas de unión a RNA usando Click química asistida por ARN-interactoma capturan (CARIC) estrategia

Uso en transferencia de energía de resonancia de la fluorescencia de Vitro para el estudio de la dinámica de los complejos de la proteína en una escala de tiempo de milisegundos

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Captura e identificación de proteínas de unión a RNA usando Click química asistida por ARN-interactoma capturan (CARIC) estrategia

Uso en transferencia de energía de resonancia de la fluorescencia de Vitro para el estudio de la dinámica de los complejos de la proteína en una escala de tiempo de milisegundos

Flujo de trabajo de espectrometría de masas de inmunoprecipitación sin etiquetas para la generación de perfiles de interactome nuclear a gran escala

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