Journal
/
생화학
/
Dyb proteomet profilering af Isobar mærkning, omfattende væskekromatografi, massespektrometri og Software-assisteret kvantificering
JoVE 신문
생화학
JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다.  전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
JoVE 신문 생화학
Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification

Dyb proteomet profilering af Isobar mærkning, omfattende væskekromatografi, massespektrometri og Software-assisteret kvantificering

DOI:
10.3791/56474-v

•

10:37 min

•

November 15, 2017

•

, , , , , , ,
1St. Jude Proteomics Facility,St. Jude Children’s Research Hospital, 2Departments of Structural Biology and Developmental Neurobiology,St. Jude Children’s Research Hospital, 3Heilongjiang University of Chinese Medicine

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:00Preparation of Cells/Tissues
  • 01:45Protein Extraction, Quality Control Western Blotting, In-solution Digestion, and Peptide Desalting
  • 04:45TMT Labeling of Peptides
  • 05:50Extensive High-resolution, Basic pH LC Prefactionation
  • 06:43LC-MS/MS Preparation and Parameters
  • 07:41Results: Deep Proteome Profiling Analysis
  • 08:45Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Vi præsenterer en protokol for at nøjagtigt kvantificere proteiner med Isobar mærkning, omfattende fraktionering, bioinformatik værktøjer og kvalitetskontrol trin i kombination med væskekromatografi interface til en høj opløsning massespektrometer.

Tags

Keywords: Proteome ProfilingIsobaric LabelingLiquid ChromatographyMass SpectrometryQuantificationProtein IdentificationProtein QuantitationBiomarker DiscoveryCell LysisProtein DigestionAcetonitrileLys-C ProteaseDTTHEPES

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

check_url/kr/56474?article_type=v

Sheathless kapillarelektroforese-massespektrometri for Metabolic profilering biologiske prøver
check_url/kr/56474?article_type=v

Forbedret Prøve Multiplexing af væv under anvendelse kombinerede Precursor isotopmærkning og isobar Tagging (cPILOT)
check_url/kr/56474?article_type=v

Time-løst elektrosprayioniserings Brint-deuterium Exchange-massespektrometri til at studere proteiners struktur og Dynamics
check_url/kr/56474?article_type=v

Løsning affinitetsrensede proteinkomplekser ved Blå Native PAGE og protein Korrelation Profilering
check_url/kr/56474?article_type=v

En Tandem væskekromatografi-massespektrometri-baseret tilgang til Metabolit Analyse af<em> Staphylococcus aureus</em
check_url/kr/56474?article_type=v

Proteom-wide kvantificering af mærkning homogenitet på enkelt-molekyle niveau
check_url/kr/56474?article_type=v

Nitropeptid profilering og identifikation illustreret af angiotensin II
check_url/kr/56474?article_type=v

Absolut kvantificering af celle frit protein syntese metabolisme ved omvendt fase-væskekromatografi-massespektrometri
check_url/kr/56474?article_type=v

Label-fri Immunoprecipitation massespektrometri workflow for storstilet nuklear Interactome profilering
check_url/kr/56474?article_type=v

Kvantitativ analyse af cellulære lipidom af Saccharomyces Cerevisiae Ved hjælp af flydende kromatografi kombineret med tandem massespektrometri

Read Article