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Flusso di lavoro globale per l'identificazione del genoma e la Meta-analisi di espressione della famiglia genica ATL E3 ubiquitina ligasi a Grapevine
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JoVE 신문 생물학
Comprehensive Workflow for the Genome-wide Identification and Expression Meta-analysis of the ATL E3 Ubiquitin Ligase Gene Family in Grapevine
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Flusso di lavoro globale per l'identificazione del genoma e la Meta-analisi di espressione della famiglia genica ATL E3 ubiquitina ligasi a Grapevine

DOI:
10.3791/56626-v

•

10:40 min

•

December 22, 2017

•

, , , , , ,
1Dipartimento di Biotecnologie,Università degli Studi di Verona, 2Ecology and Evolution, Research School of Biology,The Australian National University, 3Dipartimento di Agraria, SACEG,Università degli Studi di Sassari

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:04Identifying Putative Gene Family Members, Making Alignments, and Sequence Logos
  • 03:33Phylogenetic Analysis and Nomenclature
  • 06:51Tissue Expression Meta-analysis
  • 08:27Results: Identified ATL Gene Family Members in the Grapevine Genome
  • 09:52Conclusion

Summary

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Questo articolo descrive la procedura per l'identificazione e la caratterizzazione di una famiglia di geni a grapevine applicato alla famiglia di Arabidopsis Tóxicos in Levadura (ATL) E3 ubiquitina ligasi.

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Keywords: Genome-wide IdentificationExpression Meta-analysisATL E3 Ubiquitin Ligase Gene FamilyGrapevineGene StructureProtein MotifsChromosomal LocationGene DuplicationsExpression PatternsGene Family CharacterizationProtein BLASTPSI-BLASTFASTABioinformatics Software

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