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In tempo reale analisi del fattore di trascrizione associazione, trascrizione, traduzione e fatturato per visualizzare eventi globali durante l'attivazione cellulare
JoVE 신문
유전학
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JoVE 신문 유전학
Real-time Analysis of Transcription Factor Binding, Transcription, Translation, and Turnover to Display Global Events During Cellular Activation
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In tempo reale analisi del fattore di trascrizione associazione, trascrizione, traduzione e fatturato per visualizzare eventi globali durante l'attivazione cellulare

DOI:
10.3791/56752-v

•

12:54 min

•

March 07, 2018

•

, , ,
1Institute for Diabetes and Obesity (IDO), German Center for Diabetes Research (DZD),Helmholtz Zentrum München, 2Institute for Informatics,Ludwig-Maximilians-Universität München, 3Roche Pharma Research and Early Development, Large Molecule Research,Roche Innovation Center Penzberg

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:46Profiling Recently Transcribed RNA
  • 03:52Profiling RNA in the Process of Translation
  • 08:01Profiling Transcription Factor Binding
  • 10:35Results: Quality Control Tests
  • 12:05Conclusion

Summary

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Questo protocollo descrive l'uso combinatoria di ChIP-seq, 4sU-seq, totale RNA-seq e profilatura per linee cellulari e cellule primarie del ribosoma. Esso consente di tenere traccia delle modifiche in fattore di trascrizione binding, trascrizione de novo , elaborazione di RNA, fatturato e traduzione nel corso del tempo e la visualizzazione il corso generale degli eventi in cellule attivate e/o cambiare rapidamente.

Tags

Keywords: Real-time AnalysisTranscription Factor BindingTranscriptionTranslationTurnoverCellular ActivationRNA RegulationDNA RegulationMolecular MechanismsImmune ResponseDrug Treatment4sU LabelingNewly Transcribed RNABiotinylationStreptavidin Beads

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