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Análisis en tiempo real del Factor de transcripción vinculante, transcripción, traducción y rotación para mostrar los eventos globales durante la activación celular
JoVE 신문
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Real-time Analysis of Transcription Factor Binding, Transcription, Translation, and Turnover to Display Global Events During Cellular Activation
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Análisis en tiempo real del Factor de transcripción vinculante, transcripción, traducción y rotación para mostrar los eventos globales durante la activación celular

DOI:
10.3791/56752-v

•

12:54 min

•

March 07, 2018

•

, , ,
1Institute for Diabetes and Obesity (IDO), German Center for Diabetes Research (DZD),Helmholtz Zentrum München, 2Institute for Informatics,Ludwig-Maximilians-Universität München, 3Roche Pharma Research and Early Development, Large Molecule Research,Roche Innovation Center Penzberg

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:46Profiling Recently Transcribed RNA
  • 03:52Profiling RNA in the Process of Translation
  • 08:01Profiling Transcription Factor Binding
  • 10:35Results: Quality Control Tests
  • 12:05Conclusion

Summary

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Este protocolo describe el uso combinatorio de ChIP-seq, 4sU-seq, total RNA-seq y perfiles para las líneas celulares y células primarias del ribosoma. Permite el seguimiento de cambios en el factor de transcripción vinculante, novo de transcripción, procesamiento de RNA, rotación y traducción con el tiempo y viendo el curso general de los acontecimientos en las células activadas o cambiantes.

Tags

Real-time AnalysisTranscription Factor BindingTranscriptionTranslationTurnoverCellular ActivationRNA RegulationDNA RegulationMolecular MechanismsImmune ResponseDrug Treatment4sU LabelingNewly Transcribed RNABiotinylationStreptavidin Beads

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