مصانع النسخي الفيروسية هي هياكل منفصلة يتم إثراء الخلوية رنا بوليميراز الثاني لزيادة النسخ المورثات الفيروسية أثناء تنشيط. هنا، يتم وصف طريقة لتحديد المواقع لتدوين الكروماتين الفيروسية في الفضاء ثلاثي الأبعاد النووية بنشاط بمزيج من الفلورة التهجين الحمض النووي الريبي تلطيخ و في الموقع .