/

/

Guidade protokoll för fekal mikrobiell karakterisering av 16S rRNA-amplikon sekvensering

JoVE 신문
생물학

JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다. 전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.

JoVE 신문 생물학

Guided Protocol for Fecal Microbial Characterization by 16S rRNA-Amplicon Sequencing

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Guidade protokoll för fekal mikrobiell karakterisering av 16S rRNA-amplikon sekvensering

DOI:

10.3791/56845-v

•

08:05 min

•

March 19, 2018

•

Ayelet Di Segni, Tzipi Braun, Marina BenShoshan, Sarit Farage Barhom, Efrat Glick Saar, Karen Cesarkas, James E. Squires, Nathan Keller³, Yael Haberman⁴

¹Sheba Medical Center, ²Children’s Hospital of Pittsburgh of UPMC, ³Ariel University, ⁴Cincinnati Children’s Hospital Medical Center

Chapters

00:04Title
00:59Sample Handling and DNA Extraction
02:12PCR and Library Preparation
05:30Results: 16S RNA-Seq of Prepared Libraries
07:19Conclusion

Summary

자동 번역

Detta manuskript beskriver en detaljerad standardiserade protokollet av hög genomströmning 16S rRNA-amplikon sekvensering. Protokollet införs ett integrerat, uniformerad, genomförbart och billig protokoll från fekal provtagning genom dataanalyser. Detta protokoll möjliggör analys av stora mängder prover med stränga normer och flera kontroller.

Tags

16S RRNA-Amplicon Sequencing Fecal Microbiome Microbial Composition Aerobic And Anaerobic Communities High-throughput Fecal Sample Processing DNA Extraction PCR Primer Design 96-well Plate Setup Triplicate Reactions PCR Master Mix

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

Pyrosequencing för Mikrobiell identifiering och karakterisering

Nästa generations sekvensering av 16S ribosom RNA Gene amplicons

Riktade DNA-metylering analys av Nästa generations sekvense

Isolering av specifika genomregioner och Identifiering av associerade molekyler av enChIP

Fekal Glukokortikoid Analys: Icke-invasiv Adrenal Övervakning av equids

Effektiv Nucleic Acid Extraction och 16S rRNA gensekvenser för bakteriell Community karakterisering

Ett protokoll för funktionell bedömning av hela proteinmutagenes bibliotek Använda hög genomströmning sekvensering

Interactome-Seq: Ett protokoll för Domainome bibliotek konstruktion, validering och urval av Phage Display och nästa generations sekvensering

Tickande mikrobiomet karakterisering av nästa generations 16S rRNA amplikon sekvensering

Microbiota analys med två steg PCR och nästa generations 16S rRNA Gene sekvensering

Read Article