On-Site Molecular Detection of Soil-Borne Phytopathogens Using a Portable Real-Time PCR System

Joseph B. DeShields; Rachel A. Bomberger; James W. Woodhall; David L. Wheeler; Natalia Moroz; Dennis A. Johnson; Kiwamu Tanaka

doi:10.3791/56891

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Sur le site Molecular Detection of phytopathogènes transmises par le sol à l’aide d’un système PCR en temps réel Portable

JoVE 신문
환경과학
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JoVE 신문 환경과학

On-Site Molecular Detection of Soil-Borne Phytopathogens Using a Portable Real-Time PCR System

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Sur le site Molecular Detection of phytopathogènes transmises par le sol à l’aide d’un système PCR en temps réel Portable

DOI:

10.3791/56891-v

•

14:15 min

•

February 23, 2018

•

Joseph B. DeShields, Rachel A. Bomberger, James W. Woodhall, David L. Wheeler, Natalia Moroz, Dennis A. Johnson, Kiwamu Tanaka

¹Department of Plant Pathology,Washington State University, ²Parma Research and Extension Center,University of Idaho

Chapters

00:00Title
01:06Magnetic bead-based DNA extraction
02:06Soil lysis
11:44Representative Results
13:24Discussion
13:40Conclusion

Summary

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Détection rapide et précise des agents pathogènes sur place, en particulier terricole phytopathogènes, est cruciale pour prévenir d’autres production d’inoculum et la prolifération des maladies des plantes sur le terrain. La méthode développée ici en utilisant un système de détection de PCR en temps réel portable permet un diagnostic sur place dans des conditions réelles.

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ARN-ADN Extraction simultanée de sédiments côtiers et Quantification de 16S ARNr et Transcriptions par PCR en temps réel

Mesure et cartographie des schémas d’érosion et de dépôt liées aux Concentrations de Carbonate du sol sous gestion agricole

Spécifique et une détection précise de Using PCR classique sur des échantillons de tissus foliaires agrumes Citrus Greening pathogène Candidatus liberibacter spp.

Autoportant montage électrochimique pour enrichir les bactéries Anode-respirants sur place

Mesure des Stolons et Rhizomes de Turfgrasses à l’aide d’un système d’analyse des images numériques

Détection des virus de bioaérosols à l’aide de résine échangeuse d’anions

Un système précis et autonome pour la détection des patrons d’émergence insectes

Détection des 3-Nitrotyrosine dans des environnements atmosphérique via une haute performance système détecteur électrochimique-chromatographie en phase liquide

Sur le site Molecular Detection of phytopathogènes transmises par le sol à l’aide d’un système PCR en temps réel Portable

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Mesure des Stolons et Rhizomes de Turfgrasses à l’aide d’un système d’analyse des images numériques

Détection des virus de bioaérosols à l’aide de résine échangeuse d’anions

Un système précis et autonome pour la détection des patrons d’émergence insectes

Détection des 3-Nitrotyrosine dans des environnements atmosphérique via une haute performance système détecteur électrochimique-chromatographie en phase liquide

Détection de Tilapia lac Virus à l’aide de RT-PCR classique et SYBR Green RT-qPCR

Une nouveau Portable In Vitro exposition Cassette pour l’échantillonnage des aérosols

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