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Gel-seq : PROCEDE de Preparation de bibliothèque simultanée de séquençage de l’ADN et l’ARN à l’aide de Matrices d’Hydrogel

JoVE 신문
생체공학

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JoVE 신문 생체공학

Gel-seq: A Method for Simultaneous Sequencing Library Preparation of DNA and RNA Using Hydrogel Matrices

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Gel-seq : PROCEDE de Preparation de bibliothèque simultanée de séquençage de l’ADN et l’ARN à l’aide de Matrices d’Hydrogel

DOI:

10.3791/57315-v

•

09:19 min

•

March 26, 2018

•

Gordon D. Hoople*¹, Andrew Richards*², Yan Wu, Albert P. Pisano, Kun Zhang

¹Department of Engineering,University of San Diego, ²Department of Bioengineering,University of California, San Diego, ³Department of Mechanical and Aerospace Engineering,University of California, San Diego

Chapters

00:04Title
00:42Gel-seq Cassette Fabrication
03:12Gel Separation
04:36Sample Recovery
06:53Results: Gel-seq Compared with Conventional Methods
08:26Conclusion

Summary

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Gel-seq permet aux chercheurs de préparer simultanément les bibliothèques pour les deux ADN - et RNA-seq au surcoût négligeable à partir de 100-1000 cellules à l’aide d’un dispositif simple hydrogel. Cet article présente une approche détaillée pour la fabrication de l’appareil ainsi que le protocole biologiques pour générer des bibliothèques appariés.

Tags

Keywords: Gel-seq Simultaneous Sequencing DNA And RNA Hydrogel Matrices Next-generation Sequencing Genomic And Transcriptomic Information Filler Gel High Density Gel Low Density Gel Gel Electrophoresis Cassette Polymer Curing

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