Här beskriver vi ett protokoll för att visualisera motorneuronen projektion och axon arborization i transgena Hb9::GFP musembryon. Efter immunfärgning för motoriska nervceller använde vi ljus ark fluorescensmikroskopi bild embryon för efterföljande kvantitativ analys. Detta protokoll är tillämpligt till andra neuron navigering processer i det centrala nervsystemet.