Identifying Transcription Factor Olig2 Genomic Binding Sites in Acutely Purified PDGFR&#945;+ Cells by Low-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Analysis

Xiaomin Dong; Raquel Cuevas-Diaz Duran; Yanan You; Jia Qian Wu

doi:10.3791/57547

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Identification des Sites de facteur de Transcription Olig2 génomique fixation aiguë purifiée cellules PDGFRα + par immunoprécipitation de la chromatine Low-cellule analyse de séquençage

JoVE 신문
신경과학

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JoVE 신문 신경과학

Identifying Transcription Factor Olig2 Genomic Binding Sites in Acutely Purified PDGFRα+ Cells by Low-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Analysis

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Identification des Sites de facteur de Transcription Olig2 génomique fixation aiguë purifiée cellules PDGFRα + par immunoprécipitation de la chromatine Low-cellule analyse de séquençage

DOI:

10.3791/57547-v

•

12:29 min

•

April 16, 2018

•

Xiaomin Dong, Raquel Cuevas-Diaz Duran, Yanan You, Jia Qian Wu

¹The Vivian L. Smith Department of Neurosurgery, Center for Stem Cell and Regenerative Medicine,University of Texas Health Science Center

Chapters

00:04Title
01:10Purification of PDGFRα Positive Oligodendrocyte Lineage Cells from Mouse
05:03Low-cell ChIP Preparation and ChIP Library Construction for High-throughput Sequencing
09:41Results: Use of ChIP Analysis to Study Genome-wide Binding of the Olig2 in OPCs
11:42Conclusion

Summary

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Nous présentons ici un protocole qui vise à analyser la liaison pangénomique du facteur de transcription oligodendrocyte 2 (Olig2) dans cerveau parfaitement purifiée précurseur oligodendrocytes (OPCs) en effectuant l’immunoprécipitation de la chromatine basse-cellule (ChIP) , préparation de bibliothèque, séquençage haut-débit et des analyses de données bioinformatiques.

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La transfection des cellules ganglionnaires de la rétine de la souris par In vivo L'électroporation

Imagerie des cellules vivantes des cellules sensorielles de précurseurs d'organes en Intact Drosophile Les chrysalides

Immunoprécipitation de la chromatine du tissu racinaire ganglions dorsaux suivants lésions axonales

Détection de la palmitoylation des protéines dans les neurones de l'hippocampe en culture par immunoprécipitation et Acyl-biotine Exchange (ABE)

Identifier les motoneurones extracellulaire d'un Motor Pool musculaire dans<em> Aplysia californica</em

Injection intracérébroventriculaire de Peptides amyloïde-ß chez les souris normales à Provoquer Pleinement Déficits cognitifs de type Alzheimer

Évaluation de l’homéostasie des dopaminergiques chez les souris par l’utilisation de l’analyse de chromatographie liquide à haute performance et l’absorption de la Dopamine

Isolement et culture des progéniteurs neurones suivie par immunoprécipitation de la chromatine de marque d’Histone 3 Lysine 79 MBD

Isolement des noyaux d’adultes de la moelle épinière pour séquençage massivement parallèle ARN simple-noyau

Séquençage de l’ARN des cellules individuelles des neurones de souris fluorescent étiquetés à l’aide de tri manuel et Double Transcription In Vitro de chefs absolus séquençage (DIVA-Seq)

Identification des Sites de facteur de Transcription Olig2 génomique fixation aiguë purifiée cellules PDGFRα + par immunoprécipitation de la chromatine Low-cellule analyse de séquençage

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Imagerie des cellules vivantes des cellules sensorielles de précurseurs d'organes en Intact Drosophile Les chrysalides

Immunoprécipitation de la chromatine du tissu racinaire ganglions dorsaux suivants lésions axonales

Détection de la palmitoylation des protéines dans les neurones de l'hippocampe en culture par immunoprécipitation et Acyl-biotine Exchange (ABE)

Identifier les motoneurones extracellulaire d'un Motor Pool musculaire dans<em> Aplysia californica</em

Injection intracérébroventriculaire de Peptides amyloïde-ß chez les souris normales à Provoquer Pleinement Déficits cognitifs de type Alzheimer

Évaluation de l’homéostasie des dopaminergiques chez les souris par l’utilisation de l’analyse de chromatographie liquide à haute performance et l’absorption de la Dopamine

Isolement et culture des progéniteurs neurones suivie par immunoprécipitation de la chromatine de marque d’Histone 3 Lysine 79 MBD

Isolement des noyaux d’adultes de la moelle épinière pour séquençage massivement parallèle ARN simple-noyau

Séquençage de l’ARN des cellules individuelles des neurones de souris fluorescent étiquetés à l’aide de tri manuel et Double Transcription In Vitro de chefs absolus séquençage (DIVA-Seq)

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