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Identifizierung von Transkription Faktor Olig2 genomische Bindungsstellen in akut PDGFRα + Zellen durch Low-Zelle Chromatin Immunopräzipitation Sequenzierung Analyse gereinigt
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Identifying Transcription Factor Olig2 Genomic Binding Sites in Acutely Purified PDGFRα+ Cells by Low-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Analysis
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Identifizierung von Transkription Faktor Olig2 genomische Bindungsstellen in akut PDGFRα + Zellen durch Low-Zelle Chromatin Immunopräzipitation Sequenzierung Analyse gereinigt

DOI:
10.3791/57547-v

•

12:29 min

•

April 16, 2018

•

, , ,
1The Vivian L. Smith Department of Neurosurgery, Center for Stem Cell and Regenerative Medicine,University of Texas Health Science Center

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:10Purification of PDGFRα Positive Oligodendrocyte Lineage Cells from Mouse
  • 05:03Low-cell ChIP Preparation and ChIP Library Construction for High-throughput Sequencing
  • 09:41Results: Use of ChIP Analysis to Study Genome-wide Binding of the Olig2 in OPCs
  • 11:42Conclusion

Summary

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Hier präsentieren wir ein Protokoll, das entwickelt ist, um die genomweite Bindung des Transkriptionsfaktors Oligodendrozyt 2 (Olig2) in akut gereinigte Brain Oligodendrozyt Vorläuferzellen (OPCs) analysieren durch Ausführen von niedrig-Zelle Chromatin Immunopräzipitation (ChIP) , Bibliothek-Vorbereitung, Hochdurchsatz-Sequenzierung und bioinformatische Analyse der Daten.

Tags

Transcription Factor Olig2PDGFR-α+ CellsChIP-seqLow-cell ChIP-seqOligodendrocyte Precursor CellsImmunopanningGenome-wide Transcriptional RegulationEpigenetic MechanismsCell DifferentiationCell Development

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