Identifying Transcription Factor Olig2 Genomic Binding Sites in Acutely Purified PDGFR&#945;+ Cells by Low-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Analysis

Xiaomin Dong; Raquel Cuevas-Diaz Duran; Yanan You; Jia Qian Wu

doi:10.3791/57547

/

Identificação de Sítios de Ligação Genômica do Fator de Transcrição Olig2 em Células PDGFRα+ Purificadas por Análise de Sequenciamento de Imunoprecipitação de Cromatina de Poucas Células

JoVE 신문
신경과학

JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다. 전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.

JoVE 신문 신경과학

Identifying Transcription Factor Olig2 Genomic Binding Sites in Acutely Purified PDGFRα+ Cells by Low-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Analysis

Identificação de Sítios de Ligação Genômica do Fator de Transcrição Olig2 em Células PDGFRα+ Purificadas por Análise de Sequenciamento de Imunoprecipitação de Cromatina de Poucas Células

DOI:

10.3791/57547-v

•

12:29 min

•

April 16, 2018

•

Xiaomin Dong, Raquel Cuevas-Diaz Duran, Yanan You, Jia Qian Wu

¹The Vivian L. Smith Department of Neurosurgery, Center for Stem Cell and Regenerative Medicine,University of Texas Health Science Center

Chapters

00:04Title
01:10Purification of PDGFRα Positive Oligodendrocyte Lineage Cells from Mouse
05:03Low-cell ChIP Preparation and ChIP Library Construction for High-throughput Sequencing
09:41Results: Use of ChIP Analysis to Study Genome-wide Binding of the Olig2 in OPCs
11:42Conclusion

Summary

자동 번역

Aqui nós apresentamos um protocolo que visa analisar todo o genoma ligação do factor de transcrição do oligodendrocyte 2 (Olig2) em agudamente purificada oligodendrocyte precursor as células do cérebro (OPCs) através da realização de imunoprecipitação da cromatina de baixo-celular (ChIP) , preparação de biblioteca, elevado-throughput sequenciamento e análise de dados de bioinformatic.

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Transfecção de células de camundongo por Ganglionares da Retina In vivo Eletroporação

Em células vivas, imagens de células precursoras de órgãos sensoriais na Intact Drosophila As pupas

Cromatina imunoprecipitação de Tissue Dorsal Root Gânglios seguintes Lesão Axonal

Detecção de palmitoylation proteína em neurônios cultivados por imunoprecipitação e Acil-Biotina Exchange (ABE)

Extracelularmente Identificar os neurônios motores de um pool do motor muscular em<em> Aplysia californica</em

Injeção intracerebroventricular de peptídeos amilóide-beta em ratos normais para induzir Acutely déficits cognitivos Alzheimer-like

Avaliação da homeostase Dopaminergic em camundongos pelo uso de análise de cromatografia líquida de alta performance e captação da dopamina Synaptosomal

Isolamento e cultivo de progenitores neurais seguido de imunoprecipitação de cromatina da marcação de dimetilação da lisina 9 da histona 3

Isolamento dos núcleos de adultos da medula espinhal para a sequenciação do ARN de Single-núcleo maciçamente paralelo

Sequenciação do ARN de célula única de neurônios fluorescente etiquetadas do Mouse usando a classificação Manual e duplo In Vitro a transcrição com contagens absolutas sequenciamento (DIVA-Seq)

Identificação de Sítios de Ligação Genômica do Fator de Transcrição Olig2 em Células PDGFRα+ Purificadas por Análise de Sequenciamento de Imunoprecipitação de Cromatina de Poucas Células

•

•

•

Chapters

Summary

자동 번역

Tags

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

Transfecção de células de camundongo por Ganglionares da Retina In vivo Eletroporação

Em células vivas, imagens de células precursoras de órgãos sensoriais na Intact Drosophila As pupas

Cromatina imunoprecipitação de Tissue Dorsal Root Gânglios seguintes Lesão Axonal

Detecção de palmitoylation proteína em neurônios cultivados por imunoprecipitação e Acil-Biotina Exchange (ABE)

Extracelularmente Identificar os neurônios motores de um pool do motor muscular em<em> Aplysia californica</em

Injeção intracerebroventricular de peptídeos amilóide-beta em ratos normais para induzir Acutely déficits cognitivos Alzheimer-like

Avaliação da homeostase Dopaminergic em camundongos pelo uso de análise de cromatografia líquida de alta performance e captação da dopamina Synaptosomal

Isolamento e cultivo de progenitores neurais seguido de imunoprecipitação de cromatina da marcação de dimetilação da lisina 9 da histona 3

Isolamento dos núcleos de adultos da medula espinhal para a sequenciação do ARN de Single-núcleo maciçamente paralelo

Sequenciação do ARN de célula única de neurônios fluorescente etiquetadas do Mouse usando a classificação Manual e duplo In Vitro a transcrição com contagens absolutas sequenciamento (DIVA-Seq)

Read Article