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探索ルートマイクロバイ: 土、根、およびルート Endosphere から細菌群集のデータを抽出

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Exploring the Root Microbiome: Extracting Bacterial Community Data from the Soil, Rhizosphere, and Root Endosphere

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探索ルートマイクロバイ: 土、根、およびルート Endosphere から細菌群集のデータを抽出

DOI:

10.3791/57561-v

•

09:55 min

•

May 02, 2018

•

Tuesday Simmons, Daniel F. Caddell, Siwen Deng, Devin Coleman-Derr²

¹Department of Plant and Microbial Biology,University of California, Berkeley, ²Plant Gene Expression Center,USDA ARS

Chapters

00:05Title
00:46Collection and Separation of Root Endosphere, Rhizosphere, and Soil Samples
02:47DNA Extraction
04:11Amplicon Library Preparation and Submission
08:21Results: Effective DNA Amplification
09:10Conclusion

Summary

자동 번역

ここでは、土壌、根圏、ルート endosphere 内細菌叢解析・増幅シーケンスデータを取得するためのプロトコルについて述べる。この情報は、組成やプラント関連の微生物群集の多様性を調査するため、植物種の広い範囲での使用に適しています。

Tags

Root Microbiome Soil Rhizosphere Root Endosphere 16S Ribosomal RNA Gene Community Profiling Microbial Ecology DNA Extraction Sequencing Library Soil Core Rhizosphere Separation Root Washing DNA Extraction

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